第三章基因克隆载体
pUC19
Multiple Cloning Sites pUC18
pUC系列质粒载体的优点
具有更小的分子量和更高的拷贝数
• pUC8为2 750bp,pUCl8为2 686bp • pBR322质粒的复制起点内部发生了自发的突变,导致rop基因
的缺失
适用于组织化学方法检测重组体
• LacZ基因上缺失近操纵基因区段的突变株与带有完整近操纵基 因区段的β—半乳糖苷酶阴性的不同突变株之间实现互补,这种 互补现象叫做α—互补。
质粒DNA分子大小1-100Kb以上。
质粒DNA的复制
质粒能利用寄主细胞的DNA复制系统进行自主复制 复制方向性:纯单向性(ColEI);纯双向性(F质粒);
既有单向又有双向性(R6K)。 根据在每个细胞中的分子数(拷贝数)多寡,质粒可分
为两大复制类型:
• 严紧型复制控制的质粒 1 – 数个 拷贝 stringent plasmid
去除两 个PstI
pBR313
EcoRII片 断去掉
pBR318 酶切
(6.3Kb)
体外重组 pBR322
pBR320 酶切
(4.3Kb)
(2.8Kb)
四、常用质粒载体类型
1、克隆质粒载体 2、表达质粒载体 3、多功能质粒载体 4、穿梭质粒载体
1、克隆质粒载体
克隆质粒载体是指专用于基因或DNA片断无性繁 殖的质粒载体。
pBR322插入失活效应
筛 选 重 组 子 的 示 意 图
Ampr
1)限制酶切 2)DNA重组
无DNA插入
Ampr Tcr
转化
Ampr Tcr
Tc
有DNA插入 外源DNA
Ampr Tcs Ampr Tcs
无菌落
筛选重组子
阳性菌落
Ampr Tcs
提取DNA 电泳
重组DNA
利
BamHI片段(Tcr)
在启动子下游区和ATG(起始密码子)上游区有 一个好的核糖体结合位点序列(SD序列),促进 蛋白质翻译
在外源基因插入序列的下游区要有一个强转录终 止序列,保证外源基因的有效转录和mRNA的稳 定性
表达型载体(expression vector)
特点
• 基因的启动子序列和终止子序列 • 一般无检测标记基因 • 克隆位点是确定的(即位于启动子序列后) • 重组分子用凝胶电泳检出(依赖于分子量差异)。
b
糖苷
X-
CHg2OaH l
HO
O
H OH H
O
H
H
H OH
Cl Br
N
lacZ’
a b-半乳糖苷酶的a-肽段
Cl O Br
N
N
Br Cl
Apr
利 用 菌 落
1)限制酶切 2)DNA重组
无DNA插入
Apr
转化
外源DNA 有DNA插入
Apr
颜
色
Ap r
Apr
筛选重组子
筛
白色菌落
选
重
组
提取DNA 电泳
1、在菌体内将R1drd19质粒(沙门氏菌中R1质 粒的一种变异体)的易位子Tn3(携带有Amp抗 性基因)易位到pMB1质粒上,构成一个较大的 质粒pMB3(13.3Kb)。
pMB3EcoRI* 大肠杆菌
AATT黏性末端环化 pMB8(2.6Kb)
导入
2、从质粒pSC101获得四环 素抗性基因(Tetr)。
建过程力求简单。
大肠杆菌质粒克隆载体pBR322及其衍生 质粒克隆载体的构建
pBR322的构建是质粒载体构 建的一个典范。
pBR322的亲本质粒
• pSF2124,含有Amp抗性基因 • pMB1,含有松弛型ColE1的复制
起点(ori) • Psc101,含有Tet抗性基因
大肠杆菌质粒克隆载体pBR322及其衍生 质粒克隆载体的构建
结构
• 转化单元--宿主细胞转化 • 表达单元--外源基因表达
表达型载体(expression vector)
类型
• Ⅰ型:转录起始区(调控序列+启动子)+ 终止子 • Ⅱ型: 转录起始区终止子 + 翻译起始区(核糖体结合
序列和起始密码子)+ 终止子 • Ⅲ型: 转录起始区 + 翻译起始区 + 信号肽链编码区 +
控制复制起始因子与复制起始位点(ori)的结合
Cop
Rep
Pco
co
p
p
P/Orep re
ori
p
质粒的不亲和性
有时也称为不相容性,是指在没有选择压力的情况下, 两种亲缘关系密切的不同质粒,不能够在同一个寄主细 胞系中稳定地共存的现象。在细胞的增殖构成中,其中 必然有一种会被逐渐地排斥(稀释)掉。这样的两种质 粒称为不亲和质粒。
“元件”(小DNA片断),构建成不同用途的质粒克隆 载体。
三、质粒克隆载体的构建
质粒克隆载体的设计和构建过程的原则
• 选择合适的出发质粒(亲本质粒)。 • 正确获得构建质粒克隆载体的元件。 • 组装合适的选择标记基因。 • 选用合适的启动子。 • 在能达到预期目的的前提下,构建质粒克隆载体的构
具有多克隆位点MCS区
• pUC质粒载体具有与M13mp8噬菌体载体相同的多克隆位点 • 具两种不同粘性末端(如EcoRI和BamHI)的外源DNA片段,
无需借助其它操作而直接克隆到pUC质粒载体上
pUC18 / 19:正选择标记 lacZ’ 的显色原理
pUC18/1 9
Plac MCS
5-溴-4-氯-3-吲哚基-b-D-半乳
子
重组DNA
Apr
2、表达质粒载体
是指专用于在宿主细胞中高水平表达外源蛋白质 的质粒载体
• 根据表达的蛋白是否分泌到细胞外:非分泌型表达载 体(胞内表达载体)和分泌型表达载体
• 根据表达所用的受体细胞:原核细胞表达载体和真核 细胞表达载体
表达载体与克隆载体的区别
强启动子,一个可诱导的强启动子可使外源基因 有效的转录
3. 第三阶段:进一步完善载体功能以满足基因工程克隆中的不同 要求,如M13mp系列载体,含T3,T7,sp6启动子载体,表 达型载体及各种探针型载体。
载体的功能
运送外源基因高效转入受体细胞 为外源基因提供复制能力或整合能力 为外源基因的扩增或表达提供必要的条件
载体应具备的条件
在克隆载体DNA分子合适的位置有一至 多个克隆位点,供外源DNA片段组入克 隆载体DNA分子。
Origin of Replication Hind II
第一节 质粒克隆载体
一、 质粒的一般生物学特性
发现:细菌,偶见于链霉 菌和酵母
独立于染色体之外进行复 制和遗传,又依赖于宿主 编码的酶和蛋白质来进行 复制和转录。•
比病毒还简单的亚细胞结 构,一旦离开寄主细胞则 无法繁殖。
一、质粒的一般生物学特性
在宿主细胞内具有较高的拷贝数。
• 一般一个细胞内可达到15个,而在蛋白质合成抑制剂存在条件 下,可达到1000-3000拷贝,如氯霉素。
CAP protein binding site -
591-554 (compl. strand); mRNA (LacZ) starts at nt position 507 (compl. strand); lac repressor binding site 507-487 (compl. strand).
以大肠杆菌的质粒为例:
• ColE1、pMB1 拥有相似的复制子结构,彼此不相容 • pSC101、F、RP4 拥有相似的复制子结构,彼此不相容 • p15A及其衍生质粒拥有相似的复制子结构,彼此不相容
质粒迁移
革兰氏阴性菌的质粒可分成两大类:
• 接合型质粒 能在天然条件下自发地从一个细胞转移到另一个 细胞(接合作用),如F、Col、R质粒等
质粒是细菌染色体外能够自主复制的 环形双链的DNA分子
在宿主细胞内,质粒一般以超螺旋共 价闭合环DNA分子(ccc-DNA)的 形式存在。
在体外理化因子作用下,质粒可以成 为开环DNA分子(oc-DNA)或线形 DNA分子(l-DNA)。
在变性条件下,质粒可成为单链DNA 分子(ss-DNA)。
载体的功能及特征
一、发展概况
1. 第一阶段(1977年前):天然质粒和重组质粒的利用,如 pSC101, colE1, pCR, pBR313和pBR322 (1977, Bolivar et al)
2. 第二阶段:增大载体容量(降低载体长度),建立多克隆位点 区和新的遗传标记基因。如pUC系列载体。
终止子(常称之为表达分泌型载体)
ATG
I
II III
转录起始 翻译起始 信号肽
IV
成熟蛋白质
TAA
V
转录终止区
I II III
CS
I
V
CS
I
II
V
ATG CS
I
II III
V
CS--cloning site
• 松弛型复制控制的质粒 10 个 拷贝以上 stringent plasmid
质粒的自主复制性:拷贝数的控制机制 – 质粒DNA复制启动控制
控制复制引物与模板的结合
RNA II 3’
5’
RNA I
ori
E.coli ColE1 plasmid
复制方向
5’
3’
rop
(+) Rop
质粒的自主复制性:拷贝数的控制机制 – 质粒DNA复制启动控制
• pBR322质粒 • pUC系列的质粒载体