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Southern印迹杂交
Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。

一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,经干烤或者紫外线照射固定,再与相对应结构的标记探针进行杂交,用放射自显影或酶反应显色,从而检测特定DNA分子的含量
实验原理
核酸分子杂交技术是分子生物学领域中最常用的具体方法之一。

其基本原理是:具有一定同源性的两条核酸单链在一定的条件下,可按碱基互补的原则形成双链,此杂交过程是高度特异的。

由于核酸分子的高度特异性及检测方法的灵敏性,综合凝胶电泳和核酸内切限制酶分析的结果,便可绘制出DNA分子的限制图谱。

但为了进一步构建出DNA分子的遗传图,或进行目的基因序列的测定以满足基因克隆的特殊要求,还必须掌握DNA分子中基因编码区的大小和位置。

有关这类数据资料可应用Southern印迹杂交技术获得。

Southern印迹杂交技术包括两个主要过程:一是
将待测定核酸分子通过一定的方法转移并结合到一定
的固相支持物(硝酸纤维素膜或尼龙膜)上,即印迹(blotting);二是固定于膜上的核酸同位素标记的探针
在一定的温度和离子强度下退火,即分子杂交过程。

该技术是1975年英国爱丁堡大学的E.M.Southern首创的,Southern印迹杂交故因此而得名。

早期的Southern印迹是将凝胶中的DNA变性后,
经毛细管的虹吸作用,转移到硝酸纤维膜上。

近年来
印迹方法和固定支持滤膜都有了很大的改进,印迹方
法如电转法、真空转移法;滤膜则发展了尼龙膜、化
学活化膜(如APT、ABM纤维素膜)等。

利用Southern 印迹法可进行克隆基因的酶切、图谱分析、基因组中
某一基因的定性及定量分析、基因突变分析及限制性
片断长度多态性分析(RFLP)等。

实验步骤
⏹一、待测核酸样品的制备
⏹二、琼脂糖凝胶电泳分离待测DNA样品⏹三、电泳凝胶预处理
⏹四、转膜
⏹五、探针标记
⏹六、预杂交(prehybridizafion)
⏹七、Southern杂交
⏹八、洗膜
⏹九、放射性自显影检测
⏹(一)原理转印后的滤膜在预杂交液中温育4-6h,即可加入标记的探针DNA(探针DNA 预先经加热变性成为单链DAN分子),即可进行杂交反应。

杂交是在相对高离子强度的缓冲盐溶液中进行。

杂交过夜,然后在较高温度下用盐溶液洗膜。

离子强度越低,温度越高,杂交的严格程度越高,也就是说,只有探针和待测顺序之间有非常高的同源性时,才能在低盐高温的杂交条件下结合。

⏹(二)步骤 1.将标记的DNA探针置沸水浴10min,迅速置冰上冷却1-2min,使DNA变性。

2.从水浴中取出含有滤膜和预杂交液的塑料袋,剪开一角,将变性的DNA探针加到预杂交液中。

3.尽可能除取袋中的空气,封住袋口,滞留在袋中的气泡要尽可能地少,为避免同位素污染水浴,将封好的杂交袋再封入另一个未污染的塑料袋内。

4.置42℃水浴温育过夜(至少18h)。

主要应用
1.遗传病诊断
2.DNA图谱分析
3.PCR产物分析
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