单细胞转录组测序及生物信息学分析项目
一、项目内容：
1.单细胞RNA提取及转录组扩增；
2.转录组测序文库制备；
3.转录组测序：每个样品产生不低于4Gb的clean data；
4.测序数据质控；
5.生物信息分析
1)对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads的处理；
2)测序评估（数据比对统计，测序饱和度分析，测序随机性的统计分析，Reads
在参考基因上的分布分析）；
3)鉴定mRNA编码序列：根据已知的蛋白序列和比对的结果，估计出实验中
测到的基因的表达量；
4)差异表达基因GO功能显著性富集分析；
5)差异表达基因Pathway显著性富集分析；
6)蛋白互作网络分析；
7)鉴定已知的lncRNA，并估计表达量丰度；
8)预测新的lncRNA
9)lncRNA表达水平分析：根据不同组之间的表达情况，进行差异表达lncRNA
的分析；
10)lncRNA靶基因预测：
a)预测Cis作用靶基因
b)预测Trans作用靶基因
c)差异LncRNA与靶基因调控网络分析
二、样本数：12个人单细胞样本。