现代微生物鉴定技术
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2 厌氧菌的鉴定
利用细菌生长产生的酶,用单一基质酶促 反应原理,与测试卡中的少量基质反应, 充入厌氧菌的鉴定卡,在非厌氧条件下培 养小时,结果输入计算机,作出鉴定。
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3 酵母菌鉴定
酵母菌鉴定的测试卡与上述不同,菌液充 入试验卡,先在30℃培养4小时,然后放入 读数仪/培育室中读数,鉴定。如需要,计 算机将提示再重复培养,测试一次。
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MIS系统的标准库 (MIS Standard Libraries)
该标准库包括有需氧菌、厌氧菌、酵母菌,很多领
域内有特性的微生物均保存在标准库中。所以MIS系 统的标准库可以应用于以下专业的微生物鉴定工作。
医学及临床微生物
环境微生物
植物微生物
工业微生物
食品微生物
兽医
饮用水和废水
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另外,细胞在不同的环境条件中,为维持细胞膜 的流动性其脂肪酸的成分有所改变。所以培养基 的选择和培养温度一定要按规定进行。
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• 红外光谱仪鉴定微生物
(Infrared Spectroscopy)
原理
细菌或其他微生物的红外光谱包含了化合 物组分的资料信息,如细胞壁组分(酯类, 多糖,多肽),核酸,蛋白质。菌种不同 其红外光谱不同,利用这种‘光谱指纹’ (spectral fingerprints)与计算机软件 库中的标准谱进行比较可以对微生物进行 鉴定。
现代微生物鉴定技术
中国药品生物制品检定所抗生素室 马越
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一 API鉴定系统 二 自动微生物系统 三 分子生物学在细菌分类中的应用
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一 API鉴定系统
由于传统的细菌鉴定方法费时、耗力, 因此出现多种类型的的成套鉴定系统及编 码鉴定系统方法,使细菌鉴定简易化、微 量化和快速化。API鉴定系统是在世界范围 内应用最广、种类最多的系统。
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仪器的优点
1 功能多 可以对革兰阳性,阴性,厌氧菌,酵母 菌等作出鉴定
2 速度快 获得纯培养后,充入试卡,果准确 可避免人主观判断的误差。
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其他不足
1 酵母菌的鉴定不能仅凭生化反应,要兼 顾形态学特征。
2 在少数情况下,AMS系统不能作出鉴定, 在排除操作错误以后,可能是该机现有资 料库中没有相应的模式。
生化图谱数码的编码法将生化反应 所得阳性和阴性结果,转换成数码,再 与索引中数码相比较完成鉴定。
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原则:
所有的(20或32个)反应从阳性到阴性的 信息浓缩成一组数字。每3个反应为一组, 组内按其位置第一位阳性为1,第二位阳性 为2,第三位阳性为4,阴性为0。最终组成 一个7位或10位数字。
二 自动微生物系统 (AutoMicrobic System AMS)
美国BD公司 BioMerieux ViteK 气相色谱(Gas Chromatography) 鉴定微生物 红外光谱仪(Infrared Spectroscopy) 鉴定
微生物
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• BioMerieux ViteK
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生化反应图谱索引手册的应用
鉴定%≥99.9 极好的鉴定 %99.8-99.0 很好的鉴定 %98.9-90.0 好的鉴定 %98.9-80.0 可以接受的鉴定 %79.9以下 低分辨率(不可信)
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API 系统的操作
接种物的制备 试验条的接种 读取结果
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Infrared Spectroscopy的特点
1 快速 2 鉴定所需标本量少 3 自动分析 4 鉴定准确 5 可鉴定到菌株水平 6 对所有微生物可以进行鉴定
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BioMerieux ViteK
工作原理
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1 革兰阴性、阳性菌的鉴定
主要依据概率是最大拟燃模型法(Probabilistic maximum likelihood model),通过计算机控制, 读数仪每小时对孵育室中的测试卡自动扫描一次, 进行光学检测,将所得数据送入计算机。因细菌 的生长繁殖使测试小池的透光量减少,计算出百 分变化值,以判定是否有细菌生长。 计算机对 测试菌各反应池结果的处理求出该菌的绝对拟燃 值(Absolute likelihood)与内存模型菌比较进 行鉴定。
4)用于研究细菌对糖的发酵、氧化和同化能力以及细菌 所具有的酶谱(Enzymes profile)
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数值鉴定的基本原理
数值鉴定是通过出现频率的计算进行 的,即每个分类单位的总出现频率与每个 菌群中所有菌的总出现频率总和相比较而 得。
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数值鉴定的应用
MIS系统
仅能鉴定那些标准库中包括或与其相关的 菌种。
另外,培养条件和样本制备必须根据要求 进行。
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注意:
脂肪酸谱与DNA同源性有关,而DNA用于确定种 的分类。所以,在有些科里,如肠杆菌科中有些 菌种间关系密切,根据生化反应的分类学使该系 统的鉴定会有二、三种选择的情况,此时,尚需 用其他方法鉴定。
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分类
1)快速鉴定系统 如: Rapideo Z 沙门菌、志贺菌等 2小时 生化反应项 目5
2)特定菌属(群)的鉴定系统 如:API Staph,API Strep 可鉴定28个和35个种, 生化反应项目20
3)ATB (Automatic Testing Bacteriology)系统 API方法电脑化,可自动读取鉴定结果,使用时需将 鉴定板与自动化仪器结合起来。
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• 气相色谱鉴定微生物
原理
根据细菌脂肪酸的构成谱(fatty acid composition profiles)来鉴定细菌。提取未知微生物的脂肪酸, 气相色谱仪自动定量测定脂肪酸一确定脂肪酸的 构成谱,并与计算机数据库中的参考微生物进行 比较,鉴定。该系统可鉴定到属、种、亚种及生 化变异型。常用气相色谱鉴定微生物系统有 Sherlock Microbial Identification System(MIS)。