生物信息学概论复习题
一、名词解释：
1.合成生物学
2.蛋白质组学
3.相似性，同一性，同源性
4.直系同源基因，旁系同源基因
5.序列比对
6.生物信息学
7.多序列比对
8.打分矩阵
9.蛋白质同源建模
10.分子钟
11.虚拟细胞
12.蛋白质结构比对
13.EST
14.contig
15.unigene
16.Entrez
17.一级数据库
18.二级数据库
19.系统发育
20.BLAST
21.外类群
22.有根树
23.系统生物学
24.比较蛋白质组学
二、简述题：
1.常用的序列比对软件有哪些？
2.序列比对有哪些用途?
3.蛋白质结构比对？
4.系统生物学与分子生物学的差异和联系？
5.分子进化的中性学说？
6.GO数据库的内容及用途？
7.KEGG数据库的内容及用途？
8.蛋白质组与基因组的差别？
9.蛋白质组的研究内容？
10.列举分离鉴定蛋白质技术有哪些？
11.基因组外显子的组成特征有哪些？
12.NCBI Blast程序有哪些子程序？有何区别？
13.蛋白质数据库有哪些？各自特点是什么？
14.列举可以通过NCBI进行的生物信息学分析。

15.设计引物要遵循哪些原则？
16.知道某蛋白的氨基酸序列后，如何进行各级结构的生物信息学分析？
17.系统发育树的构建步骤是什么？
18.蛋白质有哪些结构层次，如何定义？
19.蛋白质组的特点？
20.双向电泳及其工作原理？
21.构建系统树的主要方法？
22.主要的生物信息数据库有哪些？
三、论述题
1.构建进化树有几种方法？如何选择？
2.第二代测序技术与第一代测序技术相比有什么异同？优势是什么？
3.什么EST序列？得到EST数据后，如何进行生物信息学分析?。