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华南肿瘤大数据及生物样本库网络建设

如何能整合在一个平台?实现一次收集、多次利用!!!
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问题(2):国内外尚缺乏成熟的、适应 “大”数据的存储及处理技术
科学数据以什么方式与医疗数据 存储在一个平台上?
超算系统下的组学数据处理技术
肿瘤组学数据量大、类型多、变量多、噪声大
Level 1
Raw data
.DAT file
分析应用、分析统计 (可视化、查询引擎、统计语言……)
走进一 家医院, 八家医 院来服

???
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项目主要承担单位:中山大学肿瘤防治中心
肿瘤专科影响力
肿瘤学科技影响力
病源吸引力
基础研究平台
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转化研究平台
临床研究平台
需要多学科合作
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生物组 学数据
放射组 学数据
单病种数据标准
常见恶 性肿瘤 大数据 处理分 析与应 用研究
数据 集成 平台 建设
大数 据云 平台 建设
东软
恺恩泰
医度云
鼻咽癌和 结直肠癌 生物医学 大数据平 台建设及 精准医疗 应用研究
中山大学 生科院
中山大学数学 与计算科学院
东软
肿瘤精准医学中心-大数据平台建设
肿瘤影像 医学数据
Level 2
.CEL file
Level 3
Intensity value matrix
医疗数据
组学等 科学数据
Level 4
Statistics
New Hypothesis
数据集成 主数据管理
隐私安全
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问题(3):尚缺乏以疾病为主题的、 涵盖多种数据形态的肿瘤生物医学公共数据库
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问题(3):尚缺乏以疾病为主题的、 涵盖多种数据形态的肿瘤生物医学公共数据库

问题(4):影像数据利用度极低
量大(>90%)/价高,价值待挖掘
放射组学:一次收集多次利用 From picture to mineable data
CT:500元/部位
MRI:1000元/部位
PET:10000元/次
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影像数据:文本报告
多维度生物样本与临床信息实现互通
数据
样本
数据 样本
样本 样本
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目标:建立华南肿瘤精准医学的支撑平台
肿瘤组织样本库+…
临床研究中心 +中国临床研究协作组
新一代组学平台 +华大基因+…
临床高通量测序平台+…
肿瘤医学大数据平台 +7家中大附属医院+华南区域省级肿瘤医院
+…
生物信息统计平台+超算+…
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参加单位:华南地区5家肿瘤专科医院
中山大学信息科学与技术学院 中山大学超级计算学院
华南肿瘤大数据及生物样本库网络建设
肿瘤的精准医疗是社会重大需求
恶性肿瘤是中国居民“头号杀手”
发病率仍在持续升高,死亡比率高于世界平均水平
最需要精准治疗疾病之一
肿瘤临床实践中的“不精准”
GLOBOCAN. 2012
2
中国卫生统计年鉴. 2012
精准医疗为什么是现在?技术可行
数据的可获取 技术/途径
东软集团(广州)有限公司
江西省肿瘤医院
湖南省肿瘤医院
广西医科大学附属肿瘤医院
中山大学肿瘤防治中心 中山大学信息科学与技术学院
中山大学超级计算学院 东软集团(广州)有限公司
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福建省肿瘤医院
肿瘤生物医学大数据建设项目总汇
获取
标准化
集成
标准化
应用
(科学问题+技术方法)
临床数据
一体化医生工作站 东软 放射治疗信息整合平台 医科达
数据的可分析 方法/技术
数据的可共享 意愿/技术
测序+降价,“组学”数据
生物信息统计
“云”技术
移动穿戴设备,“表型”数据
3
超级计算机
国家策略
精准医疗为什么不是现在?
问题(1):数据分散保存、共享水平低
医学大数据的范畴
医学大数据的分散存在方式
组学等“科学”数据与“医疗”数据的割裂,PI电脑 vs 医院应用系统
数据
患者
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数据
数据 数据
数据 数据
样样样 样 样 本本本 本 本
患者
中山大学肿瘤医院启动了院长1号工程
华南肿瘤大数据及生物样本库网络建设
863计划重大项目 (徐瑞华 2015-) 863计划重大项目 (贾卫华 2012-) 广州市健康医疗协同创新重大专项三期 (孙颖 2016-) 中山大学 建设资金 (2015-) 中山大学“肿瘤精准医学平台建设” 医院自有资金
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