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●Байду номын сангаас
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GT—AG法则： 序列分析表明，几乎每个内含子5’端起 始的两个碱基都是GT，而3’端最后两个碱基 总是AG，由于这两个碱基的高度保守性和广 泛性，有人把它称为GT—AG法则，即： 5’GT．．．．．．AG 3’。 剪接信号
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P102
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hnRNP
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RNA剪接真 正识别的是 hnRNP，而 不是前体 mRNA
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1. RNA序列决定了剪接的发生位点
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比较不同基因的核苷酸序列发现, mRNA前 体中内含子的两端边界存在共同的序列，这 些序列结构可能是产生 mRNA前体剪接的 信号。
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RNA的再编码:mRNA可以改变原来的 编码信息，在某些情况下不是以固定的 方式被翻译，科学上把RNA的编码和读 码方式的改变
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方式：mRNA的读码信号在tRNA、 rRNA、和其他蛋白因子作用下发生+1/1移码； 核糖体跳跃50个核苷酸； 终止子通读
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总结
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Ⅰ类和Ⅱ类内含子及细胞核RNA这三类内含子的剪 接都是通过两次连续的转酯反应进行的。在第一次 转酯反应中，由一个游离羟基（在细胞核基因内含 子和Ⅱ类内含子中由内部2’羟基提供，Ⅰ类内含子 中由一个游离的G提供）发动对5’外显子-内含子连 接点的攻击。 第二次转酯反应中，已经释放的外显子末端的游离 3’羟基接着攻击3’内含子-外显子的连接点。在反应 中，磷酸二酯键的数目是保守的，所以反应不需要 额外能量，这是剪接进化的一个重要特征。
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在剪接反应前后，磷酸二酯键的数目是不变 的，只是由原来的外显子-内含子之间的两个 5-3 磷酸二酯键变为两个外显子之间的5 -3 和内含子本身的套索结构中的5 -2 磷酸二 酯键。 转酯反应(transesterification) 酯键从一个位臵转移到另一个位臵。
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5. I 类和II类内含子
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根据内含子的结构特点及其剪接机制把他们划 分为: I类内含子 II类内含子 细胞核RNA（GU-AG, AU-AC)
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3.8.3. RNA的化学修饰
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只含有70-100个核苷酸的核仁RNA(snoRNA) 参与RNA的化学修饰 这些RNA通过碱基配对的方式，把rRNA分 子上需要修饰的位点找出来。
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低等真核生物、细菌-Ⅰ类内含子 细胞器（线粒体，叶绿体）-Ⅱ类内含子。
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Ⅰ类和Ⅱ类内含子是根据它们的内部组成分 类的。每种内含子都可以折叠成典型的二级 结构。 Ⅰ类和Ⅱ类内含子含有RNA自我切割的能力， 称为自我剪接。
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Ⅰ类内含子
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内含子两端序列不能互补； 连接区序列高度保守, GT-AG法则。序列分析表明， 几乎每个内含子5’端起始的两个碱基都是GT，而3’ 端最后两个碱基总是AG，由于这两个碱基的高度保 守性和广泛性，有人把它称为GT—AG法则，即： 5’GT．．．．．AG 3’。 按照内含子方向，左边的称为5剪接位点（5 splice site,又叫供体位点（donor site),右边的称为3剪接位 点（3 splice site) 又叫受体位点（acceptor site).
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3. RNA剪接大多发生在剪接体上
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细胞核中的小分子RNA称为细胞核小RNA （small nuclear RNA, snRNA） 细胞质中的小分子RNA称为细胞质小RNA （small cytoplasmic RNA, scRNA) 在自然状态下，它们以核糖核蛋白颗粒 （snRNP 和 scRNP)形式存在，俗称snurps 和 scyrps 在核仁中也存在着一类小的RNA，称为核仁 小RNA （small nucleolar RNA, sno RNA),它 们在核糖体RNA的加工中起作用。
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由UACUAAC的保守A通过2 羟基对5剪接位点发动 亲核攻击，内含子5 端切开，内含子5 端的保守G的 5位与分支点保守的A的2位形成磷酸二酯键（5 -2 磷酸二酯键）而产生套索结构。
第一步中释放的外显子的游离3羟基攻击3剪接位点中 的键。内含子3 剪接点被切断，套索结构释放，同时， 外显子连在一起。 内含子的套索结构被切开，形成线状并很快被释放。
游离的鸟苷或鸟苷酸介导， 鸟苷或鸟苷酸的3 -OH 作 为亲核基团攻击内含子5 端的磷酸二酯键，从上游 切开RNA链。（第一个转 酯反应） 上游外显子的自由3 -OH 作为亲核基团攻击内含子3 位核苷酸上的磷酸二酯键， 使内含子被完全切开，上 下游两个外显子通过新的 磷酸二酯键连接。 （第二 个转酯反应）
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Ⅱ类内含子
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内含子本身的靠近3端的腺苷酸2 -OH作为 亲核基团攻击内含子5端的磷酸二酯键，从上 游切开RNA链后形成套索状结构。（第一个 转酯反应） 上游外显子的自由3 -OH作为亲核基团攻击 内含子3 位核苷酸上的磷酸二酯键，使内含 子被完全切开，上下游两个外显子通过新的 磷酸二酯键连接。 （第二个转酯反应）
1. 长度和序列没有共 同性，一般16-46 个核苷酸 2. 位于反密码子下游 3. 内含子和外显子间 的边界没有保守序 列
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真核生物tRNA的加工
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内含子的剪接 3‘端添加CCA 核苷酸修饰。
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3.7.3 真核生物rRNA的转录后加工
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snRNP：ribonucleo protein particle（许多相 对分子质量较小的核内RNA（snRNA, small nuclear RNA)以及与这些RNA结合的核蛋白， 参与mRNA的剪接。 参与剪接的snRNP包括U1，U2，U5，U4， U6，他们根据所含有的sn RNA而命名，每个 snRNP 含有一个snRNA 和几种蛋白质。
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