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蛋白质的结构dl


Hexokinase 具有两个结能域
domain domain
Alberts et al (1994) Molecular Biology of the Cell (3e) p.196
细胞色素C的空间结构
4、肌红蛋白的结构
肌红蛋白是哺乳动物肌肉中运输氧的 蛋白质。
是1957年由John Kendrew 用X射线晶 体分析法测定的有三维结构的第一个 蛋白质。
由153个氨基酸残基组成的一条多肽链。 分子内含有一个血红素辅基。 相对分子量 17800 d
血红素分子
2+
His
(六)蛋白质的四级结构
1、寡聚蛋白和蛋白质亚基
分子量较大的蛋白质往往由两条或两条 以上的多肽链组成,这些肽链相互之间以非 共价键结合,每条多肽链各自具有一定的三 级结构,但肽链单独存在时不具有生物活性, 这种肽链就称为——蛋白质的亚基
3、球蛋白分子结构的一般特征
一条肽链往往是通过一部分а-螺旋,一 部分ß-折叠,拐角处形成ß-转角或无轨 卷曲盘绕折叠成致密的—球形分子
具有极性侧链的氨基酸残基几乎分布在 分子的表面—亲水的表面
而非极性氨基酸侧链的残基包埋在分子 的内部形成—疏水的核
分子表面往往有一个裂隙(口袋;凹 槽),常常是疏水的环境。这一部位常 常是球蛋白的—活性部位
镰刀型红细胞贫血病是1904年首先被发 现的一种分子病。病人的血红蛋白(HbS)与正常人血红蛋白(Hb-A)相比, 链第6位氨基酸不同。
HbA Val-His-Leu-Thr-Pro-Glu-Glu-Lys-
HbS Val-His-Leu-Thr-Pro-Val-Glu-Lys-
仅仅这一点差别,就使患者的红细胞在 氧缺乏时呈镰刀状,易胀破发生溶血, 运氧机能降低,引起头昏、胸闷等贫血 症状。
超二级结构类型:
2、结构域
多肽链在超二级结构的基础上进一步的 盘绕折叠成紧密的近似球状的结构,在 空中彼此分隔,相互独立,结构域之间 通过共价的、松散的肽链相连(铰链 区)。
对于有些较小的蛋白质分子,结构域和三级结构是一个意思,即这些蛋白质分 子是单结构域的。
(五)蛋白质三级结构:
1、概念
三级结构中的离子键
可与金属离子形成离子键: Cys, His, Glu, Asp
金属离子对蛋白质的贡献: (1) 稳定蛋白质的结构 (2) 参与蛋白质的功能
三级结构中的疏水作用力
疏水性氨基酸基团 亲水性基团
以水溶性蛋白质而言 (脂溶性蛋白质恰相反)
Alberts et al (2002) e Cell (4e) p.135
亚基聚合在一起形成具有一定生物学功能 的蛋白质分子——寡聚蛋白
2、蛋白质的四级结构
寡聚蛋白质中亚基的空间排布、 相互关系和相互作用力,称之为蛋 白质的四级结构。
亚基的种类和数量 均一四级结构 不均一四级结构
亚基的空间排布 亚基间的相互作用力 次级键
3、血红蛋白的四级结构
Hb分子量为 65000 d Hb是由2条а链和2条ß链组成的四聚
Mathews et al (2000) Biochemistry (3e) p.239
2、种属差异与分子进化
同源蛋白质:不同种属中完成相同功能的蛋白 质。
五、蛋白质结构与功能的关系
蛋白质分子具有多种多样的生物功 能是以其极其复杂的结构为基础的。这 不仅需要一定的化学结构,更重要的是 需要特定的空间结构作基础。研究蛋白 质结构与功能之间的关系是分子生物学 的一个重要方面。
(一)一级结构与功能的关系
1、分子病
分子病(molecular disease):是一种遗传性疾 病,由于DNA分子上基因突变,而合成了失去正 常生物活性的异常蛋白质,或者是缺失某种蛋白 质,从而影响了机体正常的生理功能而产生的疾 病。 研究表明几乎所有遗传病都与pr分子结构改变有 关。
(四)超二级结构和结构域
近年来在研究蛋白质构象、 功能和进化的变化时,发现在蛋 白质二级结构和三级结构之间存 在着两个过渡层次,即超二级结 构和结构域。
1、超二级结构
多肽链内若干顺序上相邻的二 级结构的构象单元在空间折叠中靠 近,彼此相互作用,形成有规则的, 在空间上能辨认的二级结构的组合 体。
超二级结构在结构层次上高于 二级结构,但不具有功能。超二级 结构的形式主要有:-螺旋组合 ( ); -折叠组合( ); -螺旋-折叠组合( );;希 腊钥匙结构
包括主侧链在内的所有原子 在三维空间的排列。
一条多肽链在二级结构的基础上, 由于顺序上相隔较远的氨基酸残基侧链 的相互作用,进行范围更广泛的盘绕、 折叠,形成很不规范但特定的空间构象。
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具有三级结构的蛋白质分子,往 往具有球形、椭球形的物理外形,称 之为球蛋白。
球蛋白常常是生物体内具有一定 生理功能的活性蛋白质。 例如:肌红蛋白(Mb);
三级结构中的二硫键
C CH2 SH
SH
CH2
C
C
CH2 SH
SH CH2 C
分子间
Oxidation Reduction
分子內
C
CH2 SS
CH2 C C
CH2 SS
CH2 C
Adapted from Alberts et al (2002) Molecular Biology of the Cell (4e) p.152
核糖核酸酶; 细胞色素C;
2、稳定三级结构的作用力
氢键 疏水力(疏水作用力) 范氏引力(分子间的作用力) 离子键(盐键) 酯键 二硫键
二级结构氢键 三级结构氢键
a helix 胰脏 trypsin inhibitor
三级结构中的氢键
b sheet
Garrett & Grisham (1999) Biochemistry (2e) p.181
体。 а链由141个氨基酸组成,ß链由146
个氨基酸组成,各自都有一定的氨 基酸排列顺序。 两种亚基的一级结构差别较大,但 它们的二、三级结构却大致相同, 而且与肌红蛋白极为相似。
血红蛋白的四级结构
Myoglobin
Hemoglobin
Mathews et al (2000) Biochemistry (3e) p.214
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