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Pubmed数据库检索与利用
主要内容
PubMed概述 PubMed检索途径与使用方法 检索结果导入NoteExpress
PubMed元数据利用
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从图书馆网站下载NoteExpress
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检索结果保存为Medline格式文件
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从NoteExpress导入题录及在文章中引用
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作者姓名[字段标识] Woods[au]
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详细检索过程
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详细检索过程
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刊名[字段标识] Science[ta]
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添加到检 索框检索
勾选加权检索、 不扩展检索选项
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检索结果
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题录检索
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输入检索信息
点击“Search”
例:检索《病毒杂志》(archives of virology)2009年发表的《基因稳定性与连 续性分析》(genetic stability and linkage analysis)这篇文献
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PubMed元数据利用
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结果存为XML文件
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数据库检索与利用
将XML文件数据d检索PubMed数据库
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相关文献
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点击 “LinkOut” 点击数据库名称
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PubMed元数据利用
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PubMed简介
PubMed是由美国国立医学图书馆(National Library of Medicine , NLM)下属美国生物技术信 息中心(National Center for Biotechnology Information ,NCBI)研制的基于Web的文献数据库
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发展历程
NLM早在1879年即开始编译医学文献的检索刊物《医 学索引》(Index Medicus ,IM)
从1964年起,采用计算机进行电子编辑和排版,在此 基础上开发了“医学文献分析与检索系统”(Medical Literature Analysis & Retrieval System),即著名的 MEDLARS系统
PubMed特点
收录范围广、内容齐全、回溯时间长 免费提供题录、文摘 检索功能完善、使用方便 提供检索词自动转换匹配功能、MeSH主题词检索 可直接下载全部元数据,便于利用各种工具进行分析 提供相关文献链接:Related citations, Linkout 更新速度快:数据实时更新 个性化服务(My NCBI)
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点击“Search”
例:查找《新英格兰医学杂志》(nejm)
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PubMed基本检索规则
布尔运算符AND,OR,NOT必须大写 例如:vitamin OR zinc PubMed从左至右进行布尔运算,可以通
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输入检索式
点击“Search”
例:类风湿关节炎(rheumatoid arthritis)应用雷 公藤(triperygium wilfordii)方面的文献。
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显示设置
检索结果
标题含有检 索词文献
标题含有检 索词文献
点击“See more”
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在PubMed注册自己的账户
❖ Publisher-Supplied Citation:记录均标有[PubMedas supplied by publisher]
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[PubMed-indexed for MEDLINE]
[PubMed-as supplied by publisher] [PubMed-in process]
Gopubmed的统计功能
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中医药研究文献快速增长
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查青林
主要内容
PubMed概述 PubMed检索途径与使用方法 检索结果导入NoteExpress
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二、PubMed检索途径与使用方法
• 基本检索 • 高级检索 • 主题词检索 • 题录检索 • 期刊检索
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网址
高级检索
题录检索 临床查询
期刊检索
基本检索框 主题词检索 临床试验
期刊转换表 new england journal of medicine → "N Engl J Med"[Journal] OR "new england journal of medicine"[All Fields]
作者索引 SmithJA → Smith JA[Author]
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确定主题词
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选择副主题词
添加到检 索框检索
主题词加权 检索选项
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检索结果
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例:通过主题词途径,检索有关心肌梗塞 (myocardial infarction)预防 (prevention and control)方面的文献。 要求主题词加权、不扩展检索
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PubMed数据库检索与利用
江西中医药大学图书馆 查青林 2015.11.27
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PubMed元数据利用
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PubMed概述 PubMed检索途径与使用方法 检索结果导入NoteExpress
1971年正式建立了该系统的联机系统,称为 “MEDLARS联机检索系统”(MEDLARS online),即 MEDLINE系统
随着网络技术的发展,开发人员致力于将MEDLINE数 据库的信息放到网上,供广大医务人员免费使用。从 1997年6月起,PubMed开始在网上免费向读者提供
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详细检索过程
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词组检索 例如:“single cell” 截词检索:* 例如:输入infect*,可检出infection,infectious,
infective,infectivity,infector等 截词检索只限于单词,对词组无效
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输入检索词
双引号,系统进行强制检索 注意:检索词自动转换匹配功能关闭
检索历史
构建检索式
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输入检索词
显示索引
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完整检索式
选择检索字段
点击 “Search”
输入检索词
例:检索2009年以来发表的有关 肿瘤护理方面的英文综述性文献
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检索结果
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点击主题词检索
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输入检索词
点击“Search”
PubMed每条记录均有惟一的识别号PMID(PubMed Unique Identifier) 。
❖ MEDLINE: PubMed主体部分,记录均标有 [PubMed-indexed for MEDLINE]
❖ In Process Citation: 又称PreMEDLINE,记录均标有 [PubMed-in process]
1996:1998[dp] AD——第一作者机构名称、地址、资助号 如tianjin[ad] AU——作者姓名 如woods[au] TA——期刊名称 包括期刊名全称、简称、ISSN 如science[ta]或
0021-9258[ta] LA——文献出版语言 如Chinese[la] MH—— Mesh主题词 如neoplasm[mh] PT——出版类型 如review[pt] TW——自由词 TI——文献标题内自由词如leiomyosarcoma[ti]
收录全世界包括美国在内80多个国家的5000余种 生物医学期刊的文摘及题录数据,内容涉及护理学、 牙科学、兽医学、药理学、保健系统等医学各个领 域
现有文献2200万余条,收录文献时间起自20世纪 50年代
数据库检索与利用
PubMed提供部分免费全文,包括① NLM开发的免 费生物医学数字化期刊全文数据库PubMed Central(PMC); ②开放获取(Open Access, OA)期 刊的文献; ③部分出版商提供的免费期刊文献。
过加圆括符改变运算顺序 例如:common cold AND (vitamin OR
zinc)
数据库检索与利用 指定文献记录字段名称检索
例如:DNA[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]