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病毒基因组


一、原核生物基因组结构与功能的特点 4.结构基因无重叠现象,基因组中任何一段DNA不会 用于编码2种蛋白质。 5.基因序列是连续的,无内含子结构。 6.编码区和非编码区(主要是调控序列)在基因组中 约各占50%。 7.基因组中的重复序列很少。编码蛋白质结构基因多 为单拷贝,但编码rRNA的基因往往是多拷贝的,这有 利于核糖体的快速组装。(15AA/秒,2AA/秒)
病毒基因组的结构特点
☆与细菌相比,病毒基因组很小,而且大小相差较大。 ☆可以由DNA组成,也可以由RNA组成,每种病毒颗粒中只 含有一种核酸,或为DNA或为RNA,两者一般不共存于同一病 毒颗粒中。 ☆基因重叠。 ☆大部分是用来编码蛋白质的,只有非常少的部分不被翻译。 ☆ DNA序列中功能上相关的蛋白质的基因或rRNA的基因往 往丛集在基因组的一个或几个特定的部位,形成一个功能单位或 转录单元。 ☆噬菌体(细菌病毒)的基因是连续的;而真核细胞病毒的 基因是不连续的,具有内含子。
1.构造相对简单,基因结构也不复杂,取材便利,易于 培养,可选择突变株进行研究,实验结果容易重复。 (如选择DDDPI缺乏的Ecoli突变株,Ecoli仍可合成 DNA,说明DDDPI对EcoliDNA合成不起作用。)
2.与人类有共同的分子生物学规律可循,如: (1)遗传物质都是DNA; (2)主要的功能分子都是蛋白质; (3)基因密码是通用的,等等。
病毒基因组
病毒 不具细胞结构,有遗传、 复制等生命特征的微生物。
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病毒基因组核酸的主要类型
☆双链DNA 多数动物病毒,如腺病毒、疱疹病毒、痘病毒, 环形、线形。 ☆单链DNA 动物病毒中仅微小病毒为单链病毒;噬菌体中仅 含单链DNA。 RNA病毒基因组所携带的遗传信息一般在同一条链上,序列 与mRNA相同的为正股(+),与mRNA互补的为负股(—) ☆双链RNA 以负链RNA为模板转录出mRNA如呼肠孤病毒及 噬真菌体。 ☆单链负股RNA ☆单链正股RNA 如逆转录病毒
如:H,A间隔63个核苷酸
SV40病毒基因组
无包膜,直径45nm,双链环状DNA,DNA长5243bp。
☆基因是不连续的 ☆两个区域,转录方向相反
第四节 原核基因组
Prokaryotic genome 以细菌为代表讲述,有称bacteria genome。细菌对医学分子生物学有重要贡献,是基因 工程研究的主要材料之一。因为:
1.质粒(plasmid) 是独立于许多细菌及某些真核细 胞染色体外共价闭合环状的DNA分子(covalent closed circnlar, cccDNA),能独立复制的最小遗传单位。
2.质粒是双链的DNA分子,大小在1—200kb之间,和 病毒不同,它们没有衣壳蛋白(裸Dkiller plasmid) 是RNA外,其余质粒是染色体外的cccDNA分子。
一、原核生物基因组结构与功能的特点
1.基因组通常仅由一条环状双链DNA分子组成。
其DNA是与蛋白质结合,但并不形成染色体结构,只 是习惯上将之称为染色体。细菌染色体DNA在胞内形 成一个致密区域,即类核(nucleoid),类核无核膜将 之与胞浆分开。
2.基因组中只有1个复制起点。
3.具有操纵子结构。操纵子(operon) 是指数个功能 相关的结构基因串联在一起,构成信息区,连同其上 游的调控区(包括启动和操纵区)及其下游的转录终 止信号构成的基因表达单位。
从遗传学来说,质粒是与宿主染色体有别的复制子 (真核细胞分裂过程中,DNA分成许多复制单位, 该单位称为复制子)。在细胞分裂时能恒定传递给子 代细胞的独立遗传因子或能在胞内寄生和复制的复制 子。
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3.质粒与宿主细胞的关系 (1)质粒对宿主的生存不是必需的,只是“友好” 的“借居”宿主细胞中,既不杀伤细胞,对宿主的代 谢活动也无影响,宿主离开质粒照样的生存下去。 (2)质粒离开宿主就无法生存,只有依赖宿主细胞 的(酶和蛋白质)帮助,才能完成自身的复制(扩 增)、转录。
细菌染色体基因组结构的一般特点:
☆ 在DNA分子中具有各种功能的识别区域如复制 起始区OriC,复制终止区TerC,转录启动区和终止 区等。
☆ 具可移动的 DNA序列 ☆ 没有基因重叠现象。 ☆ 在基因或操纵子的终末往往具有特殊的终止顺 序,它可使转录终止和RNA聚合酶从DNA链上脱落。
二、染色体外的遗传物质———质粒 (一)概念
细菌染色体基因组结构的一般特点:
☆ 细菌的染色体基因组通常仅由一条环状双链 DNA分子组成,染色体相对聚集在一起,形成一个 较为致密的区域,称为类核。
☆ 只有一个复制起点 ☆ 具有操纵子结构。 ☆ 在大多数情况下,结构基因在细菌染色体基因 组中都是单拷贝, ☆ 和病毒的基因组相似,不编码的DNA部份所占 比例比真核细胞基因组少得多。
λ噬菌体(研究得最为详尽的双链DNA噬菌体) 48.5kb,46基因,分5部分:头部、尾部、调控(免疫区)、复
制和晚期调控区。
ФX174噬菌体(单链环状DNA)
5.4kb,11个基因,3转录单位。
☆重叠基因
5.4kb
1795氨基酸
197kDa蛋白质 实际上:263kDa蛋白质
☆基因之间的间隔区很小
3.尤其是E.coli,是分子克隆是“明星“,基因工程的 主要工程菌,因为基因工程的主要工作是克隆真核 基因在原核系统中表达。
细菌
属于原核型细胞的一种单胞生物,形体微小,结 构简单。无成形细胞核、也无核仁和核膜,
沙门氏杆菌, 博德氏菌, 梭狀杆菌, 大肠杆菌; 螺旋菌, 葡萄球菌
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类核的结构
大肠杆菌基因组 含有3500个基因, 已被定位的有900个左 右。在这900个基因中, 有260个基因已查明具 有操纵子结构,定位于 75个操纵子中。在已知 的基因中8%的序列具 有调控作用。
8.具有编码同功酶的基因(isogene) 这是一类结构 不完全相同,而功能相同的基因。如E.coli含有2个编 码乙酸乳酸合成酶的基因和2个编码分支酸变位酶同 工酶的基因。
9.细菌基因组中存在可移动的DNA序列,包括插入序 列和转座子。
10.原核基因的基本结构特点: 启动子(promoter)、 操纵基因(operator)、调控序列、结构基因 (structure gene)、终止子(terminator)。
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