逻辑符的运算次序是从左至右，括号内的检索式可作为一个 单元，优先运行。
布尔逻辑检索允许在检索词后面附加字段标识
例如：rice[ti] AND Bao YM[au] AND 2008:2009[dp]
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Question1:
如何查找由Zhu J实验室于2005以后发表的, 题目中显示关于 水稻的文献.
名称 生物信息学引论 生物信息学的生物学基础 生物信息学数据库资源 DNA和蛋白质序列分析 系统发生分析 基因表达数据分析 其他常用生物信息学工具 电子克隆的原理和应用 基本生物信息学工具的开发与应用
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3
第三章 生物信息学数据库资源
--数据库查询
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4
GenBank
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Question 2:
如：我要查找BaoYM在Nature或Science上发表的论文
1 Bao YM[au] AND (Nature[Journal] OR Science[Journal]) 2 Bao YM[au] AND Nature OR Science[Journal] 3 Bao YM[au] AND Nature[Journal] OR Science[Journal] 4 Bao YM[au] AND (Nature OR Science)[Journal] 哪一个检索语言是正确的?
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查找蛋白质序列:
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查找EST序列:
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查找Structure:
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查找Structure:
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查找Unigene
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生物信息学 Bioinformatics
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1
Questions:
下列数据库分别是什么类型的数据库?
GenBank, PIR, DDBJ, SWISS-PROT, PDB, EMBL, TrEMBL, MMDB
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2
编号 第一章 第二章 第三章 第四章 第五章 第六章 第七章 第八章 第九章
UniGene 是非冗余的某个基因的集合,包含了该基因所有的 经过实验证明的转录本及其表达信息.
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在PubMed页面上选择Advanced Search:
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19
在PubMed页面上选择Advanced Search:
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在PubMed页面上选择Limits:
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21
在PubMed页面上选择Limits:
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22
期刊检索
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如何获取GenBank中的序列?
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如何获取GenBank中的序列? 同样存在限制字段:
常用的有: Author: Bao YM[au] title: SNARE[ti] organism: rice[organism]
或者直接输入: Accession: AY077725[Accession] Gene Name: ZFP15[Gene Name] Protein Name: ZFP15[Protein Name]
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复杂检索
1. 限制字段类别 常用的有: Author: Bao YM[au] Title: stress[ti] Tilte/Abstract： stress[title/abstract] Date: 1999:2009[dp]
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复杂检索
2. 布尔逻辑运算：
AND、OR、NOT必须大写。
UniGene is an experimental system for automatically partitioning GenBank sequences into a non-redundant set of gene-oriented clusters. Each UniGene cluster contains sequences that represent a unique gene, as well as related information such as the tissue types in which the gene has been expressed and map location.
如: Bao YM[au] AND SNARE[ti] AND rice[organism]
如果没有限定，就是任意字段。
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Question:
从小鼠中查找Bao实验室发布的p53蛋白相关的 DNA序列.
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直接录入注册号查询:
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7
PubMed的特点
收录的文献多!!大部分与生命科学相关 自动词语匹配 链接点多，部分在网上免费获得全文 也可以直接定购原文
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二、检索规则
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9
二、检索规则
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