Thanks!!
每一个成功者都有一个开始。勇于开始，才能找到成
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1、
功的路 。20.10.2620.10.26Monday, October 26, 2020
成功源于不懈的努力，人生最大的敌人是自己怯懦
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2、
。0 0:05:12 00:05:1 200:051 0/26/2 020 12:05:12 AM
3.检索结果
选择核酸类型
点击选中序列
保存序列信息
比对(一)
多序列联配 ClustalW
Results
PC版 clustal W
构建系统树
1. 利用Clustal W (EMBL) 分析结果得出。 2. 利用Clustal W 结果文件（后缀为aln）,
利用treeview 、drawview、Phylip等软 件进行视图。 3. 利用meg3.1 等软件进行比对分析。 4. 利用Clustal W 结果文件（后缀为aln） 转化为meg格式，在MEG3.1中进行各 种tree的绘制。
生物信息学应用基本知识
生物信息学是一门以分子生物学为研究
对象的交(叉 一)学序科列比对
计算机科学、 信息科学、 数学、物理等
神经网络 遗传算法 进化策略 遗传规划 人工生命
生物学范畴
分子生物信息学
应用
结构 / 功能关系的研究 蛋白质拓扑学
代谢路径的设计 蛋白质结构预测 基因的辨识
分子生物学
主要数据库(Database)
生活总会给你谢另一个谢机会，大这个机家会叫明天 6、
。2 020年1 0月26 日星期 一上午1 2时5分 12秒00: 05:122 0.10.26
人生就像骑单车，想保持平衡就得往前走
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7、
。202 0年10 月上午1 2时5分 20.10.2 600:05October 26, 2020
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8、业余生活要有意义，不要越轨。20 20年10 月26日 星期一 12时5 分12秒0 0:05:12 26 October 2020
（MinimumHeliaEntvhuos lution）
Camptotheca
除权配对法

Hevea
（UPGMA） Melaleuca Eucommia
邻位相Pu连erari法a
（Neighbor-Joining）
Meg3.1应用
１.Meg3.1 安装
２.格式转换
将多序列联配结果（aln文
件）转化成Meg格式
5 AM20.10.2620.10.26
Melaleuca
进化树类型
进化树
无根树 有根树
Nicotiana
Pueraria
建树 算法 Eucommia
简约法（parHselianithmus ony）
距离法（distance ）
Camptotheca
最大可能算法 （Maxium likelihood）
常用建树方法
Hevea
最小进化法 Nicotiana
３.选择相应的建树序列类型
４.选择算法
５.置信度检测
Nicotiana Helianthus Camptotheca Hevea Melaleuca Eucommia Pueraria
Nicotiana Helianthus
Camptotheca Hevea Melaleuca
Eucommia Pueraria
序列下载
1.NCBI简介
• PubMed 书目文献数据
• All Databases 多结果检索
• BLAST
序列比对工具
• OMIM
孟德尔遗传在线
• BOOk
在线图书检索
• TaxBrowser 分类数据库
• Structure
结构数据库
2.序列检索
选择检索类型
检索信息
(Ac or/and keywords)
我们必须在失败中寻找胜利，在绝望中寻求希望
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9、
。上 午12时5 分12秒 上午12 时5分0 0:05:12 20.10.2 6
• 10、一个人的梦想也许不值钱，但一个人的努力很值 钱。10/26/2020 12:05:12 AM00:05:122020/10/26
• 11、在真实的生命里，每桩伟业都由信心开始，并由 信心跨出第一步。10/26/2020 12:05 AM10/26/2020 12:0
NCBI EMBL DDBJ
美国国立生物技术信息中心
欧洲分子生物学实验室 日本核酸数据库
共同构成了国际核酸序列数据库,这三个组织每天交换数据
序列格式
• 常用的几种序列格式: • NBRF/PIR FASTA GDE • 1. NBRF/PIR Pr序列以” >P1” 开头
Nu序列以” >N1” 开头 • 2. FASTA格式 以”>”为开始标记 • 3. GDE格式 以”%”为开始标记 • 其中最常用最常见的是FASTA格式
每天只看目标，别老想障碍
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3、
。20.1 0.2600: 05:120 0:05Oct-2026-Oct-20
宁愿辛苦一阵子，不要辛苦一辈子
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4、
。00:0 5:1200: 05:120 0:05Monday, October 26, 2020
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积极向上的心态，是成功者的最基本要素 5、
。20.1 0.2620. 10.260 0:05:12 00:05:1 2Octobe r 26, 2020