实验原理、材料、方法、结果、讨论
琼脂糖凝胶电泳操作步骤
琼脂糖凝胶的制备:溶化,冷却,EB
凝胶板的制备:加梳子,倒胶
样品的制备:样品+1/5体积溴酚蓝
加样:加样端为负极(黑)
电泳:5V/cm
观察:紫外灯下观察,照相
PCR-SSCP
聚合酶链反应单链构象多态性
PCR实验原理:在微量离心管中,加入适量的缓冲液,模板DNA,dNTPs ,Taq DNA 聚合酶,一对引物,以高温变性、低温退火和中温延伸三个反应为一个循环,经过25~35次循环,最终使特异区段的DNA扩增数百万倍,满足分子生物学下游操作。
介绍:PCR-SSCP分析技术是一种DNA单链凝胶电泳技术,它根据形成不同构象的等长DNA单链在中性聚丙烯酰胺凝胶中的电泳迁移率变化来检测基因变异。
该技术已被广泛用于癌基因和抗癌基因变异的检测、遗传病的致病基因分析以及基因诊断、基因制图等领域。
PCR-SSCP分析的基本程序:
1、通过PCR扩增特定靶序列,
2、将扩增产物变性为单链,
3、进行非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳。
PCR反应体系:(单位:微升)
Buffer液: 2.5
引物1: 1
引物2: 1
dNTP: 2
模板DNA: 1
双蒸水: 16.5
Taq DNA聚合酶: 1
非变性聚丙烯酰胺凝胶:
1、30%聚丙烯酰胺(交联度49:1) 4ml,
2、50×TAE缓冲液 0.2ml,
3、1%TEMED 1ml
5、蒸馏水 4.7ml,
4、10%过硫酸铵(AP) 0.1ml
银染步骤:
1、电泳结束,小心取出凝胶,置10%乙醇液中固定5分
钟。
(防止再扩散)
2、置凝胶于1%硝酸氧化3分钟。
(预处理)
3、用双蒸水荡洗凝胶1分钟,换液两次。
4、置凝胶于0.012mol/L硝酸银液中20分钟。
使银离子
与DNA结合。
5、弃去硝酸银,用双蒸水荡洗凝胶1分钟,换液两次。
6、用0.019%甲醛液,含0.28mol/L无水碳酸钠使胶还
原,银离子变成银颗粒而显色。
直至所需的显色深度。
7、置凝胶于10%冰乙酸停止还原反应。
8、弃去冰乙酸,以双蒸水洗涤即可
混匀后灌胶,插入加样梳子。
待胶完全聚合后,拔出加样梳子,安装电泳装置,加入电泳缓冲液(1×TAE),缓冲液应高于加样孔上缘。
结果分析:
单链凝胶电泳时,互补单链迁移率不同,一般形成两条单链带。
PCR产物进行单链凝胶电泳之前,通过加热变性产生单链。
如变性不彻底,残留双链亦可形成一条带.因此,PCR-SSCP分析结果至少显示三条带。
但是,由于一种DNA 单链有时可形成两种或多种构象,检出三条或四条单链带就不足为奇。