一、脂与脂代谢1.亚油酸、亚麻酸、硬脂酸、油酸结构式 P55脂肪酸常用简写法表示,其基本原则是:先写出碳原子的数目,再写出双键的数目,最后写明双键的位置,如:18:1(9),是指一个在9-10碳原子间含有一个双键的十八碳不饱和脂肪酸,其中,碳原子的编号是从羧基端开始的,羧基上的碳原子编号为C-1。
2.脂肪酸降解与胞液合成?3.脂肪的皂化值与碘值的定义与概念皂化值:1g脂肪完全造化所需KOH的毫升数单位:mg/g思考:脂肪A皂化值A分子量WA脂肪B皂化值B分子量WB若分子量A>B,求皂化值之间的关系碘值:100g脂肪所吸收的碘的克数单位:g/100g是衡量脂肪营养的指标4.必需脂肪酸定义许多天然的油脂中含有动物体(包括人体)自身不能合成的而又是营养上必需的多不饱和脂肪酸(又称必需脂肪酸,essential fatty acids)如亚油酸和亚麻酸5.脂肪酸β氧化的能量计算计算题脂肪酸在β氧化中,每形成一分子乙酰CoA就使一分子FAD还原为FADH2,并使一分子NAD+还原为NADH+H+,FADH2进入呼吸链,生成1.5分子ATP,NADH+H+进入呼吸链,生成2.5分子ATP。
因此,每生成一分子乙酰CoA,就产生4分子ATP。
乙酰CoA进入三羧酸循环彻底氧化,生成CO2和H2O,产生10分子ATP。
以软脂肪酸β-氧化为例,软脂酰CoA须经7次β氧化循环,可将软脂酰CoA转变成8个分子的乙酰CoA。
计算:7FADH2 和7(NADH+H+)进入呼吸链进一步氧化生成:7×1.5 ATP + 7×2.5 ATP = 28ATP8分子的乙酰CoA进入三羧酸循环彻底氧化生成:8×10 ATP = 80ATP因此,软脂酸经b-氧化完全氧化生成CO2和H2O生成108个ATP。
由于软脂酸转化为软脂酰CoA时消耗1分子ATP中的两个高能磷酸键的能量,因此净生成ATP的数量为108-2 = 106个。
6.脂肪酸氧化与合成代谢的异同点二、核酸与核苷酸代谢1.ATP、AMP、ADP结构 GMP、GDP、GTP结构看笔记GMP为鸟苷酸 AMP为腺苷酸 ATP为三磷酸腺苷酸区别为腺嘌呤换为鸟嘌呤2.Tm值定义,Tm值与四种核苷酸的关系Tm值:一般将能使DNA双螺旋结构失去一半时的温度称为该DNA的熔点或熔解温度Tm。
DNA的Tm值一般在70-85︒C之间。
G-C含量越高,Tm值越高,二者呈正比关系。
这是因为G-C碱基对比A-T碱基对更为稳定的缘故,所以可以用Tm值推算DNA分子中的G+C含量,其经验公式为:(G+C)%=(Tm-69.3)⨯ 2.443.嘌呤嘧啶核苷酸合成的原料胞嘧啶,脲嘧啶,胸腺嘧啶,鸟嘌呤,腺嘌呤脱氧核糖,核糖4.质粒及应用质粒:是一种寓于微生物细胞内染色体外的裸露、双链、环状DNA分子,小的不足1500bp,大的可达100k。
质粒能进行独立复制并保持恒定遗传特性,在天然条件下可以通过细菌结合从一个细胞进入另一个细胞。
它在基因工程和分子生物学研究中具有十分广泛的用途。
5.t-RNA结构特点笔记三叶草结构6.PCR技术基本原理:PCR是在试管中进行DNA复制反应,基本原理与体内相似,不同之处是耐热的Taq酶取代DNA聚合酶,用合成的DNA引物替代RNA引物,用加热(变性)、冷却(退火、保温(延伸)等改变温度的办法使DNA得以复制,反复进行变性、退火、延伸循环,就可使DNA无限扩增。
每一次循环使反应体系中的DNA分子数增加约一倍。
理论上循环几次,就增加为2n倍。
目的是基因的分离。
分为基因文库法和酶促合成法。
PCR属于酶促合成法。
简单的说,酶促法就是将基因复制到一定数量,便于分离(个人理解)7.AMP合成过程(文字描述,不需要方程式)P419 课件真恶心1.次黄苷酸的合成:首先在磷酸核糖焦磷酸合成酶的催化下,消耗ATP,由5-磷酸核糖合成PRPP(1-焦磷酸-5-磷酸。
PRPP再经过大约10步反应,合成第一个嘌呤核苷酸——次黄苷酸(IMP)。
2.腺苷酸(AMP)及鸟苷酸(GMP)的合成:IMP在腺苷酸代琥珀酸合成酶的催化下,由天冬氨酸提供氨基合成腺苷酸代琥珀酸(AMP-S),然后裂解产生腺苷酸(AMP)。
IMP也可在IMP脱氢酶的催化下,以NAD+为受氢体,脱氢氧化为黄苷酸(XMP),后者再在鸟苷酸合成酶催化下,由谷氨酰胺提供氨基合成鸟苷酸(GMP)。
8.脱氧核糖核苷酸合成过程(文字描述)什么二磷酸水平?找不到!P422三、蛋白质与酶1.L型氨基酸(丙,天冬,谷,赖,丝,亮)L型氨基酸的结构通式2.氨基酸和蛋白质等电点定义蛋白质等电点:调节溶液的pH值,到达一定pH时,蛋白质分子主要以两性离子形式存在,所带正负电荷数相等,其净电荷为零,这时的溶液pH称为蛋白质的等电点,以pI表示氨基酸等电点:氨基酸的带电状况与溶液的ph值有关,改变ph值可以使氨基酸带上正电荷或负电荷,也可以使他处于正负电荷数相等即净电荷为零的兼性离子状态,此时的ph值为氨基酸的等电点。
3.蛋白质一二三四级结构及相互关系(乱七八糟)1.蛋白质的一级结构蛋白质的一级结构又称为共价结构,蛋白质的一级结构是指肽链中的氨基酸顺序。
然而事实上,蛋白质一级结构研究的内容不仅包括肽链中的氨基酸顺序,还包括了蛋白质分子中多肽链的数目,每条肽链的末端氨基酸残基的种类,多肽链内和链间二硫键的位置等。
蛋白质的一级结构对于蛋白质的结构和功能具有特别重要的意义,一级结构决定了空间结构,一级结构决定了蛋白质的生物功能2.蛋白质的二级结构蛋白质的二级结构是指肽链的主链借助氢键有规则的卷曲折叠成沿一维方向具有周期性结构的构象。
因而它研究的内容是肽链的共价主链,而不涉及侧链R基团的空间排布。
二级结构的基本类型尽管蛋白质的三级结构千变万化,但基本的二级结构种类却很少,主要有:a-螺旋、β-折叠、β-转角、无规卷曲等。
3.蛋白质的三级结构球状蛋白质在一级结构和二级结构的基础上,再进行三维多向性盘曲形成近似球状的构象被称为蛋白质的三级结构。
二级结构讨论的是共价主链的构象,三级结构则涉及主链和侧链所有原子和原子团的空间排布关系,但不讨论亚基间和分子间的排布。
蛋白质的高级结构是由一级结构决定的,其中二级结构决定于氨基酸的短程顺序,三级结构决定于氨基酸的长程顺序。
三级结构的共同特征球状蛋白质的三级结构往往由多种二级结构组成,一条肽链通过部分α-螺旋、部分β-折叠、部分β-转角和部分无规卷曲形成紧密的球状构象。
形成三级结构时,蛋白质分子中的亲水性氨基酸残基多位于分子表面,与水分子之间形成氢键,在蛋白质分子周围形成一层水化层,使蛋白质能溶解于水;而疏水性氨基酸残基多位于分子内部形成疏水核,基团之间的疏水相互作用稳定了蛋白质构象。
蛋白质三级结构的稳定性主要依靠次级键来维持,其中疏水相互作用起了很重要的作用,此外,氢键、盐键、二硫键和范德华力对三级结构的稳定性也有一定的作用。
对于仅由一条多肽链组成的蛋白质来说,三级结构是其最高的结构层次,形成三级结构以后这类蛋白质就具有了生物活性。
4.蛋白质的四级结构由两个或两个以上的三级结构单位缔合而成的,这些蛋白质被称为寡聚蛋白,寡聚蛋白分子中的每个三级结构单位称为一个亚基或亚单位。
蛋白质的四级结构是指寡聚蛋白分子中亚基与亚基在空间上的相互关系和结合方式,亚基的数目和种类也是四级结构研究的内容,但不涉及亚基本身的构象一级结构、二级结构、三级结构和四级结构,其中蛋白质的二级、三级、四级结构统称为高级结构或空间结构。
(1)一级结构蛋白质的一级结构(primary structure)又称为共价结构,蛋白质的一级结构是指肽链中的氨基酸顺序。
蛋白质的一级结构对于蛋白质分子的生物功能至关重要,可以说,是一级结构决定了高级结构,一级结构决定了功能。
(2)二级结构蛋白质的二级结构是指肽链的主链借助氢键有规则的卷曲折叠成沿一维方向具有周期性结构的构象。
α-螺旋(a-helix)、β-折叠(β-sheet)、β-转角(β-turn) 、无规卷曲(random)等略,笔记4.蛋白质变性笔记蛋白质的变性作用:天然蛋白质分子受到某些理化因素的作用,有序的空间结构被破坏,导致生物活性丧失,并伴随发生理化性质的异常变化被称为变性作用。
破坏了蛋白质二三四级结构,一级结构不变,分子量不变可逆变性,不可逆变性物理因素包括:加热、紫外线、超声波、X-射线、高压、表面张力、剧烈振荡、搅拌、研磨,等等。
化学因素包括:酸、碱、有机溶剂、重金属盐、变性剂、去污剂、生物碱试剂,等等。
5.蛋白质分离技术?SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法凝胶过滤层析亲和层析电泳:在外电场的作用下,带电颗粒将向电性相反的电极移动,这种现象称为电泳,利用这种现象对不同分子进行分离的技术称为电泳技术。
按其凝胶的组成系统可分成:(1) 连续凝胶电泳:只用一层凝胶,电泳体系中缓冲液pH值及凝胶浓度相同,带电颗粒在电场作用下,主要靠电荷及分子筛效应;(2) 不连续凝胶电泳:采用相连的二部分凝胶,小部分是浓缩胶,大部分是分离胶。
这两部分凝胶的浓度(孔径大小)、pH值(6.7和8.9)。
(3) SDS—凝胶电泳:在聚丙烯酰胺凝胶中加入 SDS(十二烷基硫酸钠)凝胶:多空网状结构6.变构酶,诱导酶,同工酶,多功能酶,限制性内切酶,羧态酶,胺态酶变构酶:别构酶也称为变构酶,它是一种可以通过与效应物的作用,使自己构象发生改变,从而活性发生变化。
(又叫别构酶,是指具有别构效应,能快速改变酶活性的寡聚酶)诱导酶:(induced enzyme)是在环境中有诱导物(通常是酶的底物)存在的情况下,由诱导物诱导而生成的酶。
同工酶:[isozyme;isoenzyme] 生物体内催化相同反应而分子结构不同的酶。
多功能酶:通常一种酶只能专一性地催化一个化学反应,然而某些酶能催化2~6个化学反应,故把这一类酶称为多功能酶。
限制性内切酶:限制性核酸内切酶(restriction endonuclease):识别并切割特异的双链DNA序列的一种内切核酸酶。
胺态酶:从多肽的游离氨基端开始水解,逐个切下氨基酸分子羧态酶:从多肽的游离羧基端开始水解,逐个切下氨基酸分子7.求酶活,比活力,米氏公式太多了,看笔记,书P251。
8.关于中间产物学说,诱导契合学说课件描述中间产物学说:酶与底物先络合成一个中间产物(过渡态),然后此络合物再进一步分解,成为产物和游离态酶。
诱导契合学说:酶的活性中心与底物有相似的结构,当酶分子与底物分子接近时,酶蛋白受底物分子诱导,其构象发生有利于底物结合的变化,酶与底物在此基础上互补契合进行反应。
9.为何酶有专一性高效性?专一性取决于酶分子活性部位必需基团个原子的空间排布以及酶与底物之间的多点结合。