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基因转录课件


真核生物RNA的转录终止
AAAAAAA· · · · · · 3
mRNA
3加尾
核酸酶 5 3
3 5
AATAAA
GTGTGTG
RNA-pol
转录终止的修饰点
真核生物转录后加工
1.加帽(adding cap): • 即在mRNA的5'-端加上m7GTP的结构。此 过程发生在细胞核内,即HnRNA即可进行 加帽。 • 加工过程首先是在磷酸酶的作用下,将5'端的磷酸基水解,然后再加上鸟苷三磷酸, 形成GpppN的结构,再对G进行甲基化。
• 真核生物转录延
长:与原核生物 类似,但由于存 在核小体的高级 结构,故在转录 延长过程中可观 察到核小体移位
和解聚现象。
• 真核生物转录终止:
在poly A修饰位点的下游存在一组共同序 列AATAAA和GTGTGT……,为转录终 止的识别修饰位点。 在转录越过修饰点后,RNA链在修饰点处
被切断,随即进行加帽和加尾修饰。
可变剪接(Alternative splicing)
可变剪接是指从一个特定的基因转录物中通过利用不同 5 ’、3’剪接位点产生出不同的成熟的mRNA的过程。主 要有四种方式:
(1)利用不同的启动子
(2)利用不同的Poly(A)位点
(3)保留某些内含子
(4)保留或去除某些外显子
4. RNA的编辑、再编码和修饰
• RNA的编辑(RNA editing)
RNA的一种加工方式,它导致了RNA所编码 的遗传信息的改变(如 单碱基突变),特别 是mRNA编辑,是在mRNA水平上信息发生 改变(碱基取代、插入或缺失)的过程
单碱基突变 尿苷酸的缺失和添加
DNA序列
mRNA序列 蛋白质序列
GA
4. 化学修饰
tRNA前体的转录合成
DNA
TGGCNNAGTGC
GGTTCGANNCC
RNA pol Ⅲ
tRNA前体
tRNA前体的切断和剪接加工
tRNA3'-末端-CCA序列的添加
tRNA的碱基修饰 (1)甲基化 如:A Am (2)还原反应 如:U DHU (3)核苷内的转位反应 如:U ψ
• (抗)终止因子
协助RNA聚合酶识别终止信号的蛋白质称为终止因子
(termination factor)。
原核生物中的终止因子蛋白是一种六聚体的蛋白质,亚
基的分子量为50kd。蛋白能识别转录终止信号,并与 RNA紧密结合,导致RNA的释放。
转录过程
起始 双链DNA 局部解开
启动子 (promoter)
• 有特定的起始和终止位点
RNA转录合成时,只能以DNA分子中的某一段作 为模板,故存在特定的起始位点和特定的终止位点。
特定起始点和特定终止点之间的DNA链构成一个转
录单位,通常由转录区和有关的调节顺序构成。
转录过程
• 参与转录合成的酶和蛋白因子
原料:NTP (ATP, UTP, GTP, CTP)
pGpA
pGpA
GpU 第二次转酯反应 G-OH
UpU
核酶与传统酶的区别:
一般的酶是纯的蛋白质,而核酶是 RNA
或带蛋白的RNA
有的核酶既是催化剂又是底物。而酶仅
催化反应
核酶发现的重大意义:
突破了酶的概念
揭示了内含子自我剪接的奥秘,促进了RNA的研究
为生命的起源和分子进化提供了ห้องสมุดไป่ตู้的依据
由终止因子(因子)识别特异的终止信号,并促
使RNA的释放。
富含 G-C
系列U
A. 不依赖于Rho() 的终止子 A. 依赖于Rho() 的终止子
大肠杆菌两类终止子的回文结构
1.非依赖Rho的转录终止:
模板DNA链在接近转
录终止点处存在相连的
富含GC和AT的区域,
使RNA转录产物形成
寡聚U及发夹形的二级 结构,引起RNA聚合 酶变构及移动停止,导 致RNA转录的终止。
Cap 0
100%
G
A
Guanine-7-methyl-transferase 2`-O-methyl-transferase
A
10~15%
2.加尾(adding tail):
• 这一过程也是细胞核内完成,首先由核 酸外切酶切去3'-端一些过剩的核苷酸, 然后再加入polyA。
• polyA结构与mRNA的半寿期有关。
特点:依赖于特定序列(GU…AG,AU…AC);SnSNP 形成剪接体;转酯反应 • Ⅱ型内含子(核酶)(mRNA,rRNA)(自我剪接) 特点:依赖于特定序列(U…U、U…G等);特殊结 构,自身催化;转酯反应
tRNA的转录后加工
• 主要有以下几种加工方式:
1. 切断
2. 剪接 3. 3’-末端-CCA序列添加
• 真核生物转录起始:
首先由TFⅡD的TBP
亚基识别并结合TATA
盒,然后在其他转录
因子的配合下,与
RNA聚合酶Ⅱ组装形
成转录起始前复合物
(pre-initiation
complex, PIC)。
• RNA聚合酶Ⅱ催化第一个磷酸二酯键形成。
• RNA聚合酶Ⅱ的羧基末端结构域(CTD) 被磷酸化修饰,大部分转录因子脱离,聚合 酶向下游移动延伸RNA链。
并起始转录有关的一些DNA调控序列被称
为启动子(promoter)。
原核生物启动子的保守序列
RNA聚合酶保护区 结构基因
5 3 5 3 -35 区 TTGACA AA C T G T RNA-pol辨认位点 (recognition site) -10 区 开始转录
-50 -40 -30 -20 -10 1
3、RNA的剪接(RNA splicing)
• 真核生物结构基因,由若干个编码区和非编码区互相
间隔开但又连续镶嵌而成,去除非编码区再连接后,
可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质,这些基因
称为断裂基因
A
B
C
非编码区
D
编码区 A、B、C、D
• tRNA
• rRNA
• Ⅰ型内含子(mRNA,rRNA)
(3) (4)
(2)
(1) (1)
(4)脱氨反应 如:A I
rRNA的转录后加工
在高等真核生物中,前体以沉降速率来 命名,命名为45SRNA,真核生物中前 体包括了18S rRNA、5.8S rRNA和28S rRNA序列
rRNA前体的转录和剪接加工
Ⅰ型内含子:hnRNA和 snRNA: 核内带有外显子和内含子编码序列的初级 RNA转录产物称为杂化核RNA (heteronuclear RNA, hnRNA) hnRNA经剪接加工除去内含子编码序列
3 5
10
3 5
T A T A A T Pu A T A T T A Py (Pribnow box)
• 流产转录 • 通过启动子(起始)快:强启动子 慢: 弱启动子
转录起始复合物
RNApol (2) - DNA - pppGpN- OH 3
• 延长
因子从全酶上脱离,余下的核心酶继续沿DNA链移 动,按照碱基互补原则,不断聚合RNA。
剪接体
U1 GU
U1
OH
UACUAAC U2 AG
U1
OH
U2 U4/6 U5
U1 U G UACUAAC AG
U5 U2 U4/6
OH
套索的形成及剪接 1
GU A AG
2
GU
A
AG
套索结构
U G A
AG
1
2
Ⅱ型内含子
• 线粒体与叶绿体的rRNA 中 • 1981年T.Cech和S.Atman 四膜虫 rRNA
模板:单链DNA
酶:RNA聚合酶(RNA-pol)
其他蛋白质因子:如转录因子、终止因子等
• RNA聚合酶
依赖DNA的RNA聚合酶,该酶在单链DNA
模板以及四种核糖核苷酸存在的条件下,
不需要引物,即可从5‘→3’聚合形成RNA。
原核生物中的RNA聚合酶全酶由五个亚基构成,即2'。 亚基与转录起始点的识别有关,在转录合成开始后被释 放;余下的部分(2')被称为核心酶,与RNA链的聚 合有关。
• 核酶(ribozyme):是指一类具有催化功
能的RNA分子,通过催化靶位点RNA链中
磷酸二酯键的断裂,特异性地剪切底物
RNA分子,从而阻断基因的表达
锤头型核酶的二级结构和空间立体结构示意图
剪接机制
外显子1 内含子 外显子2 GpU 第一次转酯反应 U-OH
UpA
pG-OH (ppG-OH, pppG-OH)
The 3` ends of mRNAs are generated by cleavage and polyadenylation;The sequence AAUAAA is necessary for cleavage to generate a 3` end for polyadenylation.
2,依赖 Rho因子的转录终止
DNA 序列缺乏共性,不能形成强的发卡结构
ATP
6聚体, 具有 NTP酶 和解螺旋酶
真核生物的转录过程
真核生物启动子保守序列
参与转录位点确定起始
控制转录起始频率
• 在远离受控基因处存在的,能够增强基因转录活性的调控 序列称为增强子(enhancer)。增强子特点: 远距离效应;无方向性;顺势调控;广泛性,相位性
转录
DNA
RNA
基本特点
• 不对称性
以双链DNA中的一条链作为模板进行转录,从而 将遗传信息由DNA传递给RNA
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