总的来说就是两步，一个就是把sof文件转成JIC文件，然后在jtag模式下选择jic文件即可。

在已经有sof文件的基础上的具体步骤
第一步：
使用quartus软件产生一个包含FPGA配置数据的SRAM目标文件(.sof)
第二步：
quartus菜单，选择“File --> Convert Programming Files”
第三步：
在输出编程文件里的编程文件类型（Programming file Type）列表中选择JTAG间接配
置文件（JTAG Indirect Configuration File (.jic)）。

第四步：
在配置器件列表里（Configuration device），选择你想对之编程的目标EPCS配置器件。

我们这里选择EPCS4，对应配置文件大小是4M
第五步：
在文件名选择栏(File name:output_file.jic)，指定你想生成的JIC文件的名字(把output_file 换成你想要的名字)
第六步：
选择高级，在弹出的窗口中再选择不检测ID和不检测CONF_DONE信号
第七步：
指定将要编程的EPCS的FPGA目标器件，选择Flash Loader项，点击Add Device。

在弹出的窗口中选择对应的器件
第八步：
指定一个现有的SRAM目标文件(.sof)来转换成JIC文件，在Input files to convert下面选择SOF Data，点击Add File...。

第九步：
点击Generate，生成JIC文件
第十步：
加载JIC文件到flash中
1）选择JTAG模式
2）添加新生成的JIC文件
3）在编程列表中EPCS器件的同一行，开启编程/配置选项4）开始编程。