馆主PM：
气球鬼LV32
耿鬼LV34
梦巫LV36
打赢后得到徽章和技能65，冲浪可以使用
出ＧＹＭ又遇到了帅姐姐。回长寿市，往西走，２１８道路用冲浪来到美央市。商店上方那个房子是忘光光老爷爷的家，可以在他这里忘记密传机的技能。桥上遇到对手挑战。
对手PM：
椋鸟LV31
赫拉克罗斯LV30
对手主要PM LV35
不确定PM LV49
不确定PM LV49
赫拉克罗斯LV50
卡比兽LV51
对手主要PM LV53
然后就是系列传统的挑战４天王＋冠军。４天王分别是虫地火超。
虫系天王
毒粉蝶LV53
狩猎凤蝶LV53
女王蜂LV54
赫拉克罗斯LV54
毒龙蝎LV57
地系天王
呆呆蝾LV55
**鲶鱼LV55
胡说树LV56
隆隆岩LV56
不确定PM LV32
不确定PM LV32
又有ＧＹＭ，是在升降板上飞来飞去，多走几次就能破解
馆主PM：
古铜镜LV36
大钢蛇LV36
壁垒龙LV39
打赢获得徽章和91号技能机
刚从ＧＹＭ出来，对手就叫我们上图书馆。来到图书馆第三楼，博士和孙子也在。话说了一半，突然**，出来看个究竟。博士说是银河团的邪恶计划正在实行中，让我们分别去调查三个湖。这次飞到野濑市右边的海滩上面，路口的挡路的两人已经不在了，进入律诗湖畔。
然后就是打银河团老大了，不过还好打败干部后会回复。
银河团老大PM：
头领鸦LV45
暴鲤龙LV45
叉字蝠LV46
玛狃拉LV48
打败他后就是艰苦的神兽捕捉战。这作的神兽比前作的古拉顿海皇牙还要具有攻击性，小心应付啊。
捉到神兽后博士和孙子来了，废话完后可以离开了。记得离开前先去捉神兽那地方的上方拿一个道具，作用是让神兽本系技能威力上升
往东来到２０９道路，河边有个钓鱼大叔可以要到好钓竿…往北有很多训练师。中途有个坟墓，进去练级吧。最顶层有密传机０４怪力拿。
出坟墓后再北就是花蕊镇，里面的人和镇名真不符…不过镇里有个培育所，以后有用（生蛋用）。右方有遗迹，里面有未知图腾抓
往北再出发，中途有个饭店，里面可以对战。旁边的路被可达鸭堵了，没办法只有往东走了。２１５道路开始下雨，火系会不利。
湖水被抽干，满地尽是鲤鱼王…进入洞里打败银河团干部。从他（她？）口中得到消息，银河团正在利用三大湖的神秘力量。
然后飞回冠凤镇，往左来到洞穴前，进入，向洞穴的更里面进发。洞里有雾，不过不想拿道具的话不用驱雾也可过。出洞是一个下雪的地方２１６号道路，在这里战斗尽量速战速决，因为雪天每回合不停地少血，在途中会有一个小屋可以回复…顺路走来到２１７号道路，雪会更大，而且老是会陷进雪里。然后路左方会有个房子后面有密传机０８攀岩拿。走出２１７道路，来到金岬市，先打ＧＹＭ吧。这个ＧＹＭ比较烦，在冰上走路不遇到障碍就一直滑行…主要就是想办法把雪球全撞破就可以了。
回家一趟，老妈给了主角一双跑鞋，就可以按Ｂ跑步了，而且这作可以在屋子里跑步。在出村往东走来到研究所，博士把主角用的ＰＭ送给主角，对手也得到了一个ＰＭ。然后博士孙子给主角介绍了几个建筑物。这时孙子（直接这样叫吧。）说有事让主角回家，没办法只好听他的。回家后得到日记本。这时对手老妈也赶过来，并给主角一包裹让主角送对手。然后就可以正式出发了。来到第２城市往北走看到孙子，他会教我们怎么捉ＰＭ并给主角５个球。再往北走就会开始ＮＰＣ对战。
走出这段路，到达冠凤市。中间有个有壁画的洞穴，把门口的银河团小鬼Ｋ了吧。打赢后来了个老奶奶，她说那串项链是这里的，那就把项链还她吧。和她一起进洞穴，看到了神秘壁画。作为感谢，老奶奶给了主角密传机０３冲浪，但没徽章用不来…出了洞又遇到那个怪叔叔。
飞回绿城（你要用走的我也不介意），ＧＹＭ现在有人了。是个算数的简单迷题，正确答案依次是：右、中、左、右
然后从２０７号道路进山洞，来到殿元山。不停地进洞出洞来到山顶（这段路真是又臭又长又冷啊）。在山顶看到银河团干部和老大，突然神兽降临了（钻石是钻石兽，珍珠是珍珠兽），它发出了怪光笼罩整个世界。这时对手出现，和主角一起打败了两个干部，然后对手害怕跑了－＿－＃这时被主角救的三只神秘ＰＭ登场，平拂了神兽的愤怒状态。然后就可以去三个湖捉这三个蘑菇头了。神事湖的那个红蘑菇和前作的水都一流一样，会不停地逃跑。
馆主PM：
暴鲤龙LV27
呆呆蝾LV27
救艇浮鼬LV30
打赢后得到徽章和55号技能机
出了ＧＹＭ后看到狩猎区门口有个银河团员，和他对话他跑了，刚要追上去时对手出现。
对手PM：
胖胖椋LV26
对手主要PM LV28
不确定PM LV25
不确定PM LV25
继续追，继续追，追到了海边，海滩，然后再追到他时开战，那实力弱了可以…然后走向上，又遇见漂亮帅姐姐，她把可达鸭的药给了我们，然后回到花蕊镇上面把药给可达鸭们吧，可以从212号路回去，那里很多训练师也物品，是升级赚钱的好地方啊。来到２１０道路尽头把药给了可达鸭，它们就会走了，然后女子又过来给了我们一串奇怪的项链。顺路走没多久就出现迷雾天气，虽然不用驱雾也能摸路走过，但还是推荐用驱雾，毕竟有道具拿，而且迷雾天气命中率那个低啊…
馆主PM：
头盖龙LV14
小拳石LV12
大岩蛇LV12
打赢后得到徽章和技能机７６，碎石可以在地图上用了。
回长寿市，途中会遇到对手。回到那个城市后往北走发现孙子和神秘组织战斗，上去和孙子联手吧－＿－＃打败他们后博士来了告诉主角他们是邪恶组织银河团。
继续往北沿２０４道路走，进去一个洞穴（洞真多）。出洞来到索诺镇，里面有个花店可以拿种树果用的水壶。往东２０５道路走看到一个小萝莉，她让主角帮忙找爸爸。继续往东来到发电站门口，发现有银河团的人，开战吧。灭了他后他跑进发电站把门锁了－＿－＃回索诺镇，上方的花圃中有两个银河团的家伙，灭了他们后得到钥匙。杀回发电站吧！在里面打倒一个干部后救出了小萝莉的爸爸。
从发电厂左边的桥上去，一直向前走。这里很多训练师，在前面有间屋子可以休息恢复HP。然后进入白岱森林。有个御姐会和你组队，这里很多双人战，不过每场战斗过后都能自动恢复。出了森林和御姐分开了。
来到白岱市，有个房子里的老爷爷会给你地下探险的装备。医院上方有个漂亮帅姐姐（四天王冠军）给你密传机０１居合斩。进入ＧＹＭ砸场子吧。里面开始时馆主玩失踪，但不停的虐他手下他就会出现。
解决了神兽事件，来到律诗湖旁，挡路的的胖子不见了，继续向东来到名木市。进去时遇到一个红头男（四天王之一）。来到城市东南方的塔顶，和一个金头ＧＧ对话，他就会回ＧＹＭ（他是ＧＹＭ老大）。然后就可以去挑战最后的ＧＹＭ了。这个ＧＹＭ的迷题是旋转齿轮，踩有绿兰红色标志的齿轮中心就会是齿轮发生转动（蓝色顺时针，绿色逆时针，红的旋转１８０度）——同时其他齿轮也会转动，所以如何产生通路就要靠不断的转动了
沿２０２道路来到长寿市，刚进城看到孙子站在那，和他一堆废话后他闪人了。城里有个学校，进去后发现对手在这，把东西给他后他给了主角地图后也闪人了…出学校后会看到个大叔，他要主角帮忙找３个小丑。３个小丑分别在在商店门口、水池上方大厦门口处、城市左侧飘红旗的大楼门口。全部对话得到３张票子，就可以找大叔要手表了。西边２１８道路路口一个钓鱼大叔可以要到破钓竿。得到手表后就可以往东走了。还没走几步路，对手突然出现挑战。
馆主PM：
樱花种子LV19
草苗龟LV19
假面玫瑰LV22
打赢后得到徽章和86号技能机，可以使用居合斩。出ＧＹＭ后去城市上方的大楼，用居合斩砍树进去。里面发现银河团的人，灭了他们救出自行车店的ＢＯＳＳ，然后就可以去那里拿自行车了。按Ｂ可以换档变速。
往下方进入自行车道２０６道路，路口有博士助手，如果图鉴登陆３０只ＰＭ以上可以拿到学习装置。沿２０６道路走，到２０７道路遇到孙子给我们手表新功能。往东来到一个山洞，里面遇到一个怪叔叔，和他废话。出来后再往东沿２０８道路到达绿城。
口袋妖怪珍珠钻石详细通关流程攻略
刚开始时主角在家里看电视，电视旁还有台ＷＩＩ…到楼下后老妈和你说话，让你去对手家一趟。出门时被叫住，又是堆废话…出门后，左上方就是对手家，进门时无耻的对手冲了出来把主角推倒。想推倒也别这样…他说了句很臭屁的话又回家了，跟他进去去吧。进去后跑上２楼，发现他正在用电脑，他看见主角后又跑了…出了对手家往北走，看见对手在村口等主角，并且不停催主角快点（真心急呀）。和对手一起往西走，来到新奥地区３大湖之一的神事湖，看见博士和他孙子在草丛中废话，等他们离开时发现他们把装ＰＭ的箱子忘在了草丛里，主角和对手正在调查箱子时，野生ＰＭ袭来，马上拿个ＰＭ对战吧！３个ＰＭ分别是草乌龟，火猴子和水企鹅，个人推荐火猴子。野生ＰＭ是ＬＶ２的胖胖琼，几乎没难度…灭掉它后博士孙子赶来，看到主角留下的残局很生气，被主角用的ＰＭ也不肯回球里，他带着箱子马上闪人了。和对手回村子，看到了博士和他的乖孙子，对话后博士走了。
沙暴河马LV59
火系天王
烈焰马LV58
垂耳兔LV57
大钢蛇LV57
气球鬼LV58
豪火猴LV61
超能系天王
吸盘魔偶LV59
火烈马LV59
恰雷姆LV60
胡地LV60
古铜钟LV63
冠军（漂亮帅姐姐）
御影灵LV61
彩纹海牛LV60
假面蔷薇LV60
鲁卡力欧LV63
美蛇兽LV63
地龙LV66
进入拿飞天的仓库，用钥匙进入。然后会到一栋大厦，和初代红绿一样，不停地飞啊…在里面找到银河团总部钥匙。然后就离开这里，去城中央的银河团大厦。在里面飞啊飞，飞到了银河团老大面前，竟然就是主角两次遇到的怪叔叔…打仪器上放着３只没见过的神秘ＰＭ，打败 那个阿童木发型的银河团干部后把３只神秘ＰＭ放了。
沿２１５道路走出了雨地，来到了户张市。很大的城市，有游戏厅、百货大厦，当然…也少不了银河团…某个房子里有个小丑和主角玩游戏，猜对了得到游戏厅必备的游戏盒子。不过还是踢ＧＹＭ重要。里面是个推路板的小迷宫，满难形容的，不过还好很简单。