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生物信息学研究概述汇报PPT


01 功能基因组学
后基因 组阶段 02
(2001--
蛋白质组学
03
生物信息学快速发展
研究内容
生物信息学数据库构建 同源性序列查找 蛋白质结构分析
非编码区分析
系统发育分析
研究内容---数据库构建
基因序列数据库 常用: GenBank、 DDBJ、Bio Sino 和 EMBL 蛋白质结构数据 库 常用: PDB、NRL-3D、 HSSP 和 SCOI 氨基酸序列数据 库 常用: PIR、MIPS、Tr EMBL 和 SWISS-PROT 基因组学数据库 常用: Gen Cards 和 GDB
学领域中生物学信息的采集、存储、处理、传 播和分析的学科。
概述---工具
软件
计算机 互联网
概述---内容
核酸与蛋白质分析
1
生物信息学数据库的构
从分子生物数据库中提 取和解读具有生物学意 义的信息
2
3
建与检索
概述---目的、意义
生物信息学旨在对大量的原
始生物学数据进行存储、编 辑、处理、传播和分析,归 纳数据中的变化规律,揭示 数据中所蕴含的生物学奥秘,
研究内容---蛋白质分析
结构等级---测定方法 一级结构--质谱分析; EDMA; N 降解法 二级结构--傅里叶红外光谱法 圆二性色谱法; 三级结构--三维电镜技术; 核磁共振技术; X 射线衍射法
分析内容 蛋白质序列的理化性 质分析、 亲疏水性分析、 跨膜区结构预测、 卷曲螺旋和翻译后修 饰位点预测, 以及蛋白质二级结构 预测和信号位点分析、 蛋白质结构域分析、 蛋白质三维结构模拟、 蛋白质超家族分析
生物信息学研究概述
生物医学工程
展示人:XXXX 学 号:XXXXXXXX
生物信息学概述 生物信息学发展简史
目录
contens
生物信息学研究内容
生物信息学应用前景
生物信息学研究任务
概述
概念 工具 内容 目的、意义
概述---概念
生物信息学( Bioinformatics )是一门结合
信息学、数学和计算机技术,主要研究生命科
(1990前)
03
遗传密码子的发现
简史---基因组阶段
该阶段主要 研究结构基 因组学、建 立生物信息 学网络数据 库、开发大 规模基因测 序和交互界 面工具
01
基因组 阶段
(19902001-
人类基因组计划开启
02 克隆羊多莉的诞生
2005)
03
人类基因组计划完成
简史---后基因组阶段
该阶段主要 以海量分子 生物数据进 行基因组、 蛋白组等组 学分析,在 系统上研究 基因或者蛋 白的生物学 功能
01
02
03
04
研究内容---同源序列查找
少量、短序列
大量、长序列
点阵图法、 Needleman -Wunsch 算 法 和 Smith -Waterman 算法
BALST 算法、 FASTA算法、 patternhunt er 算法及相 应的改进方 法
常用软件: Clustal V、Bio Edit 和 DNAMAN等
应用前景
鉴定单基因疾病的关键致病基因 研究人类复杂疾病的发生机理 疾病预防、诊断、治疗等 农业、工业生产(药物设计)等
研究任务
相关理论研究
软件的使用与学习
集成数据库的管理与使用
生物数据质量鉴控
加强多学科专家之间的沟通、合作
展示人:XXXXXXX
同时为试验设计提供理论支
持和指导,缩短科研周期。
生物信息学发展简史
前基因组阶段
基因组阶段
后基因组阶段
பைடு நூலகம்
简史---前基因组阶段
该阶段主要 集中于构建 生物信息学 数据库,开 发检索工具、 建立序列比 对算法、基 因序列和蛋 白质序列的 分析
01
孟德尔遗传定律的发现
前基因 02 DNA双螺旋结构的发现 组阶段
常用软件 在线软件有--Swiss-model、 PROCHECK、 Molprobity 本地软件有--Modeller、 TMHMM 、 VMD
研究内容---非编码区分析
非编码区通常具有降低编码区碱基突 变率的作用,还具有调控编码区基因 转录的作用。非编码区往往具有启动 子、终止子、调控基因和 DNA 聚合酶 结合位点。 非编码区分析是利用生物信息学的方 法对非编码区的 DNA 片段进行定性、 定量,以及对结构进行剖析,找出调 控编码区基因转录机理的过程
研究内容---系统发育分析
系统发育分析是通过已知序列分析推 断或评估物种间进化关系的过程,具 体是通过系统发育树的构建来实现。 常见的系统发育树构建方法有相邻连 接法(NJ)、非加权配对组算数法 (UPGMA)、最小进化法(MJ)、 最大简约法(MP)和最大似然法 (ML) 系统发育树构建软件有MEGA、 DNAstar、PAUP、PHYLIP、MOLPHY、 PAML。
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