蛋白的提取和定量
肺组织用预冷1×TBS洗净后,加入含PMSF的RIPA buffer(冰上操作,310ul,决定未来的蛋白浓度和蛋白液体积),50-60mg肺组织砸碎放入1.5ml离心管,冰上孵育1h,10000转4℃离心10min,转上清至新管。
裂解液分装后保存于-70℃
蛋白质定量:BCA蛋白测定法
①根据样品数量,按50体积BCA试剂A加1体积BCA试剂B(50:1)配制适量BCA工作液,充分混匀。
BCA工作液室温24小时内稳定。
②完全溶解蛋白标准品(BCA试剂盒中,BSA原浓度2mg/mL),稀释到1mg/mL。
③将标准品按0,2,5,10,15,20,25 ul标准品孔中,加蒸馏水稀释标准品的
④加样品2uL加到96孔板的样品孔中,加蒸馏水23微升。
⑤各孔加入200微升BCA工作液,37o C放置30分钟。
同时打开酶标仪预热。
注:也可以室温放置2小时,或60o C放置30分钟。
BCA法测定蛋白浓度时,吸光度会随着时间的延长不断加深。
并且显色反应会因温度升高而加快。
如果浓度较低,适量在较高温度孵育,或延长孵育时间。
⑥测定A570的波长,根据标准曲线计算出蛋白浓度。
⑦计算调蛋白时所需TBS和RSB的体积(调所有样品浓度至3-5ug/ul):
总体积=蛋白体积*蛋白浓度/3(ul)
RSB=1/5*总体积(ul)
TBS=总体积-RSB-蛋白体积(ul)
先加RSB(对蛋白有保护作用),后加TBS。
最后放于-70℃保存。
Western Blot
SDS-PAGE
1. 玻璃板:注意对齐、夹紧,防止漏出,短板朝前。
灌至距绿线1cm左右,用dd水封顶,放置30-40min。
状况好时往往能观察到
水与胶的界限。
4. 分离胶凝固后,配制浓缩胶。
将水倒掉,灌好浓缩胶,立刻插入梳子,等待40min。
在此期间,打开水浴锅(100℃)
注:此步后可停止,将胶连同梳子放入4℃保存一夜,若保存时间较长,为防止水分流失,可加盖湿润的滤纸和保鲜膜。
5.电泳前准备好:待测蛋白、Marker、1*running buffer。
蛋白在沸水中煮3-5min。
(第二次后不用煮沸)
6.拔梳子,立即用1*running buffer冲洗孔道(用塑料吸管)。
7.将玻璃板取出,固定于电泳槽(短面冲里-相对),也要牢固,可先将电泳液倒入两玻璃板槽间观察是否渗漏。
注:标记号1、2板及左右。
8.固定好后,加样。
跑道号码加入物质及体积
1 3.5ul Marker (thermo #26616)
2-10 10ul Sample
9.玻璃电泳槽倒满1*running buffer,电泳液没过电泳槽中的钢丝即可,注意标记好带的顺序。
10.电极
黑对黑红对红,电压100V电泳1-1.5h,等蓝色条带跑出后再等待10-15min。
蓝带对应8KD蛋白,根据蛋白样品分子量决定具体的电泳时间,确保不让目标蛋白抛出凝胶。
一般可等蓝带完全跑出凝胶后10多分钟停止电泳。
Western-ECL
一、转膜
1. 玻璃板取出,用跷胶片打开,标记好切胶位置,将浓缩胶和分离胶上的空白切掉。
切胶时不要划,要切。
注意,在右上角切口标记,量胶的长、宽。
2. 将切好的胶(粘在一片玻璃板上)浸入Transbuffer,晃动使胶脱离下来,放上摇床,中速30min。
3. 根据胶的长宽剪滤纸和PVDF膜(不能折,不能用手碰),PVDF膜的右上角与胶一样切口。
滤纸不能太大,膜可以大一点。
PVDF膜甲醇激活,transbuffer 摇床10min。
将滤纸浸入Transbuffer。
(Transbuffer不倒掉)
4. 转膜装置:
①滤纸可以采用学校的大张滤纸剪裁,四层叠在一起使用
②三明治由低层向高层为:四层滤纸――膜――胶――四层滤纸,大小要一致
③滤纸、膜、胶都需要用TRANS BUFFER浸透,上面滴加TRANS BUFFER
④ 100伏转印60分钟。
⑤如果转膜结束后不立即做,可以用TRANS BUFFER洗一洗,PBST洗一洗,
晾干,保鲜膜包好后置四度保存。
再用之前,甲醇激活,再用TRANS BUFFER洗一洗,PBST洗一洗。
即可封闭
二、杂交
1. 将10*TBS稀释至1*(100ml→1000ml),加入1ml Tween 20(0.1%),即TBST。
(Tween较粘稠,把枪头剪掉一块。
)
2.配封闭液,脱脂奶粉5g,用量筒加100ml TBST,一般50ml足够(2.5g脱脂奶粉,TBST50ml。
)
3.将PVDF膜用PBST洗一下,根据Marker分子量切带(在右上角切口标记,
一定要在平的地方切)。
* 若此时停止当日试验,可将NC膜放在保鲜膜上晾干,包好放入冰箱4℃。
待使用时,用PBST洗一下,放入封闭液。
4.正面朝上放入脱脂奶粉中封闭1h,放在摇床上。
配杂交液:用小瓶称0.2g BSA,用量筒加入PBST20ml。
5.杂交完毕后,用TBST略洗一下膜,加入杂交液将小条没过(3ml即可,可视情况而定)
6.加入一抗,摇床2h。
过夜。
7.取出膜,用洗膜液洗3次,5-15min/次。
计算杂交液体积,若不足再配。
8.洗完三次膜加入二抗,摇床1h
9.用洗膜液洗3次,5-15min/次。
三、发光反应
准备:发光板、滤纸、小镊子、1000μl加样器、发光液1,2(按1:1的量混合先白瓶后黑瓶,混匀,注意换枪头)EP管。
显影:将洗完的PVDF膜放入PBST保持膜湿润,排好条带,记住顺序,用滤纸略吸水,放在发光板上,滴加显影液,用枪头滴在PVDF膜上,等20-30s,发光。
存盘。
发光后,如要回收条带,收回后蒸馏水洗净,加入一抗二抗清除液,没过条带,摇床10min,蒸馏水漂洗5min,三次。
洗净晾干回收。
下次再用继续封闭。
备注:
1. 10×TBS
0.2M Tris base (FW121.14) 12.114g
1.5M Nacl (FW58.44) 43.83g
H2O to 500ml
PH=7.2—7.4 with HCL
TBST 1× TWEEN20 TO 0.05﹪
1L 100ml 10× and 500ul TWEEN20
2. RIPA buffer100ml 可订购
Tris 0.607g 溶于90ml水,HCl调PH=7.5,补足到100ml
NaCl 0.8766g
NP40 1ml,
脱氧胆酸0.5g,
SDS 0.1g,
用时按1:1000加入PMSF
每10ml放入一片PhosSTOP
3. PMSF贮备液
配置0.1M储存液,分子量174.19
0.0174g溶于为1ml无水乙醇(或异丙醇),-20摄氏度保存,用时1:1000稀释;
4. 5*RSB10ml PH=6.8
Tris-HCl PH 6.8 0.312M/L 3.12mM*121.14=0.3779gTris
SDS 10% 1g
β-巯基乙醇25% 2.5ml
溴酚兰0.25% 0.025g
甘油50% 5ml
5. 凝胶储备液(30%Acr/Bise)可订购
acrylamide(丙烯酰胺,有剧毒) 29g
N’,N’-Methylenebisa-crylamide 1g,
加ddH2O至100ml。
6. Gel buffer
分离胶:1.5M Tris—HCl PH: 8.8
浓缩胶:0.5M Tris—HCl PH: 6.8
方法:按照Tris的摩尔质量计算所需摩尔浓度(Tris摩尔质量:121.14)
故分别称取Tris 18.171g、6.057g,加蒸馏水90-95ml,然后用PH
计调节溶液PH,最后定容至100ml。
7. 10%SDS
1g SDS加入蒸馏水10ml
8. 10﹪APS
0.1g过硫酸铵加ddH2O至1ml,新鲜配制
9. 10*电泳缓冲液(running buffer)
Tris 30.3g,
甘氨酸144g,
SDS 10g,
蒸馏水定容至1000ml。
(PH = 8.3)
10.Transbuffer:
Tris 3.03g,
甘氨酸14.4g,加水至850ml,再加甲醇150ml
11.封闭液:脱脂奶粉5g,用量筒加100ml TBST,一般50ml足够(2.5g脱脂奶粉,TBST50ml)
12.洗膜液:0.1﹪Tween20,1×TBS
13.杂交液:1﹪BSA,0.1﹪Tween20,1×TBS 几十毫克几毫升!
14.显影液、定影液
15. 5*PBS
NaH2PO4 ·2H2O 1.362g 8.5m mol
Na2HPO4 ·12H2O 16.295g 45.5m mol
NaCl 43.83g 0.75mol
上述药品定容至1000ml。