基因及基因组的结构与功能
(3)它们距离结构基因的位置、序列、距离和方向都不完全相同,
(4)不直接和RNA pol结合。转录时先和其它转录激活因子相结合,再和
聚合酶结合。
转录起始复合物的形成
1、TFⅡD识别TATA盒
2、RNApol识别并结合TFⅡD-DNA复合
物
3、其他转录因子与RNApol结合
增强子:可增强真核生物基因启动子的工作效率的顺
3、基因组中存在大量的重复序列以及非编码序列。 4、真核生物中,若干功能相似或相关的结构基因 常常串联组织在一起形成多基因家族。
(二)真核生物基因组中的重复序列
真核生物基因组中通常存在大量的重复序列
占整个基因组DNA的90%以上。
按重复频率的高低分为:
高度重复序列 中度重复序列 单拷贝序列
Maternal chromosome Paternal chromosome
Individual 2
A C G T G T C G G T C T T A A A
A C G T G T C C G T C T T A A A
Maternal chromosome Paternal chromosome
Individual 3
A C G T G T C C T A C T T A A A
The position of the SNP is indicated by the box. Individual 1 is heterozygous, while individuals 2 and 3 are homozygous.
在基因组中所占比例种属差异很大,
一般12~35% 人类基因组中约占12%。
有些属于结构基因,有些属于调控序列
组蛋白基因是最典型的中度重复序列
各种生物组蛋白基因在基因组中重复频率不同。如海胆 中的组蛋白基因重复300~1000次,果蝇的重复约110
次,人的组蛋白基因重复30~40次。
反向重复序列定义 卫星DNA定义、特点、应用 中度重复序列分类及代表性基因 单拷贝序列:主要是结构基因、代表为SNP 多基因家族及假基因定义
练习题
1、在真核结构基因中,能够在成熟RNA分 子中保留的序列称为(A) A 外显子 B 内含子 C 增强子 D 终止子
2、反式作用因子本质是(A) A 蛋白质 B DNA C RNA D 核酸
分类: Ⅰ类启动子:富含GC碱基对,主要编码rRNA基因。 Ⅱ类启动子:具有TATA盒特征结构,主要编码蛋白质的基因和一些小 RNA
基因(启动子特征性保守序列),主要编码 5S rRNA、tRNA等。
真核生物启动子特点(了解):
(1)有多种元件:TATA框,GC框,CATT框,OCT等; (2)结构不恒定。有的有多种框盒如组蛋白H2B;有的只有TATA框和GC 框,如SV40早期转录蛋白,
中度重复序列按重复片段长度分类可分为:
短分散重复片段(300-500bp)
代表基因: Alu家族\KpnⅠ家族
长分散重复片段(3500-5000bp)
Alu基因家族结构特征
3、单拷贝序列:
基因组中只出现一次或几次 单拷贝序列属于结构基因
SNP(单核苷酸多态性)
是单拷贝序列的代表。
DNA和RNA的化学组成
DNA:脱氧核糖核酸,由四种脱氧核糖核苷酸通过3’,5’ 磷酸二脂键连接而成 dAMP dGMP dCMP dTMP
RNA:核糖核酸,由四种 核糖核苷酸通过3’,5’磷
酸二脂键连接而成。
分别为AMP、GMP、 CMP、UMP。
二、基因的结构
基因的结构主要指DNA的结构:包括一、
基因及基因组的结构与功能
Chapter 1 Structure and Function of Gene
学习内容
一、基因的化学结构
1 基因和基因组的概念 2 基因的化学组成 3 基因(DNA)的一、二、三级结构 1 基因的功能 2 真核生物基因结构基因和调控序列
二、真核基因的结构与功能
三、真核生物基因组的结构与功能特征
真核生物基因组的特点 真核生物基因组中的重复序列
多基因家族和假基因
第一节 基因的化学结构
一 、基因
基因(gene):是能够编码蛋白质或RNA等具有特定 功能产物的、负载遗传信息的基本单位,除了某些以 RNA基因组的RNA病毒外,通常是指染色体或基因组 的一段DNA序列。包括编码序列(外显子)和对基因 表达具有调控作用的序列(调控序列)和编码序列间 的间隔序列(内含子)。 基因组(genome)是指一个生物体内所有遗传物质 的总和。
定义:一类高度重复序列,其重复单位一般由2-10bp组
成,成串排列。由于这类序列的碱基组成不同于其它 部份,可用等密度梯度离心法将其与主体DNA分开, 因而称为卫星DNA或随体DNA。
特点:具有种属特异性和个体特异性。 应用:可用于制备DNA指纹用于法医学个体识别和亲
子鉴定 。
1.
DNA的高级结构
原核生物DNA的高级结构:双链闭合环状 DNA 真核生物高级结构:多次折叠的染色质结 构
当 E.coli的细胞被裂解后,类核 区DNA就释放出去形成环状
第二节 真核生物基因的结构与功能
基因的功能:
荷载遗传信息 将遗传信息向子代传递(也有变异) 作为模板指导基因表达
Single nucleotide polymorphism (SNP)
SNP
A C G T G T C G G T C T T A A A
Maternal chromosome Paternal chromosome
Individual 1
A C G T G T C C G T C T T A A A A C G T G T C G G T C T T A A A
内含子可能与基因表达调控
有关。
在真核结构基因中,能够在成熟RNA分子中保留的序列 称为外显子(exon)
不能在成熟RNA分子中保留的序列称为内含子(intron)。
调控序列
调控序列是基因中对结构基因的表达起调控作用的序列。 这些调控序列也称为顺式作用元件。 与顺式作用元件之作用的酶或蛋白因子称为反式作用因子。
3、顺式调节。
只调节位于同一染色体体上的靶基因,而对其它染色体上的基因
无作用。
沉默子:是参与基因表达负调控的一种元件 ,与
增强子作用相反,是抑制基因转录的特定DNA序 列。。
沉默子DNA序列结合调控蛋白→阻断转录起始复合物
的形成或活化→基因表达关闭。
第三节 真核基因组的结构与功能
一、真核生物基因组的结构特点
1、高度重复序列:
高度重复序列:
重复频率高,106以上,复性速度很快。 在基因组中所占比例随种属而异
一般在1~30%范围内。 人的高度重复序列约占整个基因组的20% 左右。
高度重复序列按其结构特点可分为:反向重复序列
和卫星DNA.
① 反向重复序列(inverted repeats):两个相同顺
二、三级结构
DNA的一级结构:DNA分子中的所有脱 氧核糖核苷酸的排列顺序,这一顺序是基 因携带和传递遗传信息的基础。
DNA的二级结构
DNA的二级结构:双链反 向互补右手螺旋结构 特点: 1、DNA是反向平行互补双 链结构 2、DNA分子式右手双螺旋 3、疏水性碱基堆积力和氢 键是DNA双螺旋结构的稳 定力。
化或变异而来。
多基因家族分类(了解):
第一类:
基因家族成簇地分布在同一染色体上 同时进行转录,并同时发挥作用 如组蛋白基因家族
组蛋白基因家族集中分布在第7号染色体长臂3区2带到3区6带的区域内
第二类:
基因家族成簇地分布于不同的染色体上 分别进行转录,且不同基因编码的蛋白质在功能上相关 如珠蛋白基因家族。
序的互补拷贝在同一DNA链上反向排列形成。
长度一般在300~600 分散于整个基因组中 结构特点为DNA分子的每一条单链中,碱基序列回排对称
bp
即回文序列
回 文 对 联
画上荷花和尚画 书临汉字翰林书
回文序列结构特征
茎环结构/发卡结构
十字结构
②卫星DNA (satelliteDNA)
原核生物的结构基因大多为连续基因; 真核生物的基因为断裂基因;
断裂基因:真核生物的结构基因是不连续的,内含子与外显子间 隔排列,这种基因称为断裂基因。
连续基因:原核生物的结构基因是连续的,没有内含子序列,称 为连续基因
断裂基因优点: 不同的mRNA剪切加工方式 产生不同蛋白质 突变产生在内含子与外显子 之间可以促进生物进化
1、真核生物基因组都是大分子双链线状DNA;
这些DNA通常与组蛋白、非组蛋白组成核小体、染色体等
复合体而存在。
染色体通常成对出现(双倍体)。
2、基因组非常庞大,结构非常复杂,有多 个复制起始位点。
人类基因组:长3X106 bp,编码2-2.5个基因,编码序列仅占1%,含有大 量重复序列和非编码序列。
反式作用因子=蛋白质
顺式作用元件= DNA
真核生物基因的调控序列
较原核生物复杂 包括:启动子、上游调控元件、增强子、沉默子、加尾信号 和一些细胞信号反应元件。