数学、物理、化学、生物、地理常用软件介绍一数学:1、数学软件:(1)常见的通用数学软件包包括:Matlab和Mathematica和Maple,其中Matlab以数值计算见长,Mathematica和Maple以符号运算、公式推导见长(2)专用数学包包括:绘图软件类:MathCAD,Tecplot,IDL,Surfer,Origin,SmartDraw,DSP2000数值计算类:Matcom,DataFit,S-Spline,Lindo,Lingo,O-Matrix,Scilab,Octave 数值计算库:linpack/lapack/BLAS/GERMS/IMSL/CXML有限元计算类:ANSYS, MARC,PARSTRAN, FLUENT, FEMLAB,FlexPDE,Algor,COSMOS, ABAQUS,ADINA数理统计类:GAUSS ,SPSS,SAS, Splus学公式排版类:MathType,MikTeX,ScientificWorkplace,Scientific Nootbook2、数学编程:包括Fortran、C/C++、VB...MatLab、Maple、Mathematica、Femlab、......等编程,讨论各种算法,包括神经网络,模拟退火等,可以应用到计算数学,统计学等。
二、物理1、物理软件:1基本用途软件(1)符号计算:mathematica:这是唯一一个商业软件,下面有的程序依赖于它,而且由于Wolfram当年也是高能物理出身,因此个人觉得该软件的使用体验很好,也是我唯一动心购买正版的软件。
form:大规模处理符号表达式的利器,下面有的软件包依赖于它,适宜用来做高圈多腿图的计算,但是用起来没有mathematica方便。
maxima:这个是mathematica的免费替代品,但缺点是很多表达式没法像mathematica那样化简,不过好在提供源代码.(2)数值计算:gsl:C程序写的数值计算库,内容还比较全面,用来做数值计算很方便,文档比较详细且集中。
cernlib:CERN的数值计算库以及一系列附加的分析绘图工具(甚至包括了下面的一些程序包)。
优点是功能强大,专门针对高能物理中的各种应用比较全面;不过个人觉得文档有些散。
scilab:这个是类似于matlab的通用型数值计算软件,简单易用,界面友好,不过因为通常都直接写c或者fortran程序做计算,因此用得较少,也没做过比较是不是会比自己写调用gsl啥的慢很多。
octave:类似于scilab,目前我还没用过(3)图形可视化:root:CERN的一个解释型C语言编译器,功能强大,把C语言变成了类似于脚本语言,对做图比较方便。
gnuplot:绘图程序,功能也比较强,用起来也比较方便。
metapost:TeXLive自带的绘图程序,功能还不错,就是用起来不是很方便。
asymptote:在metapost的基础上改进了一些,用起来比metapost 方便,不过个人觉得和metapost差不多。
(可能我比较弱,无法掌握其精髓^_^)(4)编辑写作:texlive:aps推荐使用revtex4格式写paper,因此这个当然必不可少。
openoffice:有时候不得不用一下Office,可以用它来应急,不过和Office的兼容性确实不好。
2特殊用途:(1).圈图计算FeynArts:生成Feynman图和Feynman振幅的工具包,在mathematica 下使用,方便易学。
FormCalc:配合form(自带得有)和FeynArts对Feynman振幅(小于等于1圈水平)进行解析化简的工具包,在mathematica下使用。
LoopTools:数值计算一圈动量积分的程序包,实际是用了ff包,但是比ff更加易用。
但是处理红外发散是用的质量正规化。
QCDLoop:也是计算一圈动量积分的程序包,也用了ff包,但是用维数正规化来处理红外发散。
FeynCalc:具有教学性质的Feynman图计算包,在mathematica中使用,可以对1圈水平的Feynman振幅及模方进行化简,也可进行两圈自能图的计算,给出的表达式和教科书比较接近。
mincer:利用form计算三圈无质量自能图的工具包。
matad:计算三圈真空图的工具包,其中可以有一个质量参数。
但是由于和目前form版本不兼容,因此需要进行修改才能配合使用。
(2).数值模拟madgraph:在树图水平给出Feynman图并进行计算的工具包,利用Helicity方法可计算多腿图,使用比较方便。
madevent:和madgraph配合进行数值积分和事例生成。
comphep:一个简单易用的树图计算工具,可以生成Feynman图,给出解析表达式,进行数值计算,并绘出图形。
calchep:功能和comphep差不多,只是由另外一个人维护。
grace:在领头阶计算Feynman振幅的工具,目前正在扩展到次领头阶。
也可以画Feynman图和生成事例。
pythia:强大的Monte Carlo模拟程序,可进行一系列计算,包括数值积分,parton shower,强子化和事例生成,似乎集成在cernlib 里了,不过目前正在推出新的c++版本。
herwig:类似于pythia,只是用的算法不尽相同。
也在推出新的c++版本。
(3).粒子谱计算FeynHiggs:计算SUSY中Higgs粒子质量谱和衰变宽度的软件包,考虑了两圈效应,方便易用,甚至可在mathematica中调用。
SDecay:同样是计算SUSY中Higgs粒子质量谱和衰变宽度的软件包。
SoftSUSY:计算SUSY粒子质量谱和衰变宽度的软件包。
suspect:也是计算SUSY粒子质量谱的软件包。
(4).其他Cuba:进行多维数值积分的软件包。
LanHep:根据拉氏量推导Feynman规则的软件包,可配合comphep/calchep和FeynArts使用。
LHAPDF: PDF的集合,汇聚了很多的PDF,但是稍微更新慢一些。
3 实验物理研究中的国际上常用的软件:在国外呆了几年,对国外实验物理研究组中常用的软件有了一定的了解,在此介绍给大家,希望我们中国至少在硬件上和国际上平齐,至于总的水平还相差很多年也不是一年两年能赶起来的。
1. Labview(数据采集和处理)在实验物理中,很多时候需要做实验,测量各种信号。
Labview 是国际上研究中使用最广泛的数据采集软件之一,主要优点是可以自由编程,非常灵活,而且价格不贵,使用的是图形编程语言,简单易学。
配合NI的数据采集卡,几乎可以满足所有实验室的测量要求。
2. Latex(文字编辑)写科研论文的利器,可以写出精美的科学论文和毕业论文,几乎是国外研究生的必备工具,而且是免费的。
很多科学杂志都接受Latex 的格式的投稿,还有些杂志只接受这种格式。
结合Winedt,在文字编辑方面几乎无往而不利,这个必须购买,好像付15刀就可以多用户使用了。
现在用的最多的是Miktex,可以在网上免费下载,属于Latex2e。
而且加上必要的包,可以处理中文。
3. Origin(曲线)虽然用数据画曲线有许多软件,但是个人认为还是Origin最好用,也比较简单,不用专门学,用几次就熟悉了。
现在一些专门的仪器测量的结果都可以存为数据文件,用Origin可以重新做图,主要是可以做矢量图,不用担心放大缩小的问题。
而且Labview测量的结果都可以用Origin进一步处理,实在是居家必备的科研软件。
4. Photoshop和Illustrator(图像处理)这里图像处理的意思不是让你用这些软件把原始实验图片(如SEM 和TEM)修改成自己想要的图片,而是一些必须的处理。
对于非矢量图片,可以用Photoshop修改尺寸,剪裁等等处理。
Illustrator主要是做矢量图的。
国外好的研究组要求所有的示意图必须是矢量图。
而且在Illustrator中也可以对图片进行排版,存为eps格式,适合Latex调用。
5. Adobe Acrobat这个就不用介绍了,几乎所有的科学杂志上的文章都是这种格式,不过光是reader并不好用,最好是个全版的,可以进行文字编辑,还可以在文章上直接做笔记。
6. Windows office虽然有Latex,但是有的时候也需要office,主要是powerpoint。
其实Latex也可以做,但是个人喜好不同,不要强行要求一致。
个人还是喜欢用ppt,更直观一些。
7. POV-ray这个估计知道的人不多,是一个免费的画三维示意图的软件,主要是免费的,而且功能不少,还可以做简单的动画。
科研上说一张好的示意图抵得上十页文字,确实是有道理的。
而且软件业很容易学,上手能很快。
网上下载的地址很多,现在到版本了,好像也可以用了。
先介绍这么多,还有一些是个人喜欢用的,就不说了。
高能物理中常用的软件包简介:做了几年高能物理之后,深感工作中各种程序包的重要性。
现将本人用过的一干程序包罗列如下,就当是一个小结。
虽然谈不上对每个软件(包)都十分精通,然而抛砖引玉,欢迎各位补充。
2、物理编程:三、化学1 化学软件:1 一些常用的能在PC机上使用的化学类软件(1)化学结构式有关化学结构式编辑的软件市面上非常之多,它们各有所长。
既有商品的,亦有对教育界及家用免费的。
其功能主要是描绘化合物的结构式、化学反应方程式、化工流程图、简单的实验装置图等化学常用的平面图形的绘制。
常见的这类软件有:ChemDraw, ChemWindow, ISIS Draw, ChemSketch等。
前两个为商业软件,有关它们的资料可以查阅各自的网站和,最新版本分别为和。
后两个对教育界及家用为免费软件,可以在它们各自的网站和上下载,最新版本分别为和。
ChemDraw为当前最常用的结构式编辑软件,除了以上所述的一般功能外,其ultra版本还可以预测分子的常见物理化学性质如:熔点、生成热等;对结构按IUPAC原则命名;预测质子及碳13化学位移等。
ChemWindow的一个最突出的特点是与光谱的结合,它的Spectroscopy 版本包括了一个约五万张13C NMR 的数据库(达250兆),因而其预测更加精确;除了根据化合物的结构预测13C NMR化学位移外,还能预测红外图谱、质谱等,更可以读入标准格式的NMR、IR、Raman、UV及色谱图。
这些程序虽然可以画出非常好的二维化学结构,但除了ChemSketch外,要表现出三维的化学结构则十分困难,必须依赖于一些专门的3D软件来实现。
(2)三维结构比较有名的化学三维结构显示与描绘软件有:Chem3D, WebLab Viewer Pro, RasWin, ChemBuilder 3D, ChemSite等,它们都能够以线图(wire frame), 球棍(ball and stick), CPK及丝带(ribbon)等模式显示化合物的三维结构。