国家卫生计生委能力建设和继续教育中心遗传咨询能力评估考核提纲第一部分遗传咨询基础理论【基本要求】掌握遗传风险评估、分子遗传学、细胞遗传学、表观遗传学、药物基因组学理解遗传咨询的原则、程序及法律【考核内容】第一章遗传咨询概论一、遗传咨询的定义二、遗传咨询的目的三、遗传咨询的原则四、遗传咨询的程序五、信息采集六、家系分析1.家系图谱绘制2.家系分析法七、遗传咨询的伦理八、遗传咨询的道德与法律九、遗传咨询对象1.传统咨询对象2.咨询对象的扩展十、遗传咨询应掌握的技巧第二章遗传风险评估第一节概率与概率基本运算法则1.乘法法则2.加法法则第二节单基因疾病的遗传风险评估一、应用孟德尔比率评估遗传病风险1.常染色体隐性疾病的风险评估2.常染色体显性疾病的风险评估3.X-连锁隐性疾病的风险评估4.X-连锁显性遗传疾病的风险评估5.Y-连锁遗传疾病的风险评估二、应用Bayes分析方法评估遗传病风险1.应用Bayes分析对X-连锁隐性遗传病的风险评估2.应用Bayes分析对常染色体隐性遗传病的风险评估3.应用Bayes分析对常染色体显性遗传病的风险评估4.应用Bayes分析对基因新突变的风险评估5.应用Bayes分析结合临床遗传检测结果的风险评估6.应用Bayes分析对连锁等位基因的风险评估三、常染色体隐性遗传的群体风险评估四、近亲结婚的风险评估第三节染色体病的风险评估1.家族性染色体平衡易位的风险评估2.三体妊娠史阳性者再发风险评估第四节多基因病的风险评估1.易感性、发病阈值与遗传度2.疾病的严重程度3.患者的亲属关系和患病人数4.患者性别第五节肿瘤的风险评估一、肿瘤的风险评估方法1.流行病学评估法(1)累积发生率(2)相对风险(3)绝对风险2.孟德尔遗传评估法二、遗传性肿瘤风险的分类1.遗传性肿瘤的特点2.分类(1)低风险(2)中等风险(3)高风险(4)风险不确定第三章药物基因组学第一节药物转运体基因的遗传变异与精准医疗1.肠上皮药物转运体基因2.肝细胞药物转运体基因3.肾近端小管药物转运体基因第二节药物代谢酶基因的遗传变异与精准医疗1.一相药物代谢酶基因2.二相药物代谢酶基因第三节药物靶点基因的遗传变异与精准医疗1.受体基因2.离子通道基因3.靶酶基因第四章分子遗传学第一节基因突变的分类一、点突变二、大片段突变三、动态突变第二节遗传检测的主要方法和及其应用一、直接诊断二、连锁分析三、遗传检测的范畴1.诊断性检测2.症状前检测3.携带者检测4.产前检测5.药物遗传学检测6.植入前遗传筛查7.植入前遗传诊断第三节分子诊断的基本操作一、病例和样本收集处理1.病例收集和记录2.样本类型3.样本要求和传送二、个体研究和家系研究三、遗传病的产前诊断1.有创产前诊断(1)羊膜腔穿刺术(2)绒毛采样术(3)脐静脉穿刺术2.无创产前诊断(1)染色体疾病的无创产前诊断(2)单基因疾病的无创产前诊断四、遗传检测技术应用的局限性1.实验操作的误差2.技术的敏感性和特异性3.DNA多态性4.检测结果的复杂性5.漏检6.基础研究的限制五、临床遗传学实验室的建立和布局1.细胞遗传学2.生化遗传学3.分子遗传学4.PCR实验室要求第五章细胞遗传学第一节染色体的形态1.染色体核型2.染色体各部分的组成及名称第二节染色质、染色体的结构和功能1.染色质和染色体的化学组成2.染色体的结构3.染色体的多态性4.染色体的功能第三节细胞周期一、间期1.G1期2.S期3.G2期二、有丝分裂期1.前期2.早中期3.中期4.后期5.末期第四节减数分裂一、减数分裂I期1.间期(1)细线期(2)偶线期(3)粗线期(4)双线期(5)终变期3.中期I4.后期I5.末期I二、减数分裂II期1.间期II2.前期II3.中期II4.后期II5.末期II三、减数分裂的遗传学意义第五节精子和卵子的生成一、精子生成1.增殖期2.生长期3.成熟期4.变形期5.精子生成的特点二、卵子的生成1.增殖期2.生长期3.成熟期4.卵子生成的特点第六节 Lyon假说1.Lyon假说的要点2.X染色体失活中心3.基因剂量补偿作用4.镶嵌体的形成5.X-染色体失活的偏好现象第七节正常人体染色体核型的命名1.人类细胞遗传学国际命名体制2.辨认染色体结构的标志(1)界标(2)区(3)带(4)亚带第八节染色体畸变一、数量异常1.整倍体(1)三倍体(2)四倍体2.非整倍体(1)亚二倍体(2)超二倍体(3)非整倍体形成的机制二、染色体结构畸变1.缺失(1)末端缺失(2)中间缺失2.倒位(1)臂内倒位(2)臂间倒位3.易位(1)同源染色体易位(2)非同源染色体易位(3)单向易位(4)相互易位(5)复杂易位(6)罗伯逊易位4.重复(1)正向重复(2)反向重复5.环状染色体6.双着丝粒染色体7.插入(1)正向插入(2)反向插入8.等臂染色体9.标记染色体(1)标记染色体的分类(2)单亲二倍体(3)标记染色体镶嵌体第六章表观遗传学第一节 DNA甲基化1.DNA甲基化的定义2.DNA甲基化的意义3.CpG岛4.DNA甲基转移酶及其抑制剂5.DNA去甲基化6.DNA甲基化异常与疾病的关系7.DNA甲基化的检测方法第二节非编码RNA1.非编码RNA的组成和定义2.微小RNA(miRNA)的作用机制3.长链非编码RNA的作用机制4.非编码RNA与疾病的关系5.非编码RNA的检测方法第三节组蛋白修饰1.核小体的构成2.组蛋白的类型3.组蛋白甲基化修饰及意义4.组蛋白乙酰化修饰及意义5.组蛋白修饰与DNA甲基化的关系6.组蛋白修饰与疾病的关系7.组蛋白修饰的检测方法第二部分遗传咨询临床应用【基本要求】掌握病的病因、发病机制、遗传学相关诊断、遗传咨询、危险度评估和主要治疗或干预方法【考核内容】第一章不孕不育与辅助生殖第一节不孕不育的病因及遗传咨询1.女性不孕的病因2.男性不育的病因3.X染色体异常与不孕4.卵巢早衰与不孕5.Y染色体异常与不育6.基因异常与不孕7.不孕不育的诊治流程第二节辅助生殖技术及遗传咨询1.人工授精2.体外受精-胚胎移植(IVF-ET)3.卵泡浆内单精子显微注射(ICSI)4.胚胎植入前遗传学筛查(PGS)(1)PGS适应症(2)主要的PGS技术5.胚胎植入前遗传学诊断(PGD)(1)染色体数目异常诊断(2)染色体结构异常诊断(3)单基因病诊断6.PGS和PGD的采样方法7.单细胞扩增技术第二章产前筛查与产前诊断第一节产前筛查与诊断的采样1.羊膜腔穿刺2.绒毛取样3.脐带穿刺4.孕妇外周血第二节产前筛查1.产前筛查的定义2.产前筛查的对象3.产前筛检的技术第三节无创产前检测1.无创产前检测的分子基础2.无创产前检测技术3.无创产前检测的适应症4.无创产前检测的发展第四节产前诊断1.产前诊断的定义2.产前诊断的作用3.产前诊断的方法4.有创产前诊断的禁忌症5.有创产前诊断的适应症第三章染色体数目异常第一节 21三体综合征第二节 18三体综合征第三节 13三体综合征第四节其他染色体三体综合征第五节 Turner综合征第六节 Klinefelter综合征第七节三倍体综合征第四章染色体结构异常第一节染色体亚端粒重组异常相关性智力低下第二节 22q11微缺失综合征第三节 22q11微重复综合征第四节 Prader-Willi综合征第五节 Angelman综合征第六节 Beckwith-Wiedemann综合征第七节 William综合征第五章恶性肿瘤第一节视网膜母细胞瘤第二节遗传性乳腺癌/卵巢癌第三节 Li-Fraumeni综合征第四节遗传性前列腺癌第五节 1型神经纤维瘤第六节肺癌第七节白血病1.急性淋巴细胞性白血病2.急性髓系细胞性白血病3.慢性淋巴细胞性白血病4.慢性髓系细胞性白血病第六章血液遗传病第一节α地中海贫血第二节β地中海贫血第三节葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症第四节血友病1.甲型血友病(A型)2.乙型血友病(B型)3.丙型血友病(C型或凝血因子XI缺乏症)4.血管性血友病第五节凝血因子减少或缺乏1.因子XII缺乏症2.因子V缺乏症第六节血小板无力症第七节易栓症1.因子V突变与血栓形成2.凝血酶原突变与血栓形成3.抗凝血酶-III缺乏症4.纤溶酶原缺乏症第八节再生障碍性贫血1.再生障碍性贫血的易感基因2.先天性纯红细胞再生障碍贫血3.先天性红细胞生成异常性贫血4.范可尼贫血第七章智力发育障碍疾病第一节脆性X综合征第二节孤独症第三节 Rett综合征第四节胎儿酒精综合征第五节精神发育迟滞1型(MRT1)第六节 Lubs型X连锁精神发育迟滞(MRXSL)第八章线粒体病第一节线粒体基因组特点第二节线粒体遗传病的特点第三节 Leigh综合征第四节线粒体DNA缺失综合征第五节 Leber遗传性视神经病第六节线粒体脑肌病伴乳酸中毒及中风样发作第七节肌阵挛性癫痫伴碎红肌纤维病第八节线粒体糖尿病第九节氨基糖甙类抗生素耳毒性第九章遗传代谢病第一节氨基酸代谢病1.苯丙酸酮尿症2.酪氨酸血症3.尿素循环疾病第二节有机酸代谢病1.异戊酸血症2.丙酸和甲基丙二酸代谢异常3.戊二酸血症I型4.中链脂酰辅酶A脱氢酶缺乏症第三节糖代谢障碍1.半乳糖血症2.糖原贮积症第五节溶酶体贮积症1.粘多糖贮积症2.鞘脂贮积症第十章内分泌系统疾病第一节糖尿病1.1型糖尿病2.2型糖尿病3.常染色体显性遗传糖尿病第二节甲状腺与甲状旁腺疾病1.先天性甲状腺功能减退症2.自身免疫性甲状腺病3.甲状旁腺疾病第三节雄激素不敏感综合征第四节自身免疫性内分泌腺综合征第五节先天性肾上腺皮质增生症1.先天性类固醇21-羟化酶缺乏症2.11β-羟化酶缺陷症3.3β-羟类胆固醇脱氢酶缺陷症4.17α-羟化酶缺陷症5.类固醇激素急性调节蛋白缺陷症第十一章心血管遗传病第一节家族性高胆固醇血症第二节家族性肥厚性心肌病第三节家族性扩张性心肌病第四节长Q-T间期综合征第五节动脉粥样硬化第六节高血压病第十节先天性心脏病1.室间隔缺损2.房间隔缺损3.动脉导管未闭4.法洛四联症5.肺动脉狭窄6.主动脉瓣口狭窄7.主动脉缩窄第十二章骨骼疾病第一节先天性髋关节脱位第二节先天性马蹄内翻足第三节马凡综合征第四节软骨发育不全第五节颅缝早闭综合征第六节成骨不全病第七节抗维生素D佝偻病第十三章皮肤疾病第一节银屑病第二节鱼鳞病第三节大疱性表皮松懈症第四节掌跖角化症第五节白化病第六节白癜风第七节遗传性对称性色素异常症第八节着色性干皮病第九节结节性硬化症第十四章眼科疾病第一节视网膜色素变性第二节先天性色觉缺陷第三节非综合征性先天性白内障第四节原发性先天性青光眼第十五章耳科疾病第一节遗传性非综合征性耳聋第二节Waardenburg综合征第三节 Usher氏综合征第四节 Pendred综合征第五节耳硬化症第六节双侧听神经纤维瘤第十六章肾脏疾病第一节 Alport综合征第二节薄基底膜肾病第三节 Fabry病第四节多囊肾病1.成人型多囊肾2.婴儿型多囊肾第五节指甲-髌骨综合征第六节青年性肾消耗病-髓质囊性病综合征第十七章出生缺陷疾病第一节先天性神经管缺陷第二节先天性脑积水第三节唇腭裂畸形第三部分遗传咨询检测技术【基本要求】重点掌握样本收集保存和处理要求、检测原理、检测主要步骤、结果分析与解读【考核内容】第一章细胞遗传实验室检测技术第一节染色体核型分析第二节FISH第二章分子遗传实验室检测技术第一节 PCR技术1.普通PCR2.RT-PCR3.多重PCR4.数字PCR5.单细胞PCR第二节MLPA第三节基因芯片1.aCGH2.SNP芯片3.基因捕捉芯片4.甲基化芯片5.miRNA芯片6.长链非编码RNA芯片第五节基因测序1.Sanger 法测序2.甲基化测序3.二代测序(1)外显子测序(2) 16s rDNA测序(3)宏基因组测序(4)扩增子测序(5)全基因组测序(6)目标序列捕获测序(7)循环肿瘤DNA测序(8)转录组测序(9)表观组测序第三章生物信息学第一节生物信息学基本概念1.生物信息学定义2.生物信息学的主要研究内容(1)基因组序列拼接和比对(2)基因组结构预测和注释(3)非编码区及非编码RNA分析(4)基因表达谱和基因调控网络分析(5)全基因组关联分析第二节生物信息数据库1.Clinvar数据库2.OMIM数据库3.Cosmic数据库4.HGMD数据库5.PharmGKB数据库6.Genecards数据库7.Malacards数据库8.UniProt数据库第四部分遗传检测实验室管理【基本要求】了解实验室的管理及遗传检测报告的生成【考核内容】第一章实验室物理分区及空气流向控制一、实验室分区的基本原则二、缓冲间的功能三、产前筛查与产前诊断实验室物理分区与空气流向控制四、植入前胚胎遗传学诊断实验室物理分区与空气流向控制五、遗传病诊断+肿瘤诊断与治疗实验室物理分区与空气流向控制第二章试剂使用与管理一、试剂方法的性能指标1.精密度(重复性)2.准确性(正确度,方法学比较)3.可报告范围(线性范围)4.参考区间5.分析敏感性(测定下限)6.分析特异性7.抗干扰能力二、试剂方法的性能验证三、对实验室自配试剂的要求第三章遗传检测报告一、遗传检测报告至少需要包括的信息二、假阳性率的计算三、阳性预测值的计算四、假阴性率的计算五、阴性预测值的计算第四章实验室管理一、什么是实验室SOP?二、对实验室SOP的基本要求三、实验室出现问题后的处理原则四、全面质量管理的工作循环:PCDA五、PCR实验室防止污染的方法。