利用MEGA 4构建分子系统进化树－图示
1、利用Clustal X软件对序列进行多重比对，保存的文件为aln格式。

2、利用MEGA 4软件将aln格式文件转换为meg文件，操作如下：
File按钮下的Convert To MEGA Format命令
点击后出现对话框，如下：
点击OK按钮，出现以下界面：
点击“保存”按钮，则aln文件成功转换为meg文件并保存在同一目录下。

3、关闭转换文件窗口，回到MEGA 4程序的主窗口，如下图：
点击“Click me to activate a data file”按钮，选择之前转换好的meg文件并打开，如下图：
选择所输入的数据类型（核酸or蛋白），之后点击OK即可。

此时，在MEGA4主程序窗口的底部出现了我们所输入的文件名（如下图），之后就可以构建分子系统进化树了。

4、通常选择邻接法（neighbor-joining，NJ）构建分子系统进化树。