食品生产企业档案包括以下材料：
1、申请发证材料；
最近一次申请生产许可的申请书。

2、企业基本信息；
有效期内，经年检（或年审）的营业执照、组织机构代码证、税务登记证复印件。

3、企业许可情况；
企业《全国工业产品生产许可证》复印件。

4、巡查、回访、监督检查情况；
食品药品监督管理部门的日常监管记录。

5、监督抽检；
抽样记录、产品质量检验报告。

6、企业信用；
企业信用评价表
7、年审情况；
企业自查报告、年审表
8、企业产品标准等其他材料。

企业产品执行的标准，企业化验人员的化验证、食品从业人员的健康证，质量授权人备案信息。