Discovery Studio Visualizer精简教程
哈尔滨医科大学
解鸿波
PDB: 3K9F
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Ctrl+H
氨基酸残基
氨基酸相应性质
Ctrl+D
线型显示必须先
棍型显示选择原
子
球棍显示
线型显示
棍型显示必须先
选择原
线型条带子
条带
改变背景颜色
View > Toolbars > View View > Toolbars > Sketching 区旋平放画分子工具
域转移大（不推荐使用）选缩
择小
PDB编号代表晶格
侧链编号
按字母顺序排列
*不同部分蛋白（或DNA
等大分子）
点加号+
查看侧链
所含有氨
基酸残基
点加号+
查看氨基酸所
含有原子
氨基酸及编号
字母重新循环配体分子去除对勾
表示隐藏其他分子
例如水等
显示配体和周围形成的氢键作用
2. Structure > Monitor > HBonds
1. 仅显示配体
分子，并双击
选中，分子显示为黄色。

3. 显示和配体可以形成氢键的氨基酸序号及相应原子
将氨基酸以棍状形态显示，Stick
默认氢键为绿色size调整为0.10和配体以示区别，并
不显示其带状二级结构
选中分子，查看其他相互作用Tools > Analyze Complexes > Show 2D Diagram
Structure > Surface > Add
Structure > Monitor > Distance 选中两个原子，测距离
单位为（Å）
选中两根化学键，测角度
查看蛋白序列
Chart > Ramachandran Plot
选择原子> 右键> Attributes of … 查看原子坐标
Build and Edit Nucleic Acid工具
Build and Edit Protein工具（不是蛋白三维结构，需要做从头预测）
Create Pharmacophore Manully工具（根据已知分子构建药效团，但不实用）
写字板打开*.pdb文件查看信息，内附原子坐标，原子类型及氨基酸序号等信息。

HIV-1蛋白酶
No.1 PDB code: 3OXC
沙奎那韦（Saquinavir）
p38 MAP激酶
PDB code: 3GCS No.2
索拉菲尼（Sorafenib）
HMG-CoA还原酶
PDB code: 1HWI No.3
氟伐他汀（Fluvastatin）
神经氨酸酶
PDB code: 4KS1No.4
达菲（Tamiflu）
青霉素结合蛋白
No.5 PDB Code: 3ITA
氨苄西林（Ampicillin）。