三、聚合应
在印迹分子和交联剂存在的条件下，对单体 进行聚合。聚合过程主要通过自由基引发，其引 发方式主要有高温热引发和低温光引发。具体的 聚合条件选择则视具体情况而定。影响聚合反应 的因素很多，如交联剂和溶剂的种类、单体浓度、 聚合温度、光照等。
溶剂在分子印迹聚合物的制备（尤其是在非共价 法的制备）中发挥着重要的作用。在聚合过程中, 溶剂的某些性质控制着非共价键结合的强度，同 时也影响聚合物的形态。溶剂的极性越大，产生 的识别效果就越弱。这是由于溶液的极性决定着 非共价作用的强弱。因此，非共价法多在氯仿、 甲苯等低介电常数的有机溶剂中进行，而共价法 则多在水、醇等介电常数较高的溶剂中进行。一 般来说，低温下单体与印迹分子能形成更加有序、 稳定的聚合物，且选择性更好。
四、印迹分子的去除
采用萃取、酸解等手段将占据在识别位点上 的绝大部分印迹分子洗脱下来，通常采用一些 高 极 性 溶 剂 反 复 洗 涤 MIP 以 彻 底 除 去 印 迹 分 子 。 洗涤过程非常缓慢，需要耗费大量的溶剂。所 以，寻求一种快捷、彻底的洗涤方法对于简化 MIP的制备过程非常重要。
五、后处理
在适宜温度下对印迹分子聚合物进行成型加 工和真空干燥等后处理。所制备的MIP应具备良 好的物理化学和生物稳定性、高吸附容量和使 用寿命、特定的形状尺寸，以获得较高的应用 效率。
生物碱、维生素、蛋白质、激素、辅酶、药物等， 它们均已成功地用于分子印迹的制备中。
二、印迹分子与功能单体之间的相互作用
根据单体与印迹分子作用力的类型和大小预测， 可以合理地设计、合成带有能与印迹分子发生作用 的功能基的单体。功能单体的选择主要由印迹分子 决定，它必须带有能与印迹分子发生作用的功能基， 如与印迹分子成共价键的基团、产生氢键的基团或 能与印迹分子发生离子交换作用的基团等，且在反 应中它与交联剂分子处于合适的位置才能使印迹分 子恰好镶嵌于其中。