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实验二 微生物基因组DNA提取和鉴定
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四、实验步骤
2、DNA电泳检测 ( 3)上样电泳:将 20μLDNA 样品溶液和 5μL上样缓冲液混 匀后,上样,100V稳压电泳检查,根据指示剂迁移的位置, 判断是否中止电泳。切断电源后,再取出凝胶。 (4)照胶、拍照:将凝胶泡在EB溶液(注意:EB溶液为剧 毒物,需带上一次性手套拿取凝胶)中10min左右,进入暗 室,使用凝胶成像系统照胶并拍照。
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四、实验步骤
2、DNA电泳检测 (1)1%琼脂糖凝胶:称取0.2g琼脂糖,加入20mL 1×TAE 缓冲液,在微波炉中加热,反复加热、振荡 2-3 次,使琼 脂糖充分融化。待凝胶冷却至60℃左右,倒入插入梳子的 凝胶板中(避免产生气泡),让凝胶自然凝固。 ( 2)待凝胶凝固后,小心拔出梳子,避免前后左右摇晃, 以免破坏胶面及加样孔,小心将凝胶和胶床放入电泳槽中, 加样孔靠近阴极的一端。
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五、实验结果与分析
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图1 微生物组织基因组DNA提取结果
9提取 (1)将10mL过夜培养的大肠杆菌DH5α装入15mL离心管中, 4000r/min离心15min,弃上清。 (2)加入 560μL TE缓冲液,将菌体重悬后转移至 1.5mL离 心管中。 (3)加入30μL 100g/LSDS溶液和30μL 2mg/mL蛋白酶K溶 液,混匀后,37℃水浴放置30min。 (4)加入100μL 5mol/LNaCl溶液,充分混匀。 ( 5 )加入 80μL 50g/LCTAB-0.5mol/LNaCl 溶液,混匀后, 65℃水浴放置10min。
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四、实验步骤
1、DNA的提取 ( 6 ) 加 入 600μL 氯 仿 / 异 戊 醇 , 上 下 颠 倒 混 匀 后 , 12000r/min离心5min,将上清吸入新离心管中。 ( 7 ) 加 入 预 冷 的 异 丙 醇 , 上 下 颠 倒 混 匀 后 , -20 ℃ 沉 淀 30min。 (8)12000r/min离心10min,弃上清。 (9)加入1mL 75%乙醇溶液,充分混匀。 (10)12000r/min离心10min,弃上清。 (11)加入20μL TE缓冲液,混匀后,即为DNA溶液。
实验二 微生物基因组DNA的提取和鉴定
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一、实验目的
学习并掌握从微生物中提取基因组DNA方
法及其原理。
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二、实验原理
(1)微生物破碎细胞方法:溶菌酶、SDS裂解。 (2)破碎抽提核酸除去杂质: ①首先使脱氧核糖核蛋白、核糖体、病毒的核蛋白与 其它成分分离; ②使核酸与蛋白质分离; ③除去脂类; ④多糖的除去。 在EDTA和SDS等去污剂存在下,用蛋白酶K消化细胞, 随后用氯仿/异戊醇抽提,可以得到微生物基因组DNA。
三、仪器和试剂
1、仪器: 低速离心机、高速冷冻离心机、恒温摇床、稳压电源、 水平电泳槽、凝胶成像系统。 2、材料与试剂: 过夜培养的大肠杆菌DH5α、TE缓冲液、100g/LSDS、 2mg/mL蛋白酶K、5mol/L NaCl、50g/LCTAB-0.5 mol/L NaCl、氯仿/异戊醇=24:1(V/V)、异丙醇、1×TAE、 琼脂糖、上样缓冲液。