分子生物学复习题（11整理版）一．名解1.*Supercoil (超螺旋)：DNA双螺旋本身进一步盘绕称超螺旋。

超螺旋有正超螺旋和负超螺旋两种，负超螺旋的存在对于转录和复制都是必要的。

2.positive supercoiling（正超螺旋）：按DNA双螺旋相同方向缠绕而成的超螺旋称为正超螺旋。

3.negative supercoiling（负超螺旋）：按DNA双螺旋相反方向缠绕而成的超螺旋称为负超螺旋。

因为生物界仅发现负超螺旋的存在，推测负超螺旋有利于DNA的表达。

4.Palindrome（回文序列）：在同一条DNA单链上，存在两段实质上相同，但序列颠倒并且二者碱基能形成互补的序列，这两段序列很容易就会根据碱基互补原则，互相吸引、配对，从而使得这条单链回折形成互补的双链结构。

5.domain（结构域）：分子量大的蛋白质三级结构常可划分为一个或数个球状或纤维状的区域，折叠较为紧密，各行使其功能，称为结构域。

6.Motif（基序）：一般指构成任何一种特征序列的基本结构。

作为蛋白质结构域中的亚单元,其功能是体现结构域的多种生物学作用。

7.protein family（蛋白质家族）：指结构相似，功能相关的一组蛋白质。

通常一个蛋白质家族由同一个基因家族内的基因编码8.microRNA/miRNA（微RNA）：内源性的非编码RNA分子。

这些小的miRNA和蛋白质形成复合体时具有各种调节功能，在动物中，miRNA可以通过和mRNA不翻译区域互补结合（不需要完全互补）来抑制蛋白质翻译。

9.*the ubiquitin-mediated pathway （泛素化途径）：泛素间隔或连续地附着到被降解的蛋白质赖氨酸残基上，这一过程称为蛋白质泛素化。

泛素：一个由76个氨基酸组成的高度保守的多肽链，因其广泛分布于各类细胞中而得名。

泛素能共价地结合于底物蛋白质的赖氨酸残基，被泛素标记的蛋白质将被特异性地识别并迅速降解，泛素的这种标记作用是非底物特异性的。

泛素依赖的蛋白选择性降解过程：①泛素活化酶（E1)与泛素结合，活化泛素。

② E1-泛素随后与泛素携带蛋白（E2)结合,成为E2-泛素，E1被置换。

③ E2-泛素在泛素蛋白连接酶（E3）作用下与目标蛋白连接。

这样多个泛素结合上目标蛋白后，目标蛋白即被标记，随后被proteosome（蛋白酶体）降解。

这个过程需要ATP提供能量。

10.open reading frame(ORF) (开放阅读框):指一组连续的含有三联密码子的能被翻译成多肽链的DNA序列。

它由起始密码子开始，到终止密码子结束。

11.satellite DNA （卫星DNA）：又称随体DNA。

真核基因中的高度重复序列，其碱基组成与主体DNA有较大的差异，因而可用密度梯度沉降技术，如氯化铯梯度离心，将它与主体DNA分离。

因为不具有启动子，所以一般不转录。

12.Human Genome Project(HGP) （人类基因组计划：）这一计划旨在为30多亿个碱基对构成的人类基因组精确测序，发现所有人类基因并搞清其在染色体上的位置，破译人类全部遗传信息。

13.*Promoter（启动子）：启动子是RNA聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA序列，它含有RNA聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列位点。

启动子的作用：在基因表达的调控中，转录的起始是关键，常常某个基因是否应当表达决定于在特定的启动子起始过程。

启动子是确保转录精确而有效起始DNA序列。

14.Spliceosome（剪接体）：Spliceosome（剪接体）：在剪接过程中形成的剪接复合物称为剪接体。

剪接体的主要组成是蛋白质和小分子的核内小RNA(snRNA)，负责所有编码蛋白的mRNA的剪接。

15.alternative splicing（选择性剪接）：也叫可发变剪接或变位剪接，指一个基因的转录产物在不同的发育阶段、分化细胞和生理状态下，通过不同的拼接方式，可以得到不同的mRNA和翻译产物，也即用不同的剪接方式（选择不同的剪接位点）从一个mRNA前体产生不同的mRNA剪接异构体的过程。

16.RNA editing （RNA编辑）：（剪接后修饰）是某些RNA，特别是mRNA前体的一种加工方式，如插入、删除或取代一些核苷酸残基，导致DNA所编码的遗传信息发生改变，因为经过编辑的mRNA序列发生了不同于模板RNA的变化。

17.ribozyme (核酶)：指具有催化功能的RNA分子，通过催化靶位点RNA链中磷酸二酯键的断裂，特异性地剪切底物RNA分子，从而阻断基因的表达。

18.Wobble hypothesis （变位假说）：：一个tRNA上的反密码子第一位碱基与密码子的第三位碱基，由于非碱基互补配对而识别不止一个密码子的现象。

19.SD sequence (SD序列)：存在于原核生物mRNA起始密码子上游7~12个核苷酸的富含嘌呤的保守片段，可将mRNA的AUG起始密码子置于核糖体的适当位置以便起始翻译作用。

20.Operon（操纵子）：存在于原核生物当中，由启动基因、操纵基因和一系列的结构基因紧密结合而成，是多数原核生物基因调控的实现方式。

21.enhancer （增强子）：能显著提高与其连锁的结构基因转录水平的一类顺式调控元件。

增强子的作用与启动子的相对位置无关，无方向性，有组织特异性。

22.Antisense RNA(反义RNA)：指与mRNA互补的RNA分子, 也包括与其它RNA互补的RNA分子。

由于核糖体不能翻译双链的RNA，所以反义RNA与mRNA特异性的互补结合, 即抑制了该mRNA的翻译。

通过反义RNA控制mRNA的翻译是原核生物基因表达调控的一种方式。

23.Silencers（沉默子）: 基因的负调控元件。

沉默子的DNA序列被调控蛋白结合后阻断了转录起始复合物的形成或活化，使基因表达活性关闭。

24.genomic imprinting （基因组印记）：控制某一表型的等位基因由于来源于不同的亲本而产生差异表达，即机体只表达亲本一方的基因，另一方的基因不表达。

25.epigenetics （表观遗传）：在基因组DNA序列不发生改变的情况下，由于甲基化、基因组印记、RNA编辑等原因，造成基因表达产物的改变从而改变表型的现象。

在代与代之间是可遗传的。

26.Insertion sequence，IS（插入序列）：原核生物中最简单的一种转座元件，由一个转座酶基因及两侧的反向重复序列组成，不含有任何宿主基因。

他们是细菌染色体或质粒的正常组成成分。

27.transposons（转座子）：能在同一细胞中同一DNA分子内或不同DNA分子间移动的一段DNA序列。

有两种转座形式：复制型转座，非复制型转座①replicative transposition（复制型转座）：转座元件在转座时复制自身一份拷贝，而后该拷贝转座到新的位点，转座的结果是原位点仍保留原来的转座元件，每转座一次会增加一个拷贝数。

②non-rreplicative transposition（非复制型转座）：转座元件直接从原位点转座到新位点，转座的结果是原位点丢失了转座元件，每转座一次并不增加拷贝数。

hybridization（杂交）：两条互补的核苷酸单链在适当的条件下退火形成异质双链的过程称杂交。

28.medium（培养基）：是一种人工配制的适合微生物生长繁殖或产生代谢产物用的混合养料，它具备微生物所需的六大营养元素，且其间比例合适。

29.virus（病毒）：是超显微的，无细胞结构，专性活细胞内寄生，在活细胞外具一般化学大分子特征，一旦进入宿主细胞又具有生命特征。

30.cruciform (cross-shaped)（十字形结构）：具有反向重复序列或回文序列的DNA由双链间互补转化为链内互补而形成的结构。

31.Endonuclease（内切酶）：可以在DNA或RNA分子内部切断磷酸二酯键的酶。

32.Exonclease（外切酶）：仅能水解位于核酸分子链末端核苷酸的酶。

根据其作用的方向性，分为5’-3’或3’-5’核酸外切酶活性。

33.Restriction endonuclease（限制性内切酶）：能够识别DNA分子的特定核苷酸序列，并在识别位点或其周围断开DNA双链的一类核酸酶。

34.Bases accumulation force（碱基堆积力）：即疏水相互作用，即双螺旋内两相邻碱基互相靠拢聚集在一起形成的力。

是一种协同作。

产生的力，由氢键引起，使处于中间的碱基比两边的碱基稳定。

35.interspersed repeat sequence,IRS散在重复序列：散在方式分布于基因组内的重复序列。

这类DNA序列一般都是中度重复序列。

根据重复序列的长度可以分为4类：长散在重复序列(LINE)、短分散重复序列(SINE)、长末端重复序列、DNA转座子。

36.Template strand（模板链）：也称反义链或负链。

双链DNA中，可作为模板转录为RNA的DNA链，该链与转录的RNA碱基互补。

37.Coding strand（编码链）：也称有义链或正链。

DNA双链中含编码蛋白质序列的那条链，与模板链互补。

其序列与信使核糖核酸相同，只是信使核糖核酸中的U（尿嘧啶）组成与编码链中的T（胸腺嘧啶）组成相区别。

38.TATA Box（TATA框）：真核生物启动子转录起始点上游约-25~-30范围的7bp左右的富含AT的保守序列，与基因转录起始位点的定位有关。

是很多真核生物类型Ⅱ启动子39.Cistron（顺反子）：编码一个多肽的遗传单位。

40.Polycistron（多顺反子）：原核细胞中数个结构基因常串联为一个转录单位，转录生成的mRNA可编码几种功能相关的蛋白质。

41.Monocistron（单顺反子）：真核生物的一种mRNA只编码一种蛋白质。

42.Upstream region（上游区域）：一个基因的开头一般被认为是模板链的3’端，第一个被转录核苷酸的前面（3’端那一侧），被成为上游区域。

43.codon（密码子）：mRNA链上3个连续的核苷酸，它们决定一个特定氨基酸，mRNA上特定的核苷酸序列对应蛋白质链上的氨基酸序列。

44.anticodon（反密码子）：tRNA分子的反密码子环上的三联体核苷酸残基序列。

在翻译期间，反密码子与mRNA中的互补密码子结合。

45.wobble（摆动配对）：一个tRNA上的反密码子第一位碱基与密码子的第三位碱基，由于非碱基互补配对而识别不止一个密码子的现象。

46.si RNA（干扰小RNA）：siRNA是具有21~25个bp长度的短双链小分子RNA，通常是外源性的非编码RNA分子。

这些短RNA和蛋白质形成复合体时具有各种调节功能，可以通过和目标mRNA的完全互补结合诱发目标RNA解体，沉默目标基因的表达。