当前位置:文档之家› 最新第十一课:流式细胞术测定植物基因组大小概论课件PPT

最新第十一课:流式细胞术测定植物基因组大小概论课件PPT


DNA的倍体和DNA指数的关系
DI=1.0±0.01 DI=1.0±0.15 DI=2.0±0.1
DI>2.10
二倍体 近二倍体 四倍体 多倍体
例:
D N A 倍 体
正 二 倍 体 (2n,D iploid) 亚 二 倍 体 (H aploid) 四 倍 体 (T eraploid) 低 倍 体 (H ypoploid) 高 倍 体 (H yperploid)
流式细胞仪(Flow Cytometer)
集激光技术、电子物理技术、光电测量技术、电子计算机技术、细 胞荧光化学技术、流体力学为一体的一种新型高科技仪器。
流式细胞术特点
单细胞悬液 或生物颗粒 分析速度高
多参数
精度高
高灵敏度
当代最先进的细 胞定量分析技术
无害分析 和分选
流式细胞仪检测范围
细胞大小
G0G1
count
s G2M
0
200
400
600
800
1000
2N
4N
DNA content
DNA检测的常用术语
变异系数(Coefficient of Variation,CV):通常以G0/G1峰的宽度来反映,该 指标反映了仪器的分辨率或精确度。影响CV的因素主要包括两方面: 仪器因素(如鞘液的流速、光路、机器调试等)和样本制备(如样品中 碎片含量、细胞团块、细胞活性和细胞浓度等)及染色过程对标本的人 为影响。优化DNA分析条件就是指最大程度地减少这两大因素带来的变 异。
➢主要表达方式
Pseudo 3D Plot
3D Plot
二 植物C值分析原理
利用特殊的荧光染料(PI、EB、AO等)与细胞内DNA碱 基结合,被荧光染料染色的细胞在激光照射下发射出荧光, 荧光强度与DNA含量成正比。流式细胞仪通过测定细胞的 荧光强度推算出细胞的DNA含量。
流式细胞仪计算测量DNA含量实际上是细胞周期的测 量,由于细胞核G1期的DNA含量反应一个细胞的倍性,因 此常用DNA含量来估计细胞倍性,包括DNA的绝对含量或相 对含量。
光电转换 数据处理系统 • 细胞分选系统
液流系统:流动室、液流驱动系统
Injector Tip
Sheath fluid
Fluorescence signals
Focused laser beam
液流中心由单列 匀速运动颗粒组 成的液柱
分选系统
488 nm laser
Charged Plates
FALS Sensor Fluorescence detector
DNA指数(DNA index,DI):DI指的是样本G0/G1峰的平均道数与正常二
倍体G0/G1峰的平均道数之间的比值。DI为1 意味着二倍体(2c)。
DI=
样品G0/1细胞峰均道值
正常二倍体标准细胞G0/1期细胞均道值
倍体(Ploidy):原指染色体数目,流式中用来描述总的DNA含量。二倍体 细胞有正常细胞的DNA含量但不除外染色体异常。DI为1.9-2.1 的细胞为 四倍体(CV<5%)。除二倍体和四倍体,其他均称异倍体。
细 胞 结 构
细胞粒度
细胞表面面积

核浆比例
胞 功
DNA含量与细胞周期 能
特异性抗原 (细胞表面/胞浆/核) 细胞内细胞因子 细胞活性 酶活性
RNA含量 蛋白质含量
激素结合位点 细胞受体
流式细胞技术的最新突破
细胞信号转导/通路分析 细胞间相互作用 分子共定位与胞内分子转运 细胞形态学 荧光原位杂交 基因表达分析 细胞凋亡 细胞周期分析 白细胞亚群分析
第十一课:流式细胞术测定植 物基因组大小概论
一 流式细胞术的基本知识
概念
流式细胞术(Flow Cytometry,FCM)
流式细胞术,即利用流式细胞计对处在快速直线流动状态中的单细 胞活生物颗粒进行多参数、快速定量分析,同时对特定群体加以分 选的现代细胞分析技术,是20世纪70年代发展起来的一项技术,综 合了激光技术、计算机技术、半导体技术、流体力学、细胞化学等 各学科的知识,它orted into test tubes
信号检测--散色光
它反应细胞的物理特性,根据前侧向散射 光,可以把不同类型的细胞群加以区分 FSC(前角散射光)它反应细胞的相对大小和截面积的大小
SSC (90度角散射光)代表细胞的颗粒度和精细结构的变化
Laser
FALS Sensor
D N A 指 数 (D I) 意 义 (染 色 体 数 )
1.00
46条 染 色 体
0.50
23条 染 色 体
2.00
92条 染 色 体
<1.0
<46条 染 色 体
>1.0
>46条 染 色 体
Normal Cell Cycle
M G2
G0
G1
s
DNA Analysis
G0G1
count
s G2M
0
200
400
600
800
1000
2N
4N
DNA content
300
DNA Analysis
DNA index 1.21 Aneuploid peak
225
150
Counts
75
0
0
200
2N400
4N 600
800
1000
PI Fluorescence
复叶槭
猕猴桃
柠檬马鞭草
柠檬 Loureiro et al.,2007. Fig 3
测量DNA的绝对含量时,须设一个已知DNA含量的标准样 品作对照,来换算出DNA的绝对含量。
样品2C DNA含量=[(样品G0/G1峰均值)/ (标准G0/G1峰均值)] ×标准2C DNA含量(pg DNA)
测量DNA的相对含量时,须设一已知倍性的同类材料作照, 换算出待测样品的DNA相对含量,进行倍性分析。
数据显示类型
单参数直方图(Histogram)
X轴:代表荧光信号或 散射光信号的强度,用 “通道数”表示,可以 与光强度之间线性关系 或对数关系
Y轴:代表该通道内所 出现具有相同光信号特 征性细胞的频率
二维等高图和密度图
二维点图Dot Plot
➢便于数据统计
➢不同的细胞群 可以用不同的颜 色标记
ImageStream成像流式细胞仪
分选微型模式生物
COPASTM 生物分选系统
模式动植物研究、大体积细 COPAS在线虫分选方面的应用,就在 胞研究及药物筛选等方面 Nature系列杂志上发表了7篇以上的文献
流式细胞仪的工作原理
• 光学系统 激光光源 光收集系统
• 液流系统 流动室
液流驱动系统 • 电子系统
相关主题