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粳稻柱头外露率QTL定位

粳稻柱头外露率Q T L 定位李威1,#㊀圣忠华2,#㊀朱子亮1㊀魏祥进2㊀石磊1㊀邬亚文2㊀唐绍清2㊀王建龙1,∗胡培松1,2,∗(1湖南农业大学农学院,长沙410128;2中国水稻研究所,杭州310006;#共同第一作者;∗通讯联系人,E Gm a i l :w jl 9678@126.c o m )Q T L M a p p i n g o f j a po n i c a R i c eS t i g m aE x s e r t i o nR a t e L IW e i 1,#,S H E N GZ h o n g h u a 2,#,Z HUZ i l i a n g 1,W E IX i a n g j i n 2,S H IL e i 1,WU Y a w e n 2,T A N GS h a o q i n g 2,WA N GJ i a n l o n g 1,∗,HUP e i s o n g1,2,∗(1C o l l e g eo f A g r o n o m y ,H u n a n A g r i c u l t u r a lU n i v e r s i t y ,C h a n gs h a410128,C h i n a ;2C h i n a N a t i o n a lR i c e R e s e a r c hI n s t i t u t e ,H a n g z h o u310006,C h i n a ;#T h e a u t h o r s c o n t r i b u t e de q u a l l y t o t h i sw o r k ;∗C o r r e s p o n d i n g a u t h o r ,E Gm a i l :w jl 9678@126.c o m )A b s t r a c t :ʌO b j e c t i v e ɔS t i g m a e x s e r t i o n i so n eo f t h e i m p o r t a n t t r a i t sw h i c hc o n t r i b u t e t o t h ee f f i c i e n t i m pr o r e m e n t o f c o mm e r c i a l s e e d p r o d u c t i o n i nh y b r i d r i c e .T h e o b j e c t i v e o f t h e s t u d y wa s t ou n d e r s t a n d t h e g e n e t i c f a c t o r s i n v o l v e d i n t h e s i g m a e x s e r t i o n .ʌM e t h o d ɔT h eF 2a n dF 2:3p o p u l a t i o n so fD aSˑD 50p l a n t e d i nL i n gs h u i ,H a i n a nP r o v i n c ea n d H a n g z h o u ,Z h e j i a n g P r o v i n c e ,r e s p e c t i v e l y w e r eu s e da n dt h es i n g l es t i g m ae x s e r t i o nr a t e (P S E S ),d o u b l es t i gm a e x s e r t i o n r a t e (P D E S )a n dt o t a l s t i g m ae x s e r t i o nr a t e (P E S )w e r e m e a s u r e d .ʌR e s u l t ɔC o r r e l a t i o na n a l y s i s i n d i c a t e d t h a t t h e r ew e r e s i g n i f i c a n t r e l a t i o n s h i p s a m o n g t h eP S E S ,P D E Sa n dP E S .F u r t h e r ,t h e g e n e t i c l i n k a g em a p ofD a S ˑD 50F 2p o p u l a t i o nw a s c o n s t r u c t e d ,t h e n ,21s t i gm a e x s e r t i o n r a t eQ T Lw e r e l o c a t e d o n c h r o m o s o m e 1,2,3,4,6,7a n d 12,r e s p e c t i v e l y ,w i t ht h ec o n t r i b u t i o nr a t er a n g i n g f r o m 0.1%t o57.6%.T h ea d d i t i v ee f f e c to fm o s tQ T L sw e r e c o n t r i b u t e db y h i g h v a l u e p a r e n tD a S e x c e p t f o r s o m eQ T L t h a tw i t h e x t r e m e l yl o wc o n t r i b u t i o n r a t e .T h e r ew e r e t w o Q T L s o nC h r o m o s o m e 4a n dC h r o m o s o m e12,q P D E S 4a n d q P E S 12,b o t hd e t e c t e d i nF 2a n dF 2:3p o p u l a t i o n sw i t h c o n t r i b u t i o nr a t ea sh i g ha s17.86%a n d16.98%,r e s p e c t i v e l y .T h e q P E S 3l o c a t e do n C h r o m o s o m e3w i t hh i gh c o n t r i b u t i o n r a t ew e r e d e t e c t e d i nF 2:3p o p u l a t i o n f o r t w o t i m e s .ʌC o n c l u s i o n ɔS o m e s t i g m a e x s e r t i o nr a t eQ T Ls h a r e d t h e s a m el o c a t i o n w i t ht h o s er e p o r t e db y ot h e rr e s e a r c h e r s ,b u tt h e r e w e r ea l s os o m en e w Q T L s w h i c h p r o v i d e t h e o r e t i c a l s u p p o r t f o r f u r t h e r f i n e Gm a p p i n g ,g e n ec l o n i n g ,a n db r e e d i n g n e w j a po n i c a m a l es t e r i l el i n e sw i t hh i g h s t i g m a e x s e r t i o n r a t eb y u s i n g mo l e c u l a rm a r k e r Ga s s i s t a n t s e l e c t i o n .K e y wo r d s :s t i g m a e x s e r t i o n r a t e ;Q T L m a p p i n g ;m a r k e r Ga s s i s t a n t s e l e c t i o n (MA S );j a p o n i c a r i c e 摘㊀要:ʌ目的ɔ柱头外露是影响杂交水稻制种的一个重要性状.本研究旨在初步鉴定控制柱头外露率的Q T L .ʌ方法ɔ以高柱头外露率粳稻两系不育系大S ˑ低柱头外露率热带粳稻品系D 50的F 2群体及海南陵水㊁浙江杭州两地重复种植的F 2:3群体为材料,考查F 2群体及陵水㊁杭州两地两次重复F 2:3群体单边柱头外露率(P S E S )㊁双边柱头外露率(P D E S )和柱头总外露率(P E S ).ʌ结果ɔ相关分析表明,单边柱头外露率㊁双边柱头外露率和柱头总外露率之间存在极显著的正相关.根据构建的大S ˑD 50F 2群体遗传连锁图谱,Q T L 分析检测到水稻柱头外露率Q T L21个,分布于第1㊁2㊁3㊁4㊁6㊁7和12染色体上,贡献率变幅为0.1%~57.6%,除个别贡献率极低的位点外,绝大部分Q T L 加性效应来自于高值亲本大S .其中位于第4染色体和第12染色体的两个位点q P D E S 4,q P E S 12在F 2和两次重复F 2:3群体中均检测到,贡献率分别达17.86%和16 98%.位于第3染色体的q P E S 3位点在陵水㊁杭州两次F 2:3群体中重复检测到,贡献率高达25.6%.ʌ结论ɔ检测到的Q T L ,有些与其他学者报道的处于同一位置,有些则是新的柱头外露率Q T L .这些水稻柱头外露率Q T L 为今后柱头外露率基因精细定位㊁克隆㊁以及利用分子标记辅助选择(MA S )选育高柱头外露率粳型不育系提供理论依据.关键词:柱头外露率;Q T L 定位;分子标记辅助选择(MA S);粳稻中图分类号:Q 343.1+5;S 511.0351㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀文献标识码:A㊀㊀㊀文章编号:1001G7216(2017)01G0023G08收稿日期:2016G03G14;修改稿收到日期:2016G07G19.基金项目:国家自然科学基金资助项目(31501285);浙江省自然科学基金资助项目(L Y 14C 130009);浙江省公益技术应用研究计划资助项目(2015C 32045).32中国水稻科学(C h i nJR i c eS c i ),2017,31(1):23-30h t t p ://w w w.r i c e s c i .c n D O I :10.16819/j.1001G7216.2017.6043㊀㊀水稻是我国最主要的粮食作物之一.水稻单产的高低事关我国粮食安全.近半个世纪以来,三系和两系杂交水稻体系相继研制成功,大大提高了我国水稻单产,保障了我国的粮食安全[1,2].然而杂交水稻在发展初期也受诸多因素困扰,其中尤为突出的是制种产量低㊁异交结实差,从而导致制种成本居高不下,限制了杂交水稻尤其是杂交粳稻的大面积推广[3].在水稻的驯化进程中,水稻的天然异交结实率由野生稻的100%降至栽培稻的2%~4%[4]. Y i n g等[5]考查了2065份非洲稻种资源的柱头外露率情况,发现柱头外露率从斑点野生稻(100%)㊁长药野生稻(85.7%)㊁非洲野生稻(54.9%)㊁巴蒂野生稻(34.8%)㊁杂草型野生稻(20.0%)㊁亚洲栽培稻(1 0%)依次降低.柱头外露率在水稻籼粳亚种间差异显著,尤其籼粳不育系之间,一般而言,籼稻品种的柱头外露率普遍高于粳稻品种[6].粳稻品种柱头外露率低,特别是低柱头外露率的粳稻不育系,异交结实差,制种产量低,严重制约着杂交粳稻的发展.目前对于控制杂交水稻异交特性,尤其是水稻柱头外露率的分子机理研究尚不够深入;国内外学者大多利用籼型高柱头外露率水稻与粳型低柱头外露率水稻品种构建临时性或永久性群体,筛选检测控制水稻柱头外露率的Q T L[7].邓应德等[8]利用柱头外露率差异显著的优ⅠB和糯5号构建F2群体,检测到3个分别位于第2㊁5㊁8染色体的柱头外露率Q T L:q P E SG2㊁q P E SG5㊁q P E SG8,贡献率分别为10.1%,11.1%,9.0%,另外,他们利用高柱头外露率亲本ⅡG32B和低柱头外露率亲本冈46B构建F2定位群体,采用单标记法成功筛选到分别位于第1㊁2㊁5㊁8染色体上的4个柱头外露率Q T L,其中位于第5染色体的位点贡献率最高,达到16.65%,被认为是主效Q T L[9].王嫘等[10]利用高柱头外露率品种D S和低柱头外露率品种C9083构建的F2定位群体,共检测到16个分别位于第1㊁3㊁7㊁9染色体上的柱头外露率相关Q T L,其中q P S E SG1a的L O D达到12.18,贡献率为37.62%, q P D E SG3a的L O D达到14.99,贡献率为31.18%, q P E SG3b的L O D达到19.69,贡献率为41.91%;增效基因均来自于D S,是迄今为止鉴定的贡献率最高的Q T L.冯玲玲等[11]以高柱头外露率的不育系50S作母本,低柱头外露率的连B为父本,构建F2定位群体,共检测到分别位于第3㊁9㊁12染色体上的3个Q T L(q P E SG3,q P E SG9,q P E SG12);增效基因均来自于不育系50S.岳高红等[12]利用旱稻保持系沪旱1B与ⅡG32B构建临时F2群体,检测到位于第3㊁7㊁9染色体的3个单边外露率位点,位于第3㊁9染色体的2个双边外露率位点和位于第3㊁4㊁7㊁9染色体上的5个总柱头外露率位点,其中位于第3染色体R M6932-R M6959区间的q P E SG3同时控制单边外露㊁双边外露和总柱头外露.M i y a t a等[13]利用I R24和K o s h i h i k a r i构建的F2群体定位到第3染色体上的柱头外露率位点q P E SG3,该位点成功地在水稻新育品种中增加了20%的外露率.同时,研究表明,G S3也位于该区间内,G S3在增长粒型的同时增加了柱头的细胞数目,导致柱头伸长,进而提高柱头外露率.对于临时性F2群体检测到的Q T L存在遗传不稳定性,同时受环境影响,因而其检测准确性不高.永久性遗传群体,由于遗传稳定,可多年多点重复实验,故检测到的Q T L相对可靠.尹成等[14]使用岳早籼9号和ⅡG32B构建的重组自交系群体,共检测到16个分别位于第1㊁3㊁5㊁6㊁7㊁9染色体上的Q T L,其中只有第1㊁9染色体上的位点在两年的重复数据中被稳定检测到.沈圣泉等[15]使用协青早Bˑ密阳46构建的R I L群体和相应的分子遗传图谱,设置海南和浙江两点试验,检测到一个L O D为28.16,贡献率为14.14%的柱头外露率Q T L.此外,H u等[16]利用保持系珍汕97B和I R A T109构建重组自交系,在正常和干旱胁迫条件下分别检测到3个和4个柱头外露率Q T L,其中仅有q P E SG1在两种环境下都能检测到.李勇等[17]用川香29BˑL e m o n t的F5群体,检测到3个柱头外露率Q T L,分别位于3条染色体上,命名为q P E SG1㊁q P E SG2㊁q P E SG10.李文宏等[18]利用籼稻品种窄叶青8号和粳稻品种京系17构建的D H群体,成功地在第2㊁3染色体上分别定位到2个Q T L:q P E SG2和q P E SG3,同时认为总柱头外露率和单边柱头外露率的Q T L位点一致.由于水稻柱头外露率特性属数量性状,遗传不稳定,受环境因素影响较大,故不同学者采用不同的定位群体检测到的水稻柱头外露率Q T L位点差异较大.本研究以高柱头外露率的粳稻两系不育系大S 为材料,通过与低柱头外露的热带粳稻品种D50杂交构建F2及F2:3遗传群体,对不同世代群体柱头外露性状重复调查分析,旨在初步鉴定稳定遗传的控制大S高柱头外露率的Q T L.研究结果为进一步42中国水稻科学(C h i nJR i c eS c i)㊀第31卷第1期(2017年1月)探究控制水稻柱头外露率基因的克隆,基因功能分析等分子机理提供理论指导.同时对育种家利用分子标记辅助选择(MA S )选育高柱头外露的粳型不育系,突破杂交粳稻制种瓶颈,促进杂交粳稻发展提供技术支持.1㊀材料与方法1.1㊀供试材料大S 为高柱头外露率的粳稻两系不育系;D 50为低柱头外露率的热带粳稻品种;大S ˑD 50F 2群体包含177个正常可育单株,F 2:3群体包含F 2群体衍生的177个株系.1.2㊀群体构建及农艺性状考查2013年夏以大S 为母本㊁D 50为父本杂交,收F 1;2013年冬季种植F 1于海南陵水,去杂后收F 1种子;2014年夏季种植F 2群体于杭州.在抽穗期,从中随机选择177个正常可育单株编号,待其开花完全后取各单株一个主穗及分蘖穗分别考查单边柱头外露率(P S E S )㊁双边柱头外露率(P D E S )及柱头总外露率(P E S ).F 2群体成熟时按单株编号收种即为F 2:3株系.各单株种子分成两份.2014年冬,将亲本及177个F 2:3株系种植于海南陵水,待开花完全后每株系随机取6株主穗考查单边柱头外露率㊁双边柱头外露率及柱头总外露率;2015年夏季,将亲本与另一份177个F 2:3株系种植于杭州,待开花后每株系随机选取6株主穗,考查单边柱头外露率,双边柱头外露率及柱头总外露率.柱头外露率计算方法如下:单边柱头外露率(%)=单边柱头外露颖花数/总颖花数ˑ100%;双边柱头外露率(%)=双边柱头外露颖花数/总颖花数ˑ100%;柱头总外露率(%)=单边柱头外露率+双边柱头外露率.1.3㊀S S R 分子标记连锁图谱构建及Q T L 定位分析S D S 法提取亲本及177个F 2单株DN A [19].利用本实验室的556对以及擎科生物公司合成的83对均匀分布于水稻12条染色体上的S S R 标记筛选大S 和D 50之间的多态性.利用筛选出的均匀分布在水稻12条染色体上且在大S 和D 50间具有多态性的131对S S R 标记对177个F 2单株进行基因型分析,采用M a pM a k e r 3.0软件构建连锁图谱.遗传连锁图谱结合各项表型数据,采用W i n Q T Lc a r t o g r a ph e r2.5软件,取L O Dȡ2.5进行Q T L 分析[20].采用M c C o u c h 命名系统对Q T L 命名[21].2㊀结果与分析2.1㊀大S ˑD 50F 2㊁F 2:3群体及亲本柱头外露率表型分析大S 为高柱头外露率粳稻不育系,D 50为低柱头外露率热带粳稻品种,其表型见表1和图1.大S ˑD 50F 2和F 2:3群体,两代三次实验的柱头外露率表型统计参数和表型分布见图表1和图2.F 2及F 2:3群体柱头外露率表型分离明显,呈连续正态分布(图2),显示出数量性状的特征,并有超亲分离现象;其中单边柱头外露率在两年三次重复中的偏值表1㊀大S ˑD 50F 2与F 2:3群体及亲本的柱头外露率表型T a b l e 1.T h e s t i g m a e x s e r t i o n r a t e o f F 2a n dF 2:3p o p u l a t i o n s o fD a S ˑD 50c o m b i n a t i o n .性状T r a i t 世代G e n e r a t i o n 地点S i t eF 2和F 2:3分离群体S e g r e g a t i o n p o p u l a t i o no f F 2a n dF 2:3变幅V a r i a t i o n /%M e a n ʃS D /%峰值P e a k 偏值P a r t i a l亲本P a r e n t /%D 50大S D aSP S E SF 2浙江杭州H a n g z h o u ,Z h e j i a n g5~5442ʃ1.96.32-1.962038F 2:3海南陵水L i n g s h u i ,H a i n a n 3~5136ʃ2.21.47-1.041936F 2:3浙江杭州H a n g z h o u ,Z h e j i a n g 2~4938ʃ2.23.94-1.562431P D E SF 2浙江杭州H a n g z h o u ,Z h e j i a n g 0~5724ʃ2.6-0.530.18247F 2:3海南陵水L i n gs h u i ,H a i n a n 0~3714ʃ2.3-0.280.45246F 2:3浙江杭州H a n g z h o u ,Z h e j i a n g 0~4918ʃ2.8-0.140.62442P E SF 2浙江杭州H a n g z h o u ,Z h e j i a n g 5~9165ʃ2.91.36-1.032285F 2:3海南陵水L i n g s h u i ,H a i n a n 3~8350ʃ3.10.02-0.372182F 2:3浙江杭州H a n g z h o u ,Z h e j i a n g2~8657ʃ3.30.14-0.542873㊀㊀P S E S -单边外露率;P D E S -双边外露率;P E S -柱头总外露率.下同.P S E S ,P e r c e n t o f s i n g l e s t i g m a e x s e r t i o n ;P D E S ,P e r c e n t o f d o u b l e s t i g m a e x s e r t i o n ;P E S ,P e r c e n t o f t o t a l s t i gm a e x s e r t i o n .T h e s a m e a s i n t a b l e s b e l o w.52李威等:粳稻柱头外露率Q T L 定位A-大S (左)和D 50(右)的植株表型;B -大S 的柱头外露表型;C -D 50的柱头外露表型.A ,P l a n tm o r p h o l o g y o fD aS (l e f t )a n dD 50(r i g h t );B ,P h e n o t y p e o fD aS s t i g m a e x s e r t i o n ;C ,P h e n o t y p e o fD 50s t i gm a e x s e r t i o n .图1㊀大S 和D 50柱头外露表型F i g .1.P h e n o t y p e o f s t i gm a e x s e r t i o n o fD a S a n dD 50.图2㊀大S ˑD 50F 2和F 2:3群体柱头外露率频率分布F i g .2.T h e f r e q u e n c y d i s t r i b u t i o n s o f s t i g m a e x s e r t i o n r a t e o f F 2a n dF 2:3p o pu l a t i o n s o fD a S ˑD 50c o m b i n a t i o n .小于-1;双边柱头外露率与柱头总外露率偏值基本在ʃ1以内(表1),表明基本呈正态分布,符合Q T L 作图要求.单边柱头外露率㊁双边柱头外露率及柱头总外露率表型频率分布在两代三次实验中基本一致,显示出较好的重复性.2.2㊀大S ˑD 50F 2㊁F 2:3群体柱头外露率性状间相关性显著对大S ˑD 50的F 2和F 2:3群体柱头外露率性状间相关性分析(表2)表明:单边柱头外露率㊁双边柱头外露率及柱头总外露率三个性状之间在两代三次实验中均表现出极显著的正相关,表明水稻柱头外露率性状之间关系密切,互相影响.2.3㊀大S ˑD 50F 2㊁F 2:3群体柱头外露率的QT L 分析利用131对在大S 与D 50之间表现多态性的S S R 标记,采用M a pM a k e r 3.0构建了遗传连锁图谱,图谱总长为1865.6c M ,平均距离为14.6c M .采用W i nQ T Lc a r t o g r a ph e r 2.5进行Q T L 区间作62中国水稻科学(C h i nJR i c eS c i )㊀第31卷第1期(2017年1月)表2㊀大S ˑD 50F 2㊁F 2:3群体柱头外露率性状间的相关分析T a b l e 2.C o r r e l a t i o n a n a l y s i s a m o n g s t i g m a e x s e r t i o n r a t e i nF 2a n dF 2:3p o pu l a t i o n s o fD a S ˑD 50c o m b i n a t i o n .群体P o pu l a t i o n 地点S i t e性状T r a i t单边外露率P S E S双边外露率P D E S F 2浙江杭州H a n g z h o u ,Z h e j i a n g P D E S 0.302∗∗P E S 0.693∗∗0.903∗∗F 2:3海南陵水L i n g s h u i ,H a i n a n P D E S 0.769∗∗P E S 0.938∗∗0.942∗∗F 2:3浙江杭州H a n g z h o u ,Z h e j i a n gP D E S 0.532∗∗P E S 0.808∗∗0.928∗∗图分析(表3和图3),两代3次重复共检测到21个柱头外露率Q T L ,分别位于第1㊁2㊁3㊁4㊁6㊁7㊁12染色体上,其中单边柱头外露率Q T L6个,双边柱头外露率Q T L7个,柱头总外露率Q T L8个;至少在两次重复中检测到的Q T L 有5个,分别为q P S E S3.1,q P S E S 12,q P D E S 4,qP E S 4和q P E S 12,其中q P S E S 12㊁q P D E S 4和q P E S 12在F 2及2个F 2:3群体中均被检测到,且其加性效应均来自于高值亲本大S ,表明这些Q T L 受环境影响相对较小,不同条件下都能稳定遗传表达.P S E S ,P e r c e n t o f s i n g l e s t i g m a e x s e r t i o n ;P D E S ,P e r c e n t o f d o u b l e s t i g m a e x s e r t i o n ;P E S ,P e r c e n t o f t o t a l s t i gm a e x s e r t i o n .图3㊀大S ˑD 50F 2与F 2:3群体检测到的柱头外露率QT L F i g .3.T h e s t i g m a e x s e r t i o n r a t e Q T L s d e t e c t e d i nF 2a n dF 2:3p o pu l a t i o n s o fD a S ˑD 50c o m b i n a t i o n .72李威等:粳稻柱头外露率Q T L 定位表3㊀大SˑD50F2与F2:3群体检测到的柱头外露率Q T L分布T a b l e3.T h e Q T Ld i s t r i b u t i o n s o f s t i g m a e x s e r t i o n r a t e d e t e c t e d i nF2a n dF2:3p o p u l a t i o n s o fD a SˑD50.性状T r a i t Q T L染色体C h r标记区间M a p p i n g i n t e r v a lF2(杭州)F2(H a n g z h o u)L O D加性效应A d d i t i v ee f f e c t/%贡献率C o n t r i b u t i o nr a t eF2:3(陵水)F2:3(L i n g s h u i)L O D加性效应A d d i t i v ee f f e c t/%贡献率C o n t r i b u t i o nr a t e%F2:3(杭州)F2(H a n g z h o u)L O D加性效应A d d i t i v ee f f e c t/%贡献率C o n t r i b u t i o nr a t e%有文献报道的Q T L位点Q T Lr e p o r t e db yo t h e r r e s e a r c h e r sP S E S q P S E S22R M3340-R M56643.042.203.82[9] q P S E S44R M273-R M38363.07-3.589.59q P S E S1212R M1036-R M34482.520.500.273.66-6.7416.983.39-0.340.12[24] q P S E S3.13R M5474-R M148983.99-5.5821.874.03-5.5825.60[10,14,22] q P S E S11R M11307-R M67385.19-7.2935.51[17,22,23] q P S E S3.23R M168-R M35253.12-12.8557.67P D E S q P D E S11R M8068-R M37463.02-4.356.24[22,24] q P D E S2.12R M5430-R M64244.14-5.4210.77[17,25] q P D E S44R M16942-R M173035.78-7.0117.865.35-4.7816.043.83-4.9210.17q P D E S6.16R M3183-R M11612.66-2.272.93q P D E S1212R M1036-R M34484.50-6.237.61[24] q P D E S6.26R M201552.84-0.580.14q P D E S2.22R M3340-R M56643.042.100.043.905.970.12[8] P E S q P E S2.12R M5430-R M64243.77-7.5512.56[17,25] q P E S44R M16942-R M173036.06-9.9320.403.49-8.4814.46q P E S6.16R M3183-R M11612.59-3.302.56q P E S77R M221052.754.835.14[14,23] q P E S1212R M1036-R M34485.68-9.3810.033.75-2.181.053.24-0.480.81[24] q P E S33R M5474-R M10225.09-10.7823.74[14,22,10] q P E S2.22R M3340-R M56642.98-8.6510.18[9] q P E S6.26R M34142.564.593.71㊀㊀在大SˑD50F2群体,以及陵水㊁杭州的F2:3群体中检测到的单边柱头外露率Q T L共有6个,分别为q P S E S1㊁q P S E S2㊁q P S E S3.1㊁q P S E S3.2㊁q P E S4㊁q P S E S12,贡献率为0.12%~57.67%(表3和图3).其中q P S E S12在F2群体,以及陵水㊁杭州F2:3群体中均被检测到,该位点在F2群体的加性效应来自于D50,但贡献率极低;在陵水和杭州F2:3群体中被检测的加性效应来自于大S,贡献率达16 98%.q P S E S3 1在陵水㊁杭州F2:3群体中均检测到,贡献率达25 6%,来自大S的等位基因可解释表型变异的5 58%.在这些被检测到的单边柱头外露率Q T L中,绝大部分位点的加性效应均来自大S.3㊀讨论本研究利用高柱头外露率的粳稻两系不育系大S为研究材料所定位到的水稻柱头外露率Q T L,部分与其他学者利用高柱头外露率的籼稻品种为研究对象所得到的研究结果相似,同时也检测到新的稳定遗传的柱头外露率Q T L(表3).本研究共检测到21个水稻柱头外露率Q T L,位于10个标记区间.其中位于同一区间的控制单边外露率的q P E S3.1和总外露率的q P E S3,在尹成等[14]㊁李海滨等[22]和王嫘等[10]的研究中均见报道,且贡献率较高;在王嫘等[10]的研究中贡献率更是高达31.18%;本研究在两次重复的F2:3群体中检测到,其贡献率分别达到21.87%和25.60%.本研究检测到的单边柱头外露率位点q P S E S1与李勇等[17]㊁李海滨等[22]和W e n等[23]的报道中类似.本研究控制双边外露率的q P D E S1与李海滨等[22]所报道的q P E SG1,L i等[24]所报道的q P D E SG1位于同一个区间;另外,本研究同时控制单边㊁双边和柱头总外露率的Q T L区间有3个,分别是第2染色体的R M3340-R M5664㊁第4染色体的R M16942-R M17303和第12染色体的R M1036-R M3448,其中,除第4染色体的定位区间外,第2染色体和第12染色体所定位区间分别与邓应德[9]等检测到的与R M3188紧密连锁的Q T L,L i等[24]报道的q S S EG12位置相近.此外,本研究中q P D E S2.1㊁q P E S2.1与李勇等[17]报道的q P E SG2,陈爱国等[25]检测到的q P G C E SG2两个位点同属R M5430-R M6424区间.与标记R M22105紧密连锁的q P E S7和尹成等[14]所报道的q P D E SG7G2位置非常接近.不同学者检测水稻柱头外露率Q T L位点存在相似性,表明确实存在控制水稻柱头外露的Q T L及基因,值得进一步的基因挖掘与应用.本研究检测到的柱头外露率Q T L,绝大多数的表型变异来自大S,表明大S确实携带控制水稻高柱头外露率的Q T L.同时本研究检测到的q P S E S12在杭州F2群体,以及陵水㊁杭州F2:3群体82中国水稻科学(C h i nJR i c eS c i)㊀第31卷第1期(2017年1月)中均被检测到,而该位点在F2群体的加性效应来自D50,但贡献率极低;在陵水和杭州种植的F2:3群体中被检测的加性效应来自大S,其可能原因是水稻柱头外露特性受遗传特性㊁环境影响较大,不同的环境条件㊁不同世代,单株及株系柱头外露率表型值波动较大,影响检测结果[26].q P S E S3.1在陵水㊁杭州F2:3群体中均检测到,而在F2群体中未被检测到,表明某些效应值较小的Q T L,随着世代的增加其效应值有可能增大.另外,q P S E S4㊁q P D E S4㊁q P E S4位点在F2群体,以及陵水㊁杭州两次重复F2:3群体中稳定检测到,贡献率较大,且位于同一定位区间,可能是一个新的影响柱头外露率的Q T L,目前已构建相应的次级分离群体,以期将该控制水稻外露率的Q T L精细定位甚至克隆.在F2和F2:3群体,两代三次实验中也检测到新的控制柱头外露率的Q T L,如:q P S E S4㊁q P D E S4㊁q P E S4,值得进一步深入研究.此外,我们在杭州F2:3群体中还检测到一个新的贡献率高达57%的有待进一步确认的柱头单边外露率Q T L q P S E S3.2.针对已报道的且贡献率较大的Q T L以及最新检测到的稳定遗传的Q T L,一方面可构建次级分离群体进一步深入研究,将控制柱头外露率的基因进行克隆㊁功能分析,阐明控制柱头外露高低的分子机理.另一方面,精细定位柱头外露率Q T L,开发相应的与柱头外露率紧密连锁的功能分子标记[27],利用分子标记辅助选择选育高柱头外露率的粳稻类型的保持系㊁不育系等,进而促进杂交粳稻发展.参考文献:[1]㊀岳高红,潘彬荣,许立奎,楼钰,梅捍卫,罗利军.水稻柱头外露率的研究进展.种子,2009,28(1):47G50.Y u eG H,P a nBR,X uLK,L o uY,M e iH W,L u oLJ.P r oGg r e s s o f s t u d y o nr i c es t i g m a e x s e r t i o n.S e e d,2009,28(1):47G50.(i nC h i n e s e)[2]㊀袁隆平.杂交水稻学.北京:中国农业出版社,2002:37G40.Y u a n L P.H y b r i d R i c e.B e i 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r i cS c i,1992,20(4):293G301.(i nC h i n e s e w i t hE n g l i s ha b s t r a c t)[7]㊀邓华凤,何强,舒服,张武汉,杨飞,荆彦辉,东丽,谢辉.中国杂交粳稻研究现状与对策.杂交水稻,2006,21(1):1G6.D e n g H F,H eQ,S h uF,Z h a n g W H,Y a n g F,J i n g Y H,D o n g L,X i eH.S t a t u s a n d t e c h n i c a l s t r a t e g y o nd e v e l o p m e n to n j a p o n i c a h y b r i d r i c e i nC h i n a.H y b r i dR i c e,2006,21(1):1G6.(i nC h i n e s ew i t hE n g l i s ha b s t r a c t)[8]㊀邓应德,应杰政,石媛媛,肖层林,张海清.控制水稻柱头外露率的数量性状基因座初步分析.湖南农业大学学报:自然科学版,2010,36(4):373G376.D e n g Y D,Y i n g JZ,S h iY Y,X i a oCL,Z h a n g H Q.M a pGp i n g o fQ T Lf o r p e r c e n t a g eo f e x s e r t e ds t i g m a i nr i c e.J H uGn a nA g r i cU n i v:N a t S c i,2010,36(4):373G376.[9]㊀邓应德,肖层林,邓化冰,张海清,邓晓建,刘玉龙.用近等基因池法定位与水稻柱头外露率相关的Q T L.农业现代化研究,2011,32(2):230G233.D e n g Y D,X i a oCL,D e n g H B,Z h a n g H Q,D e n g XJ,L i uYL.D e t e c t i o no fQ T Lr e l a t e d t o s t i g m a e x s e r t i o nr a t e(S E R) i n r i c e(O r y z as a t i v a L.)b y 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