生物钟及其基因的研究综述摘要：生物钟( biological clock) ，也称生物振荡器( Oscillators) 。

这是一种近昼夜节律，受外界因素，尤其是光的调节。

当没有外界因素存在或一直处于黑暗的状态下，生物体内的各种活动仍然具有节律。

由此可见，生物节律是由其内在的生物钟所控制的。

从单细胞生物到多细胞生物，从原核生物到真核生物，这种昼夜节奏现象在生物界中广泛存在。

因此关于它的特征、意义和机理的研究日益受到人们重视。

这种节律系统包括输入机制、内在的生物钟和输出机制。

三者彼此协调才能使生物的各种活动具有节律性。

而内在的生物钟机制，实际上是一些生物钟基因相互作用的结果。

关键词：生物钟钟基因拟南芥一、第一个生物钟基因果蝇per基因是第1个被克隆的生物钟基因，第二个是tim基因。

然后人们才对昼夜节律的分子机制有了较深人的了解。

随着对其他的生物钟基因的相继发现，一种公认的生物钟分子调控机制——反馈调节回路凸现出来。

以往的研究表明，tim 基因在此反馈回路中发挥着重要作用。

且tim对行为节律的作用可能与per基因的产物有关，而tim基因对生物多种活动节律具有协同进化关系。

二、生物钟基因的表达早期的研究已经指出，昼夜节奏的表现可能涉及到细胞内的生物化学过程。

现在已经清楚，这种昼夜节奏与基因的节奏性表达有关。

这些基因常常受到生物钟的调节，它们的表达量伴随着昼夜循环发生规律性变化。

例如在拟南芥中编码富含甘氨酸的蛋白质基因Cc1 和CC2等等。

这些基因的mRNA水平都表现出昼夜规律性起伏，表明生物钟调节的机制有可能发生在转录水平上，使基因周期性“开放”与‘关闭”，从而表现出节奏性转录的特征。

然而，在许多昼夜节奏活动中，mRNA的合成并没有明显的节奏变化，可见生物钟调节反应不仅仅局限于转录水平。

如果是非转录水平的调节，根据人们的研究，可能发生在RNA加工、蛋白质翻译以及翻译后的蛋白质修饰等环节上，由此可导致最终产物的量或形式的变化。

三、拟南芥生物钟分子机制微阵实验表明至少有6% 的拟南芥基因是节律性表达的，在白天和黑夜的所有阶段都有表达峰(Harmer et al,. 2000;Schaffer et al, 2001)拟南芥生物钟振荡器第一个稳定的模式(Alabadi et al. 2001)包含有3个基因：编码与Myb 相关的转录因子的CCA1(CIRCADIAN CLOCK ASSOCIATED1) 、LHY((LATE ELONGATED HYPOCOTYL) 和一个伪反应调控子TOC1(TIMING OF CABEXPRESSION 1) 。

TOC1 的强功能缺失等位基因LHY和CCA1的双重突变体，或是这些基因的任何一个的组成型过量表达都能引起在持续光照或持续黑暗下的无节律性(Schaffer etal.1998; Makino et al. 2002; Mizoguchi et al.2002; Mas et al.2003) 。

但是现在还不知道植物在光暗周期下保持节律和持续光照(或黑暗)条件下某些植物能短暂保持节律的原因。

CCA1/LHY 蛋白在深夜和凌晨过量表达，与TOC1启动子的黑夜元件(AAATATCT)相结合从而抑制TOC1的表达(Harmer et al.2000; Alabadi et al. 2001; Mizoguchi et al.2002)。

当傍晚CCA1/LHY 水平下降时，TOC1 蛋白可能激活CCA1/LHY的转录，从而形成了转录反馈环的轮廓(Alabadi et al.2001)。

这种激活可能是间接的，因为夜间至少还需要以下3种基因与TOC1共表达：ELF3(EARLYFLOWERING 3) (Schaffer et al, 1998)、GI(GIGANTEA) (Fowler et al,1999) 和GIF4(EARLY-FLOWERING 4) (Doyle et al.2002)。

这些基因编码的蛋白的生化功能还不是很清楚。

自相矛盾的是，TOC1 的过量表达，某种程度上会减弱而不是激活 C C A 1 的表达(Makino et al.2002; Mas et al.2003)。

APm图1拟南芥昼夜节律系统椭圆表示蛋白质，方块表示基因=CCA1和丄HF在凌晨表达一它怕各自的蛋白抑制TOC.I的转录【没有箭头的粗览b夜间TOC1. ELFi. ELF4fflGI蛋白的积累又通过未知的机制藏活第二衆凌晨CCA1/LHY的转录在CCA1和的启动子fitTOCl和PIL】PIF3蛋白之间发生相互作用.以CCA］和EH7的表达“ APRR9的转录是受光漱活的.它是APRR / TOC1五重卖中第一个表达的基因，随后APRR7.APRR5. APRR3禾口TOCI也扌目继表达。

TOCJ能抑制RNA的表达=四、开花周期的调节季节性事件如开花的光周期调控需要日照长度的测量。

大部分拟南芥植株是长日照植物这是对光周期传感器的反应。

它们在长日照下开花快些（16小时光照/8小时黑暗周期下长出6~8片叶子后即开花）,而短日照下则开花迟得多（8小时光照/16小时黑暗周期下大约长出30 片叶子才开花）。

目前的关于开花时间的调控机制存在着两种模型。

一种是“外协和模型”，这个模型中光受体产生一个开花信号，这个信号移动到苗端启动花的发育。

光受体有两个功能即导引生物钟和产生开花信号。

另一种是“内协和模型” ,Pittendrigh（1972）指出光受体不能直接产生开花信号，而是依赖于光周期引导两个不同的生物钟到不同的相位。

在某些光周期中两个生物钟的重叠会产生开花信号。

营总生枕狀海开S2开花的光周期调腔在长日殖下大屋袞达,FT基因被诱导，从而激活下游的开花基因使植物达到开花状态黑色表示黑暗时间一白色表示光脛时间。

虚圾箭头表示被光激洒的匸。

信号激活FT的表达；最近有报道外协和模型(Suarez-Lopez et al., 2001; Blazquez et al., 2002; Roden et al., 2002; Yanovsky andKay, 2002)。

这个模型中的关键基因是CO(CONSTANS )。

对co突变体和CO过量表达株的研究表明，CO对于长日照下快速开花是必需且足够的，所以它很明显是这个机制的一个重要组分。

然而，光受体在CO RNA表达水平几乎没有任何效果，所以它们可能影响CO蛋白的积累或是功能(Yanovsky and Kay,2002)。

同时生物钟的正确导引是必不可少的，因为当昼夜节律相位被生长在正常的24小时光暗周期下的短周期生物钟突变体toc1-1 或是被生长在长于或短于24小时周期的野生型所改变时，会引起开花时间的改变(Roden etal.,2002; Yanovsky and Kay, 2002)。

这两种处理中,开花时间能从CORNA表达水平与光照的一致性来预测，但是两种处理都能影响包括CO表达的许多昼夜节律。

生物钟在多种生物中普遍存在，可以认为各种生物的生物钟作用机制是相同的，但在不同的节奏性活动中，生物钟调控机制可能不同，大量的例证似乎说明，生物钟对基因表达的调控主要发生在转录水平上。

总之，生物钟的昼夜节律由per、tim、clock和cycle 4个生物钟齿轮组成的正负反馈回路进行调节。

其中tim可以受光因子调控，它还可以与per形成异二聚体，通过正负调控方式调节果蝇的昼夜节律行为。

但是这个内在的生物钟怎样与输入机制以及输出机制相协调，还有哪些因子参与了这两个过程，尚不得而知。

尽管对tim 基因及生物节律的作用的研究过程较为漫长，但是将遗传学和基因组学相结合，对节律行为分子机制的研究已经取得了非凡的成就，尤其是在昼夜节律的分子生物学机制方面。

近年来，已有越来越多的学者关注生物钟的研究，此外，人类基因组测序工作的完成又为该课题的进一步深入提供了方便。

利用人类基因组提供的候选序列，可以在哺乳动物中发现更多的生物钟基因，再与后基因组的分析相结合，其研究结果将有助于对睡眠异常和精神疾病的治疗。

此外，人类基因组的成果还将对生物节律的输出机制研究产生巨大的影响，结合DNA 芯片技术我们可以进一步鉴定出控制哺乳动物输出机制相关的基因，最终加速昼夜节律的研究进程，从而在不同水平对人类复杂行为有一个全面深入地了解。

参考文献：1．Alabadi D, Oyama T, Yanovsky MJ, Harmon FG, MasP, Kay SA (2001) Reciprocal regulation between TOC1 and LHY/CCA1. Science, 293: 880-8832. 拟南芥生物钟分子机制研究进展,徐张红赵晓刚何奕昆①植物学通报2005, 22 (3):341~349,Chinese Bulletin of Botany3. Kim JY, Song HR, Taylor BL, Carre' IA (2003) Lightregulatedtranslation mediatesgated induction ofthe Arabidopsis clock protein LHY. The EMBOJournal, 22: 935-9444. 生物钟基因研究新进展，李经才，于多.HEREDITAS (Beijing) 26⑴：89~96,20045. 生物钟的分子机制研究进展侯丙凯,于惠敏,Recent Developments in MolecularMechanisms of Biological Clock, HEREDITAS (Beijing) 18(4)： 42-44 19966. Timeless与生物钟基因，刘仲敏,张亚平，动物学研究,2001 ,Dec.22(6):497-501。