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核酸适配子的研究进展与应用展望


摘要: 核酸适配子是采用指数富集配体的系统进化( SELEX) 技术从随机单链寡核苷酸库中筛选出的能与靶物质高特
异性、高亲和力结合的配体。核酸适配体由于具有精确识别、易体外合成与修饰等特点, 它已在基础研究、临床诊断与治疗
以及新药研发等诸多领域展示了广阔的应用前景。鉴于其特有的性质, 它们将在环境毒理研究及相关领域, 如环境毒素的
[ 8] Zhu H, Zhou W, Li X, et al. Methyl parathion increases neuronal activities in the rat locus coeruleus 〔J〕. Journal of Biomedical Science, 2004, 11: 732- 738.
1 SELEX 技术的原理及特点 SELEX 技 术 的 基 本 思 路 是 体 外 化 学 合 成 一 个 单 链 寡 核 苷
酸库, 与靶物质混合, 形成靶物质-核酸的复合物, 洗脱未结合的 核酸, 分离与靶物质结合的核酸分子, 并以此核酸分子为模板进 行 PCR 扩增, 再进入下轮的筛选过程。通过重复的筛选与扩增,
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快 速 检 测 、生 物 体 内 毒 性 评 价 、毒 性 阻 断 研 究 上 有 着 广 阔 的 应 用 前 景 。
关键词: 环境污染; 核酸适配子; 环境毒理学源自中图分类号: R994.6
文献标识码: A
Per spective on Resear ch and Application of Nucleic Acid Aptamer s in Envir onment Toxicology WANG Hong-mei, YU Ruo-zhen, QUAN Zhan-jun,et al. Department of Environment Health, Chinese Research Academy of Environmental Sciences, Beijing 100012, China
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环境与健康杂志 2008 年 6 月第 25 卷第 6 期 J Environ Health, June 2008, Vol.25, No.6
文章编号: 1001-5914( 2008) 06-0558-03
【综述】
核酸适配子的研究进展与应用展望
王红梅, 余若祯, 全占军, 车飞, 林海鹏
( 收稿日期: 2007-10-12) ( 本文编辑: 高申)
环境与健康杂志 2008 年 6 月第 25 卷第 6 期 J Environ Health, June 2008, Vol.25, No.6
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一些与靶物质不结合或与靶物质有低亲和力、中亲和力的 DNA 或 RNA 分子被 洗 去 , 而 将 称 之 为 “适 配 子 ”的 、与 靶 物 质 有 强 亲 和 力 的 DNA 分 子 或 RNA 分 子 从 非 常 大 的 随 机 库 中 分 离 出 来 , 且 纯 度 随 SELEX 过 程 的 进 行 而 增 高 , 从 pmol 到 nmol, 有 的 甚 至到 μmol, 最后占据库的大多数( >90%左右) [1]。可将 SELEX 技 术筛选核酸适配 PCR 扩增的引物) , 中间约 25~30 个寡核苷酸是随机排列的, 所 以 文 库 的 总 量 可 达 1014~1015; ( 2) 文 库 的 筛 选 : 将 靶 分 子 与 文 库 进 行 孵 育 后 可 采 取 滤 膜 法 、磁 珠 法 、毛 细 管 电 泳 法 或 柱 层 析 等 不 同 的 分 离 方 法 分 离 与 靶 分 子 结 合 的 寡 核 苷 酸 -重复筛选, 一般约 筛 选 4~20 轮 ; ( 4) 文 库 表 征 与 效 应 评 价 : 最 后 进 行 克 隆 测 序 并 鉴定所筛选的核酸适配子与靶分子结合的特异性和亲和力, 也 可通过后续实验验证所得适配子与靶分子结合的最短序列。
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基金项目: 国家环境保护总局环保公益项目( HBGY2007090227) 作者单位: 中国环境科学研究院 环境与健康研究室( 北京 100012) 作者简介: 王红梅( 1971- ) , 女, 博士, 副研究员, 从事环境毒理学研究。
酸结合蛋白( 如细胞生长因子、激素、小分子肽、抗体等) 、小分子 有 机 物 ( 如 ATP, 氨 基 酸 等 ) 、金 属 离 子 、病 毒 颗 粒 、人 红 细 胞 膜 等 , 核酸适配子在基 础 研 究 、临 床 研 究 、药 物 开 发 中 的 应 用 也 不 断 增 多 [3- 6]。 笔 者 针 对 核 酸 适 配 子 原 理 及 已 取 得 的 研 究 成 果 进 行 介绍, 并对其在环境毒理及其相关领域的研究前景进行探讨。
Key wor ds: Environmental pollution;Nucleic acid aptamers; Environmental toxicology
配 体 指 数 级 富 集 系 统 进 化 技 术 ( systematic evolution of ligands by exponential enrichment, SELEX) 是一种组合化学技术, 它可从大容量的寡核苷酸库中筛选出对靶分子结合具有高特异 性 和 高 结 合 性 的 核 酸 适 配 子 ( aptamer, 又 称 适 配 体 ) 。1990 年 , Ellington 和 Tuerk 等[1-2]用 SELEX 技 术 分 别 筛 选 出 能 与 DNA 聚 合酶和有机染料特异性结合的随机寡核苷酸, 并将其命名为核 酸适配子( nucleic acid aptamers) 。此后, 用于筛选的靶分子从核 酸结合蛋白 ( 如 DNA 聚 合 酶 、复 制 酶 、逆 转 录 酶 等 ) 扩 展 到 非 核
Abstr act: Nucleic acid aptamers are ligands with high specificity and affinity for their targets, which are screened from large oligonucleotide pools by the SELEX (systematic evolution of ligands by exponential enrichment, SELEX) technology. For their specific character, they have shown the great applicative prospects in the environment toxicology and related research fields. The recent related researches were reviewed in the present paper.
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