2009年度光荣册一、国家科学技术奖（4项）
二、上海市科学技术奖（25项）
三、上海市科技功臣中山医院：陈灏珠教授
四、上海市国际合作奖
蒋家琪（美籍）,(国内合作者:眼耳鼻喉科医院王正敏教授) 五、高等学校科学研究优秀成果奖（7项）
六、中华医学奖（7项）
七、中华预防医学奖（3项）
八、何梁何利基金“科学与技术进步奖”化学系赵东元教授
九、第十一届上海市科技精英
中山医院樊嘉教授
生命学院金力教授
化学系陈芬儿教授
数学学院郭坤宇（提名奖）
十、第七届上海医学科技奖（11项）
十一、明治乳业生命科学奖（7项）
十二、上海药学科技奖
十三、中国发明协会第五届“发明创业奖”
环境科学与工程系陈建民教授
十四、全国生物制药信息中心、医药行业生产力促进中心科学技术奖
十五、上海市优秀发明选拔赛（8项）
十六、第四届中国技术市场协会金桥奖
十七、广东省科学技术奖（第三完成单位）
十八、上海市科技奖励管理工作先进集体
复旦大学
十九、上海市科技奖励与成果管理先进个人科技处李高平
二十、第四届中国技术市场协会金桥奖先进集体复旦大学技术转移中心
二十一、上海高校技术合同管理工作先进集体科技处地方与企业合作办公室
二十二、国家技术转移示范机构
复旦大学技术转移中心。