微生物分类年
第一节 通用分类单元
❖ 分类是认识客观事物的一种基本方法。 我们要认识、研究和利用各种微生物资 源也必须对他们进行分类。
❖ 分类学内容涉及三个相互依存又有区别 的组成部分：分类、命名和鉴定。
2
❖分类（classification）是根据一定的原则（表型 特征相似性或系统发育相关性）对微生物进行分 群归类，根据相似性或相关性水平排列成系统， 并对各个分类群的特征进行描述，以便考察和对 未被分类的微生物进行鉴定；
发表新名称时，应在新名称之后加上所属新分 类等级的缩写词，如新目“ord.nov.”、新属 “gen.nov.”、新种“sp.nov.”等。
8
俗名（common name）: 普通的、通俗的、地区性的名字，具有简明和大众
化的优点，但往往涵义不够确切，易于重复，使用范 围局限。
如 绿脓杆菌： 铜绿假单孢菌Pseudomonas aeruginosa 白念菌： 白色假丝酵母Candida albicans 金葡萄： 金黄色葡萄球菌Staphylococcus aureus
Ainsworth(1973)的分类系统。
Ainsuorth and Bisby’s的《真菌学辞典》 《Dictionary of the Fungi, Sixth.edition, 1971》
18
第四节 微生物分类鉴定的方法
1. 经典鉴定分类法 2.数值分类法 3.化学分类法 4.遗传分类法
19
四个水平：
细胞的形态和习性水平：营养需求等 细胞组分水平：细胞壁 蛋白质水平：氨基酸 核酸水平：碱基，16sRNA
20
两大类方法：
10
❖菌株（strain)或品系，从自然界分离得到的任何一种 微生物的纯培养物都可以称为微生物的一个菌株；用 实验方法（如通过诱变）所获得的某一菌株的变异型， 也可以称为一个新的菌株，以便与原来的菌株相区别。 ❖模式菌株：一个被指定为能代表一个种群的菌株，是 活体标本
11
第二节 微生物在自然界的地位
科学家估计有分类纪录的各类物种大约有 150万，其中微生物超过10万种，而且其数 目还在不断增加。微生物学工作者要认识、 研究和利用微生物或控制有害微生物，必须 对它们进行分类（classification）。
12
1、两界系统
动物界 Animalia：不具细胞壁，可运动，不进 行光合作用。
植物界 Plantae：具有细胞壁，不运动，可行光 合作用。
2.《伯杰氏系统细菌学手册》
（Bergey’s Manual of systematic Bocteriology, 1984）
放线菌： • 中国科学院微生物研究所编著的放线菌目分科、分属检索表。 • 克拉西里尼可夫（前苏联）“细菌放线菌分类手册”。 • 瓦克斯曼（美）“放线菌分类”
17
二、真菌的分类系统
9
❖ 常用的细菌分类术语 ❖ 培养物（culture),是指一定时间一定空间内微
生物的细胞群或生长物。 ❖ 种（species),是生物分类中基本的分类单元和
分类等级。是一大群表型特征高度相似，亲缘 关系极其接近、与同属内的其他物种有明显差 异的一大群菌株的总称。 ❖ 型（form或type),常指亚种以下的细分，当同 种或同亚种不同菌株之间的性状差异，不足以 分为心的亚种时，可以细分为不同的型。
三界：原生生物界 Protista：（E. H. Haeckel, 1866年提出）
13
2、五界系统
R. H. Whitakker, Science, 163: 150-160, 1969 原核生物界 Monera：细菌、放线菌等 原生生物界 Protista：藻类、原生动物、粘菌等 真菌界 Fungi：酵母、霉菌 动物界 Animalia： 植物界 Plantae： 五界系统是以细胞结构分化的等级以及和光合、吸收、 摄食这三种主要营养方式有关的组织类型为基础的。 六界：加上病毒界。
三界(域)为： Bacteria(细菌)、Archaea(古生菌)和Eukarya(真核生物)。
15
16
第三节 各大类微生物的分类系统纲要
一、原核生物分类系统
细菌鉴定手册 1.《伯杰氏细菌鉴定手册》
（Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology）（1923-1974的1-8版）
属名+种名+（subsp或var）+亚种（变种）名称
排斜体
排正体（可省略） 排斜体 （不可省略）
如：椭圆酿酒酵母
Saccharomyces cerevisiae （subsp/var）ellipsoideus
其他 :某属中一个种或几个种时，属后加sp.或SPP. Micrococcus sp.(spp.)一种或一批小单孢菌

新名称的发表 根据细菌命名法规的规定，有效发表新 的细菌名称应在公开发行的刊物上进行，在菌种目 录、会议记录、会议论文摘要的均不能视为有效发 表。此外，若新名称是在国际系统细菌学杂志 （IJSB）以外的其他杂志上发表的，还必须经过新 名称的合格化发表，被认为合格后，在该杂志上定 期公布，命名日期即从公布之日算起，否则不算合 格发表，也不能取得国际上的承认。
❖命名（nomenclature）是根据命名法规，给每 一个分类群一个专有的名称；
❖鉴定（identification或determination） 则是指借助于现有的微生物分类系统，通过特征测 定，确定未知的、新发现的或未明确分类地位的 微生物所应归属分类群的过程。
3
当微生物是一个亚种或变种时，应按三名法命名 既：学名=
14
3.三界（域）系统 Woese用寡核苷酸序列编目分析法对60多株细菌的
16SrRNA序列进行比较后发现：产甲烷细菌完全没有作 为细菌特征的那些序列，于是提出了生命的第三种形式 -古细菌(archaebacteria)。随后对包括某些真核生物在内 的大量菌株进行了16Sr RNA(18SrRNA)序列的分析比较， 又发现极端嗜盐菌和极端嗜酸嗜热菌也和产甲烷细菌一 样， 具有既不同其他细菌也不同于其核生物的序列特征， 而它们之间则具有许多共同的序列特征。