用RSA耦联体免疫过的兔子不太可能产生针对 载体的抗体，因为RSA是兔子自身的蛋白。如果注 射动物不是兔子RSA则不会被认为是自体蛋白。免 疫系统是对多肽－载体蛋白整体发生反应的，即免 疫反应有一部分是针对耦联多肽，一部分是针对中 间连接体，有一部分是针对载体蛋白。当用ELISA做 筛选时建议使用不同载体蛋白耦联的多肽聚合物。 如果ELISA是在非耦联多肽涂层的多孔板上做时则没 有必要这样做。
（2） 选择抗原决定簇 为选择好的抗原决定簇，应符合以下三点： 1．亲水性(Hydrophilicity) ：大部分抗原决定簇是亲水性 的； 2．表面可接触性(Surface Accessibility) ：大部分抗体只 与蛋白质表面部分结合； 3．有弹性(flexibility) ：许多已知的抗原决定簇是在自由 活动区域。 所以一般来说蛋白质的 N 端及 C 端是很好的抗原决 定簇区域。
羧基取代基的活化能力顺序
3.7 肽键生成的方法
• 羧基活化法有碳二亚胺法、混合酸酐法、活化酯 法、NCA法等 • 1.碳二亚胺法
• 2、混合酸酐法:反应一般分两部进行
副反应：
歧化反应和酸酐分解：
二酰胺的形成：பைடு நூலகம்
3、活化酯法
羧酸酯氨解生成酰胺的反应是胺对酯进行 亲核取代，因此增加R‘基团的吸电子能力必将 增加羰基碳原子的正电性而有利于氨解反应的 进行。
备注
（5）设计多肽序列的长度 抗原性区域确定以后，接下来要确定多肽的长度。 关于选定多肽长度有两种不同的观点。一种观点认为 长的多肽（20－40个氨基酸）比较好，因为长的多肽 无疑会增加抗原基的数量。另一种观点则认为小的多 肽更有效，使用小的多肽能保障所产生抗体的位点特 异性。但有一点是明确的，不管长度如何，所选多肽 必须能够较容易地通过生化合成得到，并且能溶解到 水溶性缓冲剂进行载体蛋白的耦联。由于受副反应的 影响较大，高于二十个氨基酸的多肽通常很难进行高 纯度合成，并且常常会含有缺失性序列。
R1 XNH C COY H R2 R1 R2
+
H2N C COOQ H
XNHCHCONHCHCOOQ
对于长肽合成，一般有逐步增长和片段缩合两种 方式，前者由起始氨基酸（或肽）开始，每连接 一次增长一个氨基酸，后者由C保护肽同N保护 肽缩合来得到两者长度相加的新肽链。
R1 XNH O N O R2 N N O Rn N O Rn+1 Y R1 R2 N O O N N O Rn N O Rn+1 OQ XNH O R1 N O R2 N N O R2n+1 N O R2n+2 OQ
羧基保护基 甲酯/乙酯 苄酯/取代苄 酯
脱保护条件
用NaOH/KOH在有机水溶液中皂化脱去 除能像甲酯或乙酯那样用皂化的方法 脱掉外还可以用催化氢解的方法脱除 能用HCl/有机溶剂、HBr/AcOH、TFA、 叔丁酯(OtBu) HF等酸解的方法脱去 邻苯二甲酰亚 用HCl/有机溶剂、二乙胺的乙醇溶液 胺甲酯 、稀的NaOH水溶液和肼解脱去 苯羰甲酯 用催化氢解或硫代酚钠处理脱去 用催化氢解、电解还原、Na/液氨处理 吡啶-4-甲酯 、碱皂化等方法脱去 NaOH皂化脱去，TFA和HCl/有机溶剂酸 三甲硅乙酯 解脱去
抗多肽制备流程及原理
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1. 抗原多肽的设计
2. 抗原多肽的偶联策略
3. 多肽合成简介
4. 抗多肽血清的制备 5. 血清的检测
1. 抗原多肽的设计
为产生有效的抗体，第一步是设计好的抗原， 此抗原可以来源于整个蛋白质的一部分：一个或几 抗原决定簇区域的序列。 （1）什么是抗原决定簇？ 蛋白质表面部分可以使免疫系统产生抗体的区 域叫抗原决定簇。一般抗原决定簇是由 6－12 氨基 酸或碳水基团组成，它可以是由连续序列（蛋白质 一级结构）组成或由不连续的蛋白质三 维结构组成。
2. 抗原多肽的耦联策略
化学合成的多肽抗原是小分子，本身很难具有 好的抗原性，只能诱导动物产生很弱的免疫反应， 因而与载体蛋白耦联是很重要的。载体蛋白含有很 多抗原决定基，能够刺激T细胞，进而诱导B细胞 反应。用于与多肽耦联的载体蛋白有多种，其中最 常用的是(keyhole limpet hemacyanin (KLH), 牛血 清白蛋白(bovine serum albumin，BSA), 卵清蛋白 (ovalbumin，OVA)和牛甲状腺球蛋白(bovine thyroglobulin，THY)。KLH具有更高的抗原性，是 最为常用的多肽耦联载体。BSA也常用来作为多肽 载体，但由于BSA经常被用做检测试验的阻断剂而 使得该方法生产的抗体在应用上存在着一定的局限 性。
设计合成性多肽常常被忽略的一个方面是如何将 多肽耦联到载体蛋白上。例如，N-端序列需要通过 C-端氨基酸耦联，而C-端序列则需要通过N-端氨基 酸耦联。内部序列则可以耦联到任何一端。内部序列 耦联的另一考量则是将非共轭端酰基化或氨基化，因 为原蛋白分子序列中不会含有带电荷的末端。最常用 的耦联方法都是基于自由氨基(alph-氨基或Lys)、 sufhydryl (Cys)或羧基集团(Asp, Glu, 或 alpha-羧基) 的存在。所有的耦联方法都应该是通过羧基或氨基端 残基将多肽耦联到载体蛋白上。所选序列不能有多个 残基都能参与所选耦联化学反应。如果多个反应位点 存在，可以考虑将多肽序列缩短，或者选择所有反应 位点都位于一端的多肽。对于内部序列通常会使用离 所预测抗原位点较远的一端进行耦联，这样可以避免 可能的屏蔽问题。
1．载体蛋白的接入位置 。
2．如果其序列是位于蛋白 C 端的，此多肽 C 端一 定是自由的羧基团，而N 端被掩盖。同时如果载体 蛋白是通过半胱氨酸偶联，此半胱氨酸应处于 N 端 位置，使 C 端完全暴露给免疫系统。
3．相反，如果其序列是位于蛋白质 N 端，此多肽 C 端应掩盖，暴露出 N端，而载体蛋白应在 C 端。
+
H2N
3.3 氨基保护 氨基保护常用的保护基分为烷氧羰基、酰基，和 烷基三大类。因为N烷氧羰基的保护的氨基酸在接肽 时不易发生消旋化，故烷氧羰基使用最多。
3.4 羧基保护
• 目前使用的羧基保护大致可以分为三种 • 一种可以用碱皂化脱去，如甲酯、乙酯 • 另一种可以用酸脱去，如叔丁酯、对甲氧 苄酯，邻苯二甲酰亚胺甲酯等 • 第三种除了用酸或碱脱去外，还可以用其 他的方法选择性脱去，如苄酯、苯羰基甲 酯、三甲硅乙酯
（3） 抗原性与免疫原性 单独的抗原决定簇是不能产生免疫反应，它只有 抗原性但没有免疫原性，为使它能具有免疫原性，它 必须偶联在载体蛋白上。
（4） 抗原决定簇的预测 对每个氨基酸的表面可接触性、亲水性和弹性进 行计算可以大体推算出抗原决定簇区域，抗原决定簇 区域应综合以上三个特点。目前市面上有几个专业测 定软件满足需要：如MacVestor , Protean , GCG 等。
• 活化酯的种类：1）芳基活化酯 2）烯基酯 3）与N-羟基化合物形成的活化酯 4）活化酰胺 5）固相活化酯 • 活化酯的制备：1）DCC法 2）转酯反应 3）加成 4）混合酸酐法
• 4、NCA法
优点：1）反应速度快，肽合成周期短 2）得到的 氨基游离的肽可直接用于第2轮的肽合成 3）侧链 可以较少的保护，除NCA的侧链需保护外，氨基 组分只有Lys和Cys必须保护 4）反应有可能在水 溶液中进行。
m-Maleimidobenzoyl-N-hydroxysuccinimide 酯 (MBS)是一种双性多肽耦联试剂，可以将多肽与载体蛋 白通过半胱氨酸耦联。耦联发生在半胱氨酸的硫醇基。
如果多肽序列中不包括半胱氨酸，可以将一个半 胱氨酸加到多肽的N-端或C-端，以获得可控性更强的 多肽与载体蛋白的耦联。为了合成方便，我们建议将 半胱氨酸加到多肽的N-末端。戊二醛是一种双作用耦 联试剂，可以将两个化合物通过氨基集团耦联在一起。 戊二醛能起到非常灵活的间隔多肽和载体蛋白的作用， 时多肽能尽可能的暴露给免疫系统。但是，戊二醛是 一种反应性很强的化合物，可以和Cys, Tyr及His等氨 基酸发生一定程度的反应。反应后会形成结构很难预 测的共轭体。因此，如果多肽序列末端只含有一个单 一的自由氨基时，戊二醛方法非常有用。如果多肽含 有多个自由氨基集团，会形成多聚合物，结构很难预 测，尽管有很高的抗原性。
• NCA的合成：酰氯法、光气法
3.8 固相合成
固相合成的主要设计思想是：先将所要合成肽 链的末端氨基酸的羧基以共价键的结构同一个不溶 性的高分子树脂相连，然后以此结合在固相载体上 的氨基酸作为氨基组分经过脱去氨基保护基并同过 量的活化羧基组分反应接长肽链。这样的步骤可以 重复的多次进行下去，即缩合→洗涤→去保护→中 和和洗涤→下一轮缩合，最后达到所需要合成的肽 链长度。
因为与牛血清白蛋白（BSA）耦联的多肽刺激产 生的抗血清也含有针对BSA的抗体，一次可能导致假 阳性结果。尽管KLH较大并有抗原性，但它在耦联过 程中可能会沉淀，因而有时候会很难处理。卵清蛋白 （OVA）是另一种可以使用的载体蛋白。当要检验抗 体只是针对多肽而不是针对载体蛋白时，OVA时用作 第二载体的很好选择。当要将抗体抗载体蛋白的反应 降到最低时，可以使用兔血清白蛋白做载体。
R1 H2N O N O R2 N N O Rn N O Rn+1 OH
3.2 多肽合成原理 化学合成多肽就把氨基酸按照一定的氨基酸排列 顺序和连接方式连接起来。 为了得到具有特定氨基酸顺序的合成多肽，采用 逐步缩合的定向合成方法，即先将不需要反应的 氨基或羧基用适当的基团保护起来，再进行连接 反应，以保证反应的定向进行。
另一方面，太短的多肽（<10个氨基酸）则会产生 识别特异性很强的抗体，以至于无法识别整体蛋白， 或亲和性很低。因此综合考虑制备性抗原地多肽有效 长度一般是10－20个氨基。这种长度的多肽序列会最 大程度的减小生化合成困难，具有一定的水溶性，也 会具有一定程度的二级结构。
（6） 设计合成多肽 一旦抗原序列决定后，接下来就是设计所需合成 的多肽了，设计时除了注意其序列外，同时应考虑一 些产生免疫机制问题，如：