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晶体结构数据库介绍
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剑桥结构数据库(CSD)
建 立 在 英 国 剑 桥 晶 体 学 数 据 中 心 (Cambridge Crystallographic Centre),该库系统收集了自1935年 以来的29万余种有机金属化合物的结构信息,包括了 普通有机化合物、有机金属化合物和金属配位化合物 等三大类别。其中三维空间原子坐标信息的约有 260000 种。据统计,有 80 %以上的是 1980 年以后发 表的最新测定的结果。
1. 金属数据库(CRYSTMET) 2. 剑桥结构数据库(CSD) 3. 无机晶体结构数据库(ICSD) 4. 蛋白质数据库(PDB) 5. 粉晶数据库
金属数据库(CRYSTMET)
是由加拿大科学技术情报研究所建立的,收集了1913年 以来金属单质、金属化合物和固溶体的晶体数据,包括 金属元素与硼、硫、硅、锗等元素的化合物。目前在该 库中约有60000多个条目,每一条目存储一种晶体的信 息。其中大约80%以上的条目存有原子坐标,其余的条 目只包含晶胞参数和空间格子类型的信息。
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蛋白质数据库(PDB)
是美国纽约Brookhaven国家实验室于1971年创建的,是目前 最主要的收集生物大分子 (蛋白质、核酸和糖 ) 三维结构的数据 库,是通过X射线单晶衍射、核磁共振、电子衍射等实验手段 确定的蛋白质、多糖、核酸、病毒等生物大分子的三维结构数 据库。 PDB 数据库允许用户用各种方式以及布尔逻辑组合 (AND 、 OR和NOT)进行检索,可检索的字段包括功能类别、PDB代码、 名称、作者、空间群、分辨率、来源、入库时间、分子式、参 考文献、生物来源等项。
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RCSB Protein Data Bank - RCSB PD际 衍 射 数 据 中 心 的 粉 晶 数 据 库 (JCPDSInternational Center for Diffraction Data)汇集了世界各 国发表的约113000种单相物质的粉晶衍射资料。在该库 中,每一种单相物质都有一套资料,包括晶体名称、化 学成分、参考文献、收集衍射数据时的实验条件等。
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无机晶体结构数据库(ICSD)
德国无机化合物晶体数据库收录自1913年以来合成的 无机化合物晶体结构(含原子坐标),主要是金属与金 属间化合物,目前存有约 76480 个条目。平均每年更 新 2 次 , 每次增加约 2000 个条目 , 所收集的化合物是 剑桥结构数据库和金属数据库中没有的。