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药物分析信息学及基于大数据技术的药物分析

导致生活不能自理的 病人
03
肺癌患者
危重症病人
1.小波变换近红外光谱仪
:主要针对中老年患者
02
无人照料
老人
01
慢性呼吸疾病
导致生活不能自理的 病人
03
肺癌患者
危重症病人
主要应用于复方制剂、中药成分分析、代谢组学、中药打假
01 在代谢组学中的应用
代谢组学:代谢组学是对某一生物或细胞,在一特定生理时期内所有低 分子量代谢产物,同时进行定性和定量分析的一门新学科。它是以组群 指标分析为基础,以高通量检测和数据处理为手段,以信息建模与系 统整合为目标的系统生物学的一个分支。
在美国华盛顿大学成立了国际化学计量学学会
背景:数据处理与信息提取和计算机科学的发展 概念:应用数学、统计学与计算机科学的方法,
来设计或选择最优的化学实验方法,并从测量数据 中最大限度地获取化学及相关信息。
化学计量学:chemometrics
基本内容
统计学 与统计方法
试验设计 与优化
分析信号处理 化学模式识别
01 在代谢组学中的应用
NMR、LC-MS、GC-MS
获得的数据非常复杂
数据处理



揭示出反映样品内
目的



在机理的、整体性


差异的关键性生物 标记物





01 在代谢组学中的应用
李晶:代谢组学研究中数据处理新方法的应用
用稳健主成分分析(PCA)进行 离群样品点的诊断
三种数据预处理方法的应
制药行业数据的不断积累和生命科学及健康领域数据的蓬勃发展!
大数据技术:
定义
一代全新的数据科学领域的技术架构或模式,对数据量大、类型 复杂、需要即时处理和提纯的各类数据,综合运用新的数据感知、采 集、存储、处理、分析和可视化等技术,提取数据价值,从数据中获 得对自然界和人类社会规律深刻全面的知识和洞察力。
人工智能
经典统计分析 回归和相关 多元统计分析
方差分析
响应面理论 析因试验
序贯优化方法 并行优化方法
计算分光光度法 分析检测理论 滤波、平滑与求导 因子分析法
聚类分析 线性学习机法 K-最近邻法 定量构效关系
人工神经网络 化学专家系统 数据库和谱图检索
目 录
光谱分析法(一维数据) 在每个检测波长(或波数)处可得到一个响应值, 这样的数据又称矢量型数据。
兼具色谱良好的分离特性和光谱灵敏的定性功能,从色谱、光谱两个 角度提供与物质性质密切相关的大量信息
1.小波变换近红外光谱仪
:主要针对中老年患者
02
无人照料
老人
01
慢性呼吸疾病
导致生活不能自理的 病人
03
肺癌患者
危重症病人
1.小波变换近红外光谱仪
:主要针对中老年患者
02
无人照料
老人
01
慢性呼吸疾病
光谱分析法(一维数据)
数学数学修探针饰法方通过法对—复杂—混数合物学体探系的针光法谱进行
“原位”数学修饰,“创造”背景干扰的最大吸收点,从 而可以“创造”背景干扰被消除的条件。 具体原理为:在合适的波长位置,向待测混合体系的光谱 中添 加“数学探针”(如高斯函数等),可随意改变和调动 可能的背景干扰,从而使干扰在指定位置成峰,产生 极大值;然后通过求导消除干扰,并求出待测组分的 含量。本课题组曾采用数学探针法测定了安钠咖注 射液中苯甲酸钠和咖啡因的含量,通过考查数学探 针的峰高、峰位和半峰宽与结果的关系,确定数学探 针的参数值,并将由此探针产生的“新化合物”仿真 添加在待测液中,从而使待测组分的紫外光谱图出 现了“吸收峰”,即得到了“数学修饰”,然后在修饰得 到的“吸收峰”处求导就可将干扰组分的影响去除, 从而可对待测组分进行含量测定。数学探针法通过 “仿真”地向待测体系中添加“新化合物”(数学探
药物分析信息学

基于大数据技术的药物分析
大数据时代:
背景
随着计算、存储资源的容量、速度、智能化程度的迅速提高和价 格的大幅下降,以及物联网、移动互联网、云计算等技术的迅速发展 和大规模应用,数据量出现了爆发式增长。
特点
数据容量(Volume)大、数据产生速度(Velocity)快和数据 多样性(Variety)高
研究了正交信号校正(OSC)在78 例正常成人血清1 H—NMR谱的 代谢组分析中的滤噪作用,分 别采用主成分分析、偏最小二 乘法判别分析(PLS-DA)及簇类的 独立软模式法(SIMCA)噪后,PLS— DA能够完全区分不同性 别的血清氢谱,其判别能
力优于PCA和SIMCA。
快速、简便、经济
光谱分析法(一维数据)
常用的数据处理方法
偏最小二乘法(PLS):已被用作近红外光谱仪的定量分析方法,应用于原料药分析 和复方制剂分析
缺点:PLS要求体系组成已知,而且各组分的信号应具有加和性,这些限制使得PLS 只适用于组分已知且含量与信号响应值符合线性的体系。
混合线性分析法(HLA):该法结合了多种多元校正方法的优势,其结果优于PLS法。由于其只需 要已知待测组分的纯色谱峰及其在校正谱中的浓度,因此还被用于某些含未知干扰组分的体系的 分析。
大数据技术涉及到数据的感知、采集、存储、处理(管理)、分析、 可视化呈现等诸多环节,各环节采用的技术手段也层出不穷。
药物分析信息学
研究对象:药物复杂体系 方法:化学计量学和统计学,对分析仪器提供的
信息进行变换、解析、挖掘、分类
目的:对复杂体系定性定量分析
化学计量学:chemometrics
产生:1974年,由美国的B.R.Kowalski和瑞典的S.Wold等发起,
色谱分析法(二维数据)
在每一个保留时间点上都对应着一条光谱, 而在每个检测波长处都得到一条色谱,这 样的数据又称“二维”数据或矩阵型数据。
兼具色谱良好的分离特性和光谱灵敏的定性功能,从色谱、光谱两个 角度提供与物质性质密切相关的大量信息
色谱分析法(二维数据)
在每一个保留时间点上都对应着一条光谱, 而在每个检测波长处都得到一条色谱,这 样的数据又称“二维”数据或矩阵型数据。
用变量的类内差异和类间差异 的比较,来判断非保守性代谢 组分
用,会明显改善代谢组学 生物信息学分析中聚类分 析的结果和生物标志物识
用尺度同一化的方法进行数 据预处理来消除数据的尺度 差异
别的准确性及全面性
01 在代谢组学中的应用
冒海蕾:正交信号校正在正常成人血清,H NMR谱的代谢组分析中的滤噪
作用评价
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