飞行时间质谱精确定标的方法利用飞行时间质谱(TOF)探测得到的数据文件截图如下面左图，导入Origin里如右图：
行号即为横坐标，代表飞行时间，每一行数值代表质谱图中相应点的信号强度，如下图：
我们用工具选取一个已知峰的信号，如水(H2O)，见下图，图中显示出该点行号为8642，信号强度为5855：
因为我们已知这个峰代表水(H2O)，那么就可以将飞行时间与质量对应起来。

首先我们要了解，质谱探测得到的信号所代表的是这个物种(H2O)的同位素峰([1]H2[16]O)，那么它的质量就不是平均分子量，而是由确定组成的核素相加得到的质量。

其次我们要了解，由于我们使用的是真空紫外光电离，那么形成的离子应该只带一个正电荷。

因此，质谱探测到的信号实际上是带一个正电荷的阳离子([1]H2[16]O+)。

我们使用下面这个软件来查询相应的m/z值，Measured mass表示质量数，Tolerence表示误差，单位为毫道尔顿，Charge on Molecule表示粒子所带电荷数，下图中的设置表示我们要查询质量数范围为[17.500, 18.500]，带1个正电荷的粒子的可能分子式及其精确质量：
结果给出[1]H2[16]O+的精确质量为18.010016。

将上表拷入Origin中，并做图拟合，步骤如下：
显示下图结果：
将结果粘贴于下表，A、B、C即为定标公式的参数，其含义为m/z=A+B*row+C*row^2：
可自行设计表格，将目标峰的横坐标转化为精确质量数m/z。

Q&A:
1行号究竟代表多少飞行时间？
一行代表2ns，如行号5000，代表飞行时间10000ns。

这是通过P7888数据采集卡附带的采集软件MCDWin设置的，可以更改。

2怎么定更精确、更大范围的质量？
本例只提供了定标方法，对于更精确、更大范围的质量定标，就要提供更多的数据点来拟合。

可以通过如下两种途径：
2.1选取一个产物较多的质谱，利用已定好标的公式，计算相应产物或碎片峰的质量，
猜测其真实分子式，并将分子式与其实际质量添加入飞行时间-质量对应表中，重
新拟合得到更精确的定标公式。

2.2若大质量产物的分子式不容易猜测，那么通入少量大质量标准样品进行定标。

大质
量标准样品推荐芳香烃化合物，比如萘、蒽、菲等，不推荐使用脂肪烃，进入腔
体后非常不易挥发。

3怎么做横坐标为质量数的质谱图？
按下列步骤：
3.1在数据列左侧插入两列：
3.2将第一列填充为行号：
3.3右击第二列，选择Set Column Values：
3.4输入定标公式：
3.5计算得到：
3.6以mz为横坐标，A为纵坐标做图得：。