质粒的提取
Ⅲ、质粒的琼脂糖凝胶电泳
琼脂糖凝胶的制备及电泳 1,量筒量取100 ml TAE,倒入容积为250 ml 的三角烧瓶 2,电子天平称取1g 琼脂糖,倒入三角烧瓶 3,摇匀后放入微波炉加热至沸腾2-3次 4,室温放置至不烫手为止,加入溴化乙锭(EB,有毒性,请 带手套),摇匀后,倒入制胶槽(事先插上梳子),冷却至 胶完全凝固(约15-30分钟)。
分子细胞遗传学实验
1.严格遵守实验室安全管理制度 2.严格按照实验要求进行实验 3.实验分组5人一组,可以自由组合
考试成绩
平时成绩, 考勤和课堂表现, 50% 实验及实验报告, 50%
实验报告评分细则 实验原理 10分 实验目的 5分 仪器材料和试剂 10分 实验步骤 20分 实验结果与分析 45分 (其中,实验结果20分, 结果分析25分) 心得体会 10分
三、实验器材与试剂
1.仪器:恒温培养箱,恒温摇床,台式离心机,高压灭菌锅。 2.材料:含质粒的大肠杆菌,1.5mL 离心管,吸头,移液器。 3.试剂:质粒小量制备试剂盒(质粒DNA小量提取试剂盒, 天根公司) 常用碱法提取质粒的溶液的参考配方: Solution I 50mmo1/L 葡萄糖; 25mmo1/L Tris•HCl(pH8.0); 10 mmo1/L 乙二胺四乙酸; EDTA)pH8.0
当加入pH4.8的乙酸钾高盐缓冲液恢复pH至中性时, 共价闭合环状的质粒DNA的两条互补链仍保持在一起,因此复性 迅速而准确, 线性的染色体DNA的两条互补链彼此已完全分开,复性就不会那 么迅速而准确,它们缠绕形成网状结构,通过离心,染色体DNA 与不稳定的大分子RNA,蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来而 被除去。
6. 将上一步收集的上清液用移液器转移到吸附柱CP3 中 (吸附柱放入收集 管中),注意尽量不要吸出沉淀。10,000 rpm 离心30-60 秒,倒掉收集 管中的废液,将吸附柱CP3 放入收集管中。
8. 向吸附柱CP3 中加入600 μL漂洗液PW ,10,000 rpm离心60 秒,倒掉收集管 中的废液,将吸附柱CP3放入收集管中。 9. 向吸附柱CP3 中加入500 μL 漂洗液PW,10,000 rpm 离心60秒,倒掉收集管中 的废液。
Solution II 0.4mo1/LNa0H,2%SDS(十二烷基硫酸钠),使用前等体积混合
Solution III 5mo1/L 乙酸钾 60mL; 冰乙酸 11.5mL; 灭菌水 28.5mL TE缓冲液 10mmo1/L Tris•HCl; 1mmo1/L EDTA(pH8.0); RNA酶(RNA酶A) Tris•HCl(pH7.5)、15mmo1/L NaCl中,配成10 mg/mL的浓度,于100℃加热15min, 缓 慢冷却至室温,保存于-20℃。 70%乙醇(放-20℃冰箱中,用后即放回)
10. 将吸附柱CP3 放入收集管中, 12,000 rpm (~13,400×g) 离心2 分钟,将吸附柱 中残余的漂洗液去除干净。
11. 将吸附柱CP3 置于一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位滴加50μL ddH2O (或洗脱缓冲液EB),室温放置 6 分钟,12,000 rpm (~13,400×g) 离心 1 分钟将质粒溶液收集到离心管中。 12、离心管中收集的就是洗脱下来的质粒DNA
5. 拔掉梳子,将胶放入电泳槽内(保证电泳缓冲 液足够淹没过胶面) 6. 将15uL 质粒洗脱液与3uL的DNA上样缓冲液 (使DNA沉降至点样孔内+电泳指示剂)混合, 加于1% Agarose 做凝胶电泳分析,检测其纯 度和目测定量。
如果质粒质量较好,则剩余质粒-20℃保存备用。 可用于原位杂交探针标记。
四、实验步骤
I 培养细菌(已完成)
II 收集和裂解细菌
III
纯化质粒DNA
正式实验前,请学习移液枪的使用
1. 柱平衡步骤:加入500μ L 的平衡液BL,12,000 rpm (~13,400×g ) 离 心1 分钟。倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。 2. 取1-5 mL(3mL)过夜培养的菌液,10,000 rpm 离心1 分钟,尽量吸除 上清(菌液较多时可以通过多次离心将菌体沉淀收集到一个离心管中)。 3. 向留有菌体沉淀的离心管中加入250 μ L 溶液P1,使用移液器或涡旋振 荡器彻底悬浮细菌沉淀。 4. 向离心管中加入250 μ L 溶液P2,温和地上下翻转6-8 次使菌体充分裂 解。 5. 向离心管中加入350 μ L溶液P3,立即温和地上下翻转6–8 次,充分混 匀,此时将出现白色絮状沉淀。10,000 rpm离心10 分钟。
Hale Waihona Puke 实验一、质粒DNA的提取一、实验目的
二、实验原理 三、实验器材与试剂 四、实验步骤
一、实验目的
学习和掌握试利用试剂盒碱裂解法提取质粒用于原 位杂交探针的标记
二、实验原理
碱裂解法提取质粒是根据共价闭合环状质粒DNA与线性 染色体DNA在拓扑学上的差异来分离它们。 在pH值介于12.0-12.5范围内 线性的DNA双螺旋结构解开而被变性 共价闭环质粒DNA的氢键会断裂,但两条互补链彼此 相互盘绕,仍会紧密地结合在一起。