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酶切位点保护碱基


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AAGGAAAAAAGCGGCCGCAAAAGGAAAA
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Nsi I
TGCATGCATGCA CCAATGCATTGGTTCTGCAGTT
10
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>90
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Pac I
TTAATTAA GTTAATTAAC CCTTAATTAAGG
0
0
0
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0
>90
Pme I
GTTTAAAC GGTTTAAACC GGGTTTAAACCC AGCTTTGTTTAAACGGCGCGCCGG
CATCGATG GATCGATC CCATCGATGG CCCATCGATGGG
GGAATTCC CGGAATTCCG CCGGAATTCCGG
GGGGCCCC AGCGGCCGCT TTGCGGCCGCAA
CAAGCTTG CCAAGCTTGG CCCAAGCTTGGG
切割率%
2 hr
20 hr
0
0
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0
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Sac I Sac II
CGAGCTCG
GCCGCGGC TCCCCGCGGGGA
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0
0
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Sal I
GTCGACGTCAAAAGGCCATAGCGGCCGC
0
0
GCGTCGACGTCTTGGCCATAGCGGCCGCGG
10
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ACGCGTCGACGTCGGCCATAGCGGCCGCG
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GAA
Sca I Sma I Spe I Sph I Stu I Xba I Xho I Xma I
GAGTACTC AAAAGTACTTTT
CCCGGG CCCCGGGG CCCCCGGGGG TCCCCCGGGGGA
GACTAGTC GGACTAGTCC CGGACTAGTCCG CTAGACTAGTCTAG
CAGATCTG GAAGATCTTC GGAAGATCTTCC
GGCGCGCC AGGCGCGCCT TTGGCGCGCCAA
GGGT(A/T)ACCC
AACTGCAGAACCAATGCATTGG AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT
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Pst I
GCTGCAGC TGCACTGCAGTGCA
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AACTGCAGAACCAATGCATTGG
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AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA
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CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT
0
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Pvu I
CCGATCGG ATCGATCGቤተ መጻሕፍቲ ባይዱT TCGCGATCGCGA
基(黑色),相同如果要在 3‘端加保护碱基,就在酶切位点识别碱基序列(红色)
的 3’端加上相应的碱基(黑色)。
2.切割率:正确识别并酶切的效率
3。加保护碱基时最好选用切割率高时加的相应碱基。
GGCATGCC CATGCATGCATG ACATGCATGCATGT
AAGGCCTT GAAGGCCTTC AAAAGGCCTTTT
CTCTAGAG GCTCTAGAGC TGCTCTAGAGCA CTAGTCTAGACTAG
CCTCGAGG CCCTCGAGGG CCGCTCGAGCGG
CCCCGGGG CCCCCGGGGG CCCCCCGGGGGG TCCCCCCGGGGGGA
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Kpn I
GGGTACCC GGGGTACCCC CGGGGTACCCCG
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Mlu I
GACGCGTC CGACGCGTCG
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Nco I
CCCATGGG CATGCCATGGCATG
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Nde I
CCATATGG CCCATATGGG CGCCATATGGCG GGGTTTCATATGAAACCC GGAATTCCATATGGAATTCC GGGAATTCCATATGGAATTCCC
酶切位点保护碱基
Revised at 2 pm on December 25, 2020.
酶 Acc I Afl III Asc I Ava I BamH I Bgl II BssH II BstE II BstX I Cla I
EcoR I Hae III Hind III
PCR 设计引物时酶切位点的保护
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注释:
1.如果要加在序列的 5‘端,就在酶切位点识别碱基序列(红色)的 5’端加上相应的碱
寡核苷酸序列
GGTCGACC CGGTCGACCG CCGGTCGACCGG
CACATGTG CCACATGTGG CCCACATGTGGG
GGCGCGCC AGGCGCGCCT TTGGCGCGCCAA
CCCCGGGG CCCCCGGGGG TCCCCCGGGGGA
CGGATCCG CGGGATCCCG CGCGGATCCGCG
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Nhe I
GGCTAGCC CGGCTAGCCG CTAGCTAGCTAG
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Not I
TTGCGGCCGCAA ATTTGCGGCCGCTTTA
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AAATATGCGGCCGCTATAAA
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ATAAGAATGCGGCCGCTAAACTAT
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