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基因文库的建立演示课件.ppt
粒DNA,电泳测定插高,质量越高,可大大减轻后续
筛选基因工作量。
精心整适合一些低 等真核生物和原核生物。
精 左右臂DNA片段的获得
2. 器官特性
不同器官或组织的功能不一样,因而有的结构基因的 表达就具有器官特异性,故由谢或发育特异性
处于不同代谢阶段(或发育阶段)的结构基因表达 亦不相同
4. 不均匀性在同一个cDNA中,不同类型的cDNA分子的数 目是大不相同的,尽管它们载体构建基因组1. 两臂DNA片段的制备:
pYAC4 BamHI/EcoRI 脱磷酸化
2. 供体DNA片段的制备:
琼脂糖凝胶-DNA样品的制备 EcoRI部分酶切 凝胶电泳 片段回收和纯化
3. DNA的连接 4. 重组DAN分子的转化: 原生质体转化法 5. 转化子的保存: 单菌落保存于96孔平板中
脉冲场
精心整理
酵 母 人 工 染 色 体 构 建
精心整理第二节cDNA的建立精心整理定义:从一定生长阶段或条件的某种细胞分离到的全部
mRNA经反转录成 cDNA后再重组和增殖所产生的来自结构基因,因此仅代表某种生物的一小部分遗 传信息,且只代表那些正在表达的基因的遗传信息: 1—5% mRNA,80—85% rRNA,10—1整理第一节基因组的构建精心整理定义:
含有某种生物全部遗传信息的重组D(1-f)
2) 重组DNA分子的包装与感染
与λ重组子包装相似, 然后感染E.coli NS3529 = E.coliK12 recA
mcrA Δ(hsdR hsdM mcrB mcrC mrr)(λimm434 nin5X1-cre) (λimmλLP1), 每微克DNA可在精K心a整n理r平板上4 X 105 - 2 备
DNA分离纯化 限制酶切 脱磷酸化反应
2. 供体DNA片段的制备
总DNA分离纯化 机械剪切法 分离特定大小DNA片段
酶法
部分酶切
分离特定大小DNA片段
完全酶切
精心整理
3. 供体与载体DNA连接4. 采用快速构建法以避免扩增时DNA丢失
精心整理
COS
利 用 单
质 粒 载 体 文 库
精心整理
COS
利 构用 建双 基 因 组质 文粒 库载
体
精心似:
1. 两臂DNA片段的制备: pAD10sacB BamHI/ScaI 2. 供体DNA片段的制备: 部分酶切 蔗糖梯度离心 3. 两DNA的连接和重组DAN分子的包装
E.coli BHB2690(N205 recA[λimm434 cItsb2 red Dam Sam/λ])-
头部蛋白
精心整理
精心整理
i. 两菌株分别培养,分别收集和制备,包装前混合---本底低(对λDNA分子大小有严格限制),高效。
ii. 两菌株分别培养,混合收集和制备----操作简单, 本底高,可包装不同大小的λDNA分子。
2. 供体DNA片段的制备:限制酶部分酶切,机械剪切法
3. 重组DNA分子的形成:
控制克分子比率,使其形成串状DNA分子
4. 重组DNA分子的包装
1) λDNA的包装物的制备
使用的大肠杆菌菌株:
E.coli BHB2688(N205 recA[λimm434 cItsb2 red Eam Sam/λ])包装蛋白
1) 包装物制备用菌株:
E.coli NS3208[=MC1061, supo recD1014 hsdR- hsdM+ mcrA- mcrB(P1 r-m- cm-2 c1.100 am10.1)] : 制备pacase E.coli NS3210[=MC1061, supo recD1014 hsdR- hsdM+ mcrA- mcrB(P1 r-m- cm c1.100 am131)] : 制备头部蛋白
2) 重组λDNA分子的包装过程 包装制备物(-70℃)于冰上缓慢融化 加入重组 λDNA分子 边融化边混合边包装 离心除去 细胞碎片 λ颗li 培养 分离λ颗粒 -70℃保存
精心整理
五. 利用COS质粒载体构建基因组构建过程与λ载体构建过程相似: 两臂DNA片段的制备, 供体DNA片段的制备,两DNA的连接和重组DAN分子的包 装。单C体系中的总DNA浓
度和两种DNA分子的克分子比率。
4. 重组DNA分子的转移和基因组的扩增利用转化或感染方法将连接DNA分子导入宿主细胞,
让其自主复制,重组DNA分子被扩增(重组子比率可机挑取产生不同末端以避免其自身形成串状体 2. 供体DNA脱磷酸化以避免供体DNA间的连接导致重排 3. 载体和供体DNA末端修饰以避免上述两种情形发生
载体DNA XhoI or SalI酶切 补CT 连接 重组DNA 供体DNA Sau3AI部分酶切 补AG