运用NCBI 数据库查找目的蛋白序列或目的碱基序列
第 1 种方法
1.打开NCBI 官网,并选择Gene 菜单,如下图。
2.在搜索栏内输入想要查找的蛋白名称或基因名称,此处以基因RSK2 为例,如图。
3.在搜索结果中查找目的蛋白,注意Description 栏会标明物种信息,以human 为例,Aliases 栏会列出目的蛋白的各种别名。
4.在Searchresult 页面中点击你要找的蛋白名称(Name/Gene ID),进入页面并在页面找到“” “NCBI Reference Sequences (RefSeq)”条目,并在其子条目中找到“mRNA and Protein(s) ”,查找mRNA 碱基序列点击NM,查找蛋白氨基酸序列点击NP,以下以查找mRNA 碱基序列为例如下:
点击NM-004586.2 进入页面后如下:
在页面下方会列出mRNA 的序列:
第 2 中方法
1.进入Uniplot 数据库,在搜索栏中直接输入要查找的基因或蛋白名称,如下图:
2.进入以下页面:
3.在搜索结果Entry name 栏中会列出不同物种选项,且会有Protein names 及Gene names,点击所要选择物种蛋白,进入以下页面。
4.点击页面页面左侧的 Sequence 栏,并找到 Sequence databases,其下面表格中有RefSeq i,其中包含 NP 及 NM。
下:。