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李金明-个体化医学检测质量保证指南(简)


基因扩增仪器设备的质控
仪器设备
扩增仪
加样器 水浴箱 酶标仪
质控方法
频度
仪器校验实验 当仪器移动时
热电偶监测温度 每月一次
实验室应根据自己的检验项目、所采用的检测技术平台和工作量来决定分区的多 少及各区域的空间大小。
至少具体需要多少个区,同样是“个体化”的,以“工作有序、互不干扰、防 止污染、报告及时“作为基本原则。
缓冲间的功能是“控制空气的流向”。 生物安全柜可考虑“A2”。
产前筛查与产前诊断(全基因组低拷贝测序技术)
3. 所申请的检验项目; 4. 患者的相关临床资料,包括初步诊断结果; 5. 样本采集日期和采集时间; 6. 实验室接受样本的日期和时间; 7. 与检验有关的既往史等; 8. 样本是否合格:有无癌变组织、血液样本有无溶血、容
器有无破损等。 9. 医生的签名。
患者的正确识别
(6)样本保存温度和时间的要求。用于DNA检测时,样本可在2~8℃ 保存72h。用于RNA检测时,样本一旦采集送达实验室后,如不能立 即提取,应冻存于-70℃。临床体液样本的长期保存(>2周)在保存 于-70℃。已提取纯化的RNA最好在乙醇沉淀后保存在-70℃。如果样 本中含有红细胞,应尽可能去除红细胞后,再进行冻存。石蜡包埋组 织则可在2-8℃长期保存。
在对患者进行取血或采样前,检验人员需要首先确 定患者的身份。
在对患者进行确认时,应准确核实患者的姓名、性 别、住院号等信息。对于不能说话的或意识不清醒 的患者应由相关陪同人员、医生或护士加以确认。
如果有腕带,患者的腕带上通常附有上述信息,采 血或取其他临床样本时检验人员应先确认这些信息。
(3)实验室应向样本采集人员明确以下信息(如有可能体现在申 请单中),具体包括:采集时间;采集部位;样本类型;采集量;采 样质量的要求;拒收样本的类型。
(4)样本运送和保存中的生物安全。
样本的采集、运送和保存(2)
(5)样本运送温度和时间的要求。DNA检测样本,可室温下运送, 建议8h内送至实验室。靶核酸为RNA时,10 min可室温运送,如所需 运送时间较长,则应将样本置于冰上,必须保证样本与冰屑充分接触, 且冰屑应达到样本的高度,建议采集后4h内送到。 冰冻组织样本最好 保证其在运送过程中不发生融化,石蜡包埋组织则可在室温下运送。
测序区空气流向 缓冲间扩增 与检测区 空气流向缓冲间
标本与文 库制备区 空气流向
缓冲间
试剂准备区
空气流向 缓冲间
专用走廊工作流向标本与制备区 扩增与检测区测序区
植入前胚胎遗传学诊断(全基因组低拷贝测序)
电泳区 空气流向 缓冲间增一区 空气流向 缓冲间
个体化医学检测质量保证指南
李金明 国家卫生计生委临床检验中心
适用范围
本指南适用于通过分析基因及基因结 构改变、基因表达及代谢变化,对患 者疾病进行预测、诊断、治疗决策、 监测和预后的临床检测。
标本采集、 运送和保 存(分析
前)
涉及临床医生 标本采集环节 和实验室
结果报告 解释及临
床应用 (分析后)
常见标本的类型
血液 分泌物 胸腹水 痰 粪便 尿 脑脊液 胚胎样本 骨髓穿刺样本/细针穿刺细胞 组织(新鲜组织、活检组织、手术切除样本、甲醛固定的石蜡包埋组
织(FFPET) )
临床分子诊断样本的接收
样本拒收标准:容器破损、量不够、时间不符 合要求、重度溶血、重度脂血、重度黄胆、无 靶细胞?
RNA:RNA易于降解,在-20℃条件下,RNA酶 也可能发挥作用。因此,纯化后的RNA应当经过 乙醇沉淀,并在-70℃以下保存。
分析中的质量保证
临床基因扩增检验实验室设计
产物分析区
空气流向 专用走廊
扩增区
空气流向 缓冲间
标本制备区
空气流向 缓冲间
试剂准备区
空气流向 缓冲间
工作流向
“各区独立 注意风向 因地制宜 方便工作”
样Hale Waihona Puke 的采集、运送和保存(1) 1. 基本原则 (1)应按照CFDA批准的检测试剂说明书制订的标准操作程序
(SOP)进行。如为实验室自制试剂,则实验室应当建立样本的采集、 运送和保存的SOP,并严格执行。

(2)样本采集和运送容器:密闭的、一次性、无菌、无核酸酶及其 他扩增抑制物。血液和骨髓穿刺样本通常需要先抗凝,抗凝剂一般应 EDTA和枸橼酸盐,避免使用肝素。如检测的靶核酸为胞内RNA,试 管内应含有一定量的RNA稳定剂。
专用走廊
WGA制备区
试剂准备区
空气流向 缓冲间
空气流向 缓冲间
遗传病诊断+肿瘤诊断与治疗(杂交捕获测序技术+Sanger测序验证)
电泳区测测序序区区文库检检测测区区空气流向空气流向
空气流向
缓冲
杂杂交交捕捕获获区区 ((扩扩增增一一区区))
用于肿瘤组织基因突变检测的样本,在分子检 测须由病理医师进行镜下肿瘤细胞评估,然后 富集肿瘤肿瘤细胞用于核酸提取。肿瘤细胞所 占比例应达到所用扩增检测方法的要求
纯化后的DNA和RNA的保存
DNA:如果纯化后的DNA无DNA酶的污染,则可 在TE缓冲液中室温保存26周;2-8℃保存一年;20℃保存7年;-70℃保存7年以上。怀疑可能存在 DNA酶污染的样本,则保存在-20℃以下。
DNA打断区
空气流向
空空气气流流向向
空气流向
缓冲间
缓冲间缓缓冲冲间间标本标与本与制文备区 库制备区试剂准备区
空气流向
空气流向
缓冲间
缓冲间
专用走廊
实验室仪器设备及管理
加样器:维护、校准 扩增仪:维护、校准 恒温干浴仪或水浴箱:维护、校准 离心机:维护 生物安全柜:维护 冰箱:维护
涉及实验室人 员和临床医生
质量 保证
室内质控 (分析中)
涉及实验室
室间质评 (分析中)
涉及实验室
分析前质量保证
申请单应包括的内容
1. 患者的惟一标识:患者的姓名、出生日期、性别、民族、 住院号、就诊科室、床号,有条件的医院尽量使用条码标 志或其他唯一标示;
2. 样本的类型:血液、其他体液、活检组织、手术切除样 本等;
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