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酶定向进化

天然酶的局限
天然酶的稳定性差,活性低使催化效率很低,还
缺乏有商业价值的催化功能
天然酶的局限性源于酶的自然进化过程.
现代生物工程的要求

能具备长期稳定性和活性 能适用于水及非水相环境 能接受不同的底物甚至是自然界不存在的合成底 物 能够在特殊环境中合成和拆分制作新药物或药物 的原材料 如何利用相对简单的方法以达到对天然酶的改造 或构建新的非天然酶就显得非常有研究意义和应 用前景.
1.平板筛选法
平板筛选法所依据的重组细胞的表型包括细
胞生长情况、颜色变化情况、透明圈情况。 1)依据细胞生长情况筛选突变基因 在提高酶的热稳定性、抗生素耐受性、pH稳 定性和对其他极端环境条件的耐受能力等方 面有广泛应用。
2)依据颜色变化筛选突变基因
片断 (lacZ′)插入到噬菌体DNA的间隔区域中,当它 感染了相应的大肠杆菌宿主细胞时,在含有IPTG和 底物X-gal的平板培养基上可以形成蓝色噬菌斑。 (2)在对磷酸酯酶进行定向进化的过程中,可以在 平板培养基中加入硝基酚磷酸,接种重组细胞培养 一段时间后,有些重组细胞周围出现黄色(硝基 酚)。
二、突变基因的筛选
(一)定向选择环境条件的设定 (1)提高酶的稳定性,高温筛选重组细胞,每一次 突变-筛选的循环中逐步提高重组细胞的培养温 度。 (2)如果定向进化的目的是提高β-内酰胺酶的活 性,从而提高对β-内酰胺酶类抗生素的耐受性, 可以通过在含有一定浓度的β-内酰胺酶类抗生素 的培养基中培养重组细胞,并在每一次突变-筛 选循环中逐步提高抗生素的浓度。 (二)高通量筛选技术P217表8-2
特点 正突变的概率低,突变基因较大,筛选的工作量大,一般适用于较小基因的定 向进化。
实例
枯草杆菌蛋白酶:洗涤剂合成、鞣革和医药领域的重 要工业酶制剂。 Chen 等采用易错PCR 对该酶进行了体外进化研究。 他们通过降低反应体系中dATP 的浓度, 对编码该酶 从第49 位氨基酸到C 端的DNA 片段进行易错PCR , 经筛选得到的几个突变株在高浓度的二甲基甲酰胺 (DMF) 中酶活性明显提高 突变体PC3 在60 %的DMF 中, 酶活力是野生型的 256 倍。将PC3 再进行两个循环的定向进化, 得到的 突变体13M酶活力比PC3 还要高3 倍。
DNA家族重排技术与DNA重排技术的异同点
相同点:DNA家族重排技术与DNA重排技术的过程 大致相同,都要经过基因的随机切割、无引物PCR 等步骤以获得突变基因,然后经过构建突变基因文 库、采用高通量筛选技术筛选获得正突变基因。 不同点: DNA家族重排技术从基因家族的若干同源 基因出发进行DNA序列的重新排布,而后者则从采 用易错PCR等技术所获得的两个以上的正突变基因 出发进行DNA序列的重新排布。

二 DNA重排技术
概念:又称片断,经过不加引物的多次PCR循 环,使DNA的碱基序列重新排布而引起基 因突变的技术过程。
DNA重排技术的基本过程
两条以上正突变基因
酶切
DNA随机片断
无引物PCR
酶切
突变 随机突变、构建突变基因、定向选择 酶定向进化的基本过程:
酶基变基因 进化酶
负突变基因
第一节 酶定向进化的特点
1 .适应面广
不需了解酶的结构信息,因此称为非理性化
设计。
2. 目的性强 3. 效果显著
第二节 酶基因的随机突变
体外随机突变的方法:PCR技术、DNA重排
技术、基因家族重排技术 基因随机突变方法的特点P207表8-1
一 易错PCR技术
可以通过提高镁离子浓度、添加一定浓度的
锰离子、改变4种底物(dAMP、dTMP、 dCMP、dGMP)的浓度比等反应条件,使 DNA聚合酶在催化基因扩增时,增加碱基配 对错误的出现频率,而引起基因突变。
3)依据透明圈情况筛选突变基因

第三节 酶突变基因的定向选择
突变基因的定向选择基本过程
突变基因
体:微生物细胞染色体外,闭合环状双链 DNA分子。 2)噬菌体DNA载体:由噬菌体DNA改造而成的具有 自我复制能力的载体。 3)黏粒载体:是一类人工构建的含有λDNA黏性末 端和质粒复制子的质粒载体,又称为柯斯质粒。 4)噬菌粒载体:是一类人工构建的由M13噬菌体单链 DNA的基因间隔区与质粒载体结合而成的基因载体。

基因重组
在体外通过DNA连接酶的作用,将基因与载体 连接在一起形成重组DNA的技术过程。 黏性末端连接 平有感染活性 的噬菌体的过程。 重组质粒载体:转化 重组噬菌体DNA载体:需要用噬菌体外壳蛋白 将重组DNA进行包装,家Arnold
F H首先提出酶分 子的定向进化的概念,并用于天然酶的改造或 构建新的非天然酶.
酶分子定向进化
简称酶定向进化,是模拟自然进化过程(随
机突变和自然选择),在体外得到具有 优良催化特征的酶的突变体的技术过程。
(反复进行)
筛选
正突变基因
进化酶
三基因家族重排技术
又称为基因家族改组技术,是从基因家族
的若干同源基因出发,用酶(DNase Ⅰ)切割 成随机片断,经过不加引物的多次PCR循环, 使DNA的碱基序列发生重新排布而引起基 因突变的技术过程。
基因家族重排技术的基本过程
基因家族若干同源基因 酶切 DNA随机片断 无 进化酶 酶切
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