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海洋生物学本科 开题报告-黄毅彬

:973 CHOICE-C 时间 :2011-5-4 2014.03.15-03.30 膜:GF/F膜 粒径<3um 深度:表层 DCM
测序结果处理:
1.BLAST,KeyDNAtool,Cluster X进行序列比对, 时间:2014.02.15-03.15 去除内含子,引物序列 2.Mothur距离矩阵运算,划分OUT(98%) 2 (1)DNA 提取: 3.Gblocks 软件选择保守区域 试剂盒提取 DNA 4.MegaPromega 4.2和MrBayes 3.2 构建系统进化 树 检测DNA模板质量
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☞ 背景2:微微型定鞭金藻的生态学意义
2.2定鞭金藻在海洋群落结构的重要地位
利用定鞭金藻的特征色素19-hex来指示其叶绿素a生物,估算结果显示在全 球海区,定鞭金藻贡献约30~50%的现存叶绿素a生物量。
(Liu et al., 2009)
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☞ 背景2:微微型定鞭金藻的生态学意义
2012)
终年维持相对较高的生产力, 大洋鱼类的聚集地(Chiang et
al.2004,Chen, Chen et al.2008)
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Outline
一.研究背景 二.研究区域概述 三.研究技术路线 四.进度安排 五.研究特色与预期成果
☞ 技术路线和进度安排:
现场样品采集 样品DNA提取 PCR扩增 测序
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敬请各位老师和同学批评指 正!
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☞ 吕宋海峡区概况
西太平洋水与南海水交换通道 ,常伴有上升流和涡流等中尺 度现象(Gong et al.,1992 Li, Nowlin
采样站位
et al. 1998, Chu and Fan 2001)
受季风影响显著,冬季在西侧 常爆发大规模藻华(Shang, Li et al.
2.3定鞭金藻在群落结构的重要地位
西太平洋
(Wu et al., 2014)
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南海
(Wu et al., unpubl.)
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☞ 背景2:微微型定鞭金藻的生态学意义
2.4 定鞭金藻特殊的营养类型—Mixotrophy
The Key to the Success-Mixotrophy 研究发现,定鞭金藻除了 能通过体内的色素进行光 合作用外,还能摄食细菌 。可能正是这种混合营养 模式,支持了定鞭金藻类 群在寡营养海区的高生物 量。(Zubkov et al.,2008)
☞ 研究的创新点与预期成果:
本研究通过针对热带、亚热带大洋与陆架边 缘海共同作用生态系统中微微型定鞭金藻遗传 多样性的研究,将初步了解吕宋海峡黑潮影响 区区微微型定鞭金藻的遗传多样性 可能将获得热带、亚热带独特的环境序列 学习生物信息学的相关软件的操作和使用, 为后续研究打下基础
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数据分析
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完成论文写作 采用定鞭金藻纲 特异性引物 pry421F,Pry1572R扩增(Simon et al.,2013)
(3)测序 静思笃行 持中秉正
2014.04.01-04.30 (2)PCR :
Outline
一.研究背景 二.研究区域概述 三.研究技术路线 四.进度安排 五.研究特色与预期成果
(Liu et al.,2009)
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电镜显示,定鞭金藻Clade B2的第三条鞭毛较长,推测 通过它来捕食 静思笃行 持中秉正
☞ 背景3:分子生物学在微微型定鞭金藻生物的应
只能分选出真 核大类
耗时,只能鉴 定分离的纯种 特征光合色素: 只能指示出大类 群 培养基存在的选择 偏好性
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(Massana ,2010)
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☞ 背景3:分子生物学手段--定鞭金藻序列
目前的研究表明,测序深度不足, 还有待进一步步研究(eg. 设计特异性引物)
(Liu et al.,2009)
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(Wu et al., unpubl)
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Outline
一.研究背景 二.研究区域概述 三.研究技术路线 四.进度安排 五.研究特色与预期成果
CO2
50%全球初级生产 生物泵是海洋吸收CO2
浮游植物
浮游动物
的重要途径之一
如果生物泵关闭, 那么大气CO2浓度将 上升180 ppm(40%
(Sarmiento et al., 1984) (Falkowski et al., 2002)Βιβλιοθήκη )颗粒有机碳(POC)
☞ 背景2:微微型定鞭金藻的生态意义
2.1 定鞭金藻在开阔海区碳循环的重要作用
Jardillier等(2010)研究表明,Euk-B 类群(其中定鞭金藻约73%)在热带 和亚 热带大西洋海区贡献可达38%的初级生产力。
Euk-B约占CO2 固定量的38%
其中78%属于定 鞭金藻类群
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(Jardillier et al., 2010)
本科毕业论文开题报告
吕宋海峡微微型定鞭金藻遗传多样性 研究
黄毅彬 指导老师:黄邦钦 吴亚平 2014年2月28日
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一.研究背景 二.研究区域概述 三.研究技术路线 四.进度安排 五.研究特色与预期成果
海洋生物泵及其对气候的调控作用 ☞ 背景1: 浮游植物的重要作用
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