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如何撰写医学科研论文

如何撰写医学科研论文中国医学科学院基础医学研究所章静波大家好,我今天讲课的题目是如何撰写医学科研论文。

正如莎伊斯协主编美国斯坦福大学及校长约翰·汉尼斯说的,我们所有的思考、分析、整理和数据收集工作,在撰写论文前就什么也不算,在学术领域我们的成果是以写出的文章来体现的,出版物变成货币是学术成果的具体表现形式,将其结果公布发表就等于轮流来做实验,这是不言而喻的事情,所以撰写内容十分重要十分必要,当然从这是从大的方面说 . 。

从小的方面说他也是对撰稿人综合分析、逻辑思维、表达能力的锻炼,写出篇好的或者是优秀的科研论文往往表明你是一位修炼有素的优秀科研工作者,当然在我国在国外也如此,是评审的主要依据之一,所以写好论文绝不可以等闲视之。

我讲一下规范论文的撰写格式,目前大多数医学杂志上的内容都采用 IMRAD 的格式撰写,就是分前言、方法、结果、讨论、结论,此外还有一个摘要( abstract ),有的文章后面还有一个致谢( Acknowledgements ),还有的要分别予以介绍。

首先还是先讲讲文题,文题就是文章的题目,我认为文题具有画龙点睛的作用,就那么一点人们或许感兴趣,全文也活了,所以它起着举足轻重的作用,一般情况下能反映作者的规划和思维能力,人家读你的文章首先读文题,有句成语叫文不对题,但是从审稿人来看,最怕的是题不对文,因此文题最直截了当的讲出你做什么,有什么结果,你的阐述点是什么,要简明准确地反映文章的主题。

这里我举几个例子,供大家参考,第一 DSPP mutation in dentingogenesis imperfecta Shields type Ⅱ这篇文章发表在 Nature,2001,27(2):151-152 ,那么说明一下,dentingogenesis imperfecta Shields type Ⅱ这么长得一个短语,是一种牙齿的常染色体显性疾病, DSPP 是 4q21 的一个基因,就是第四染色体长的一段,我们这篇文章的作者是沈岩院士,是我们前所长,她发现我们这个基因有变化,就把这个基因突变变成文题,所以你看这个文题只有一个短语,并且指出该疾病和 DSPP 基因突变有关。

下面第二个例子,Casper/c-FLIP is physically and functionally Associated with NF-kB1p105 这篇文章发表在 BBRC,2003,309:980-985 , Casper/c-FLIP 是一种 caspase 半光天冬酶,NF-kB1p105 是一种蛋白,它们在细胞凋亡方面密切相关。

此文题是个句子,用的是现在时态。

那么再举个例子, Mutation of LKB1 and p53 gene exerts a cooperative effect on tumorigenesis 这篇文章发表在 Cancer Res,2005,65(24):11297-11303 ,这个文题也是现代时态,文章的内容一看便是很明了,看文题就知道要讲什么。

最后介绍一个文题, NMDAR1 单克隆抗体抑制谷氨酸诱导的大鼠海马神经元 Ca2+ 内流,这篇文章发表在基础医学与临床2007 第 27 卷 1109-1112 页,这个文题也是一个完整的句子,讲出了实验结果。

这里顺便说一下,现在国外杂志不太主张诸如“ preliminary study on ……”,这样的文题 peer-reciewer 会说“ since it is a preliminary study, back to your lab and do more work and get more parametes then submit. ”你这样的研究不行,你再去研究研究,等你有更好的结果再发表吧,当然这是有些杂志,但是有些杂志还是用。

总之文题不要太长,要写的精炼,有时要表述的内容实在太多,在这种情况下可以设一个分题。

总之对文题有三个要求,一要准确性,二要简洁,三要清楚, ABC 的要求,所以小小的问题要求很高,不可以等闲视之。

这里说下署名的问题,原则上被属名的人,是对该论文负责的人,他因该对整个研究工作全面了解,对他人的质疑有能力回答,但有时一篇文章很大,内容很多,不可能由一个人完成,有的文章作者很多,但是作者至少应该对自己的内容负责,对他人的质疑有能力回答,因此,有时一篇论文作者很多,还有许多共同的作者,这种情况都是允许的,但有一点是十分明确的,谁是第一作者,谁是责任人,都应该在投稿前排列给大家讲清楚,并且每个人签字,避免日后麻烦,尤其是通讯作者,要必须注明,他必须答复审稿意见及承担主要的责任。

下面讲提炼知识,提炼是要说明为什么要进行这项研究及研究的背景及理由,因此你要查阅大量国内外文献,进行解说,但是现在有电脑,查找很方便,但是要注意的是你不能依靠电脑,网上东西往往太简单,网络上的资料可靠性也成问题,所以你必须大量的原文献,这样的科研工作才能基础,不要等文章发表了,说你的工作三年前就有人做了,这不是浪费青春了吗?一般说来题目不要太长,把你要做实验的目的讲清楚就可以了,国内有些杂志还限制多少字,我个人认为限制是不好的,什么都限制,什么都固定下来脑子就会僵化,就会出现八股文,最后我要说的是题目写的好坏往往可以反映出一个人的科研思维的素质如何,思维方法怎样,一个学富五车的人往往题目写的很漂亮,写的好的简直是一篇妙文,科研工作最好把题目写的很美下面讲材料和方法,也就是你是如何接近这项研究的,采用了什么样的样本,什么样的方法获得你所要的结果,请注意,材料方法尽可能严谨,这是你成败的关键,比如这项研究,焦油致癌的时候,不少学者用焦油去涂抹大鼠的皮肤,结果什么也看不到,山极和市川是日本的学者,他们用焦油涂抹兔子的耳朵,结果涂出了上皮瘤,有的发展成癌,发生转移,因为大鼠皮肤对焦油是不敏感的,而兔子的皮肤是敏感的。

我们做人精子体外受精的实验,你若用大鼠卵,小鼠卵人的精子是穿不进去的,后来又有个日本人叫山村隆造,他是中国学者张明觉的学生,他一试就成功了,他说人的精子插不进入大鼠的卵,穿不进小鼠的卵,可以穿进仓鼠的卵,这既是成功。

所以在这里我要强调的是,第一作为选择你试验动物、细胞的样本,注意你选择动物的状态、年龄、性别,是否纯种,是否健康,细胞是否正常,是转化的,还是恶性转化的,是什么的细胞,是上皮样的,纤维样的还是其他的等等,细胞最好是从 IPCC 大的可靠的单位获得,国内可以国家级的细胞库或者中心获得,因为他们都是经过严格检测的,至少不会有支原体或者别的细胞 Hela 细胞所污染,随便在这里说一句, 2007 年德国召开的第 11 届培养动物保存大会,会议指出,大家比较喜欢用 ECV304 细胞,是人脐静脉内皮细胞,但是它以被人膀胱癌细胞 T-24 所污染,应被取代,因此不能用其细胞实验。

会议还特别指出,中国科研人员还把他作为内皮细胞用。

第 3 你所用的试剂是什么等级的,最好是从大公司获取的。

第 4 你所用的方法是否可靠,是否敏感,是否适合你的实验工作,另外有的研究需要用多种方法来揭示你的实验结果。

要想使细胞凋亡,最好用形态学,生化,分子生物学,基因水平等多种方法,这样的结果才可以立于不败之地。

第 5 临床研究当然要注意病人的选择,一定要说清楚选择的标准,此外一般都采用随机对照临床实验,所谓的 RCT ,这样得出的结果方可以得益于治疗的措施。

第 6 用人的材料要注意人权问题,以及知情同意书,要经过单位的伦理委员会的批准。

第 7 要严格的对照,在这前面我们已经讲过,不少文章投到我们杂志,往往缺乏合理的对照,这样的文章会被退回去。

第 8 要有严格合理的统计与分析,据说我们的不少文章,一到统计学家的手里,他们就会失笑不已,你这样的人连基本的统计学的概念都不具备还从事科学研究,这样的话是说的重了一点,但也反映出我们作者缺乏缜密的思维和起码的统计学知识,总之对材料方法不可以马虎,有的审稿人员拿到 paper 什么都不看,先看材料和方法,他觉得你所用的材料不合适,所用的方法陈旧,当然老得不一定不好,你的技术路线不合理,或是最佳的方案,或者统计学得方法不对,他就大笔一挥枪毙。

结果是作者翘首以待,因为你一年或多年辛苦终于有了回报,这里要讲的有以下几个方面。

第一怎么取舍你所得的结果呢,因为你的实验得到较多的参数,可能你看看这个结论很好,哪个结果很不错,这个也舍不得放弃,哪个也舍不得放弃,那么我也建议你的只能是取那些十分可靠的,可以反映你实验目的的结果,比如你证明一种物质对细胞有促进它增殖的作用,开始你会从细胞计数,生长曲线,成集落实验,分裂指数,甚至 DDR 标准等等,另外从简单做起,做到心中有数,不会走弯路,一般性论文中,比如有成集落实验,就不必再用分裂指数,因为成集落实验更能准确的反映出细胞的能力。

第二注意假阳性,假阴性,为了防止假阳性假阴性,首先要查看下你做实验的方法,及技术路线是否正确,在看看有没有合理的严格对照,有的实验不光有阳性对照,还要有阴性对照。

第三,不可随心所欲的挑选实验结果,比如你做了几次实验结果不全一致,甚至相反,遇到这种情况,一定要终审实验方案,严格的再次重复,然后分析结果不一致的原因。

比如说细胞状态是否每次都相同,是否培养基尤其是血清有问题等等,当然我们不要求每次实验结果都一模一样,在生物医学实验里几乎是不可能的,只要大致一致就可以了,然后你采用平均方法加上统计处理,就可以了,也可以一次典型的为代表,但是要说明其他几次实验结果与此相似。

第 4 实验结果与议题大相径庭怎么办,这种情况我们会遇到,这其中原因很多,首先你的假设可能不对,或是你的实验方法不对,或者你使用的材料不对,总之实验结果与你想想的不一致与权威不一致,千万别害怕,结果是客观的,我们要实事求是的给予合理的解释,甚至推翻原有的设计,说不定得到意想不到的发现,例如,发明青霉素那样,如果他怀疑实验的结果,那就发明不了青霉素。

第 5 结果的撰写最好有层次,正如毛主席说的,由里及表,由此及彼,如抽丝剥茧层层深入,比如我们要写细胞凋亡结果,最好要从凋亡的过程展开,或者从形态讲到生化,由生化讲到分子生物学,另外要有代表性的照片,如果照片可以说明问题的,可以少用文字。

第 6 你所得的结果至少要重复三次,在我们审稿投稿的论文中,往往容易出现偏差甚至错误的结果,这样的论文一般都要退回去,一般要重复实验。

下面讲讨论怎么写,写文章时大家都讨论是难事,主要是不知道讨论什么,如何讨论,抓不住要领,我们认为讨论要抓住以下几个方面。

1 、讨论要紧扣实验目的和结果,尤其讨论是你结果说明了什么,为什么可以这样说明。

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