生物分析中探针知识
由于生物大分子中的生命金属离子 如Ca(Ⅱ)、Mg(Ⅱ)、Zn(Ⅱ)等,具有惰性气 体的电子结构。且在生物体内处在溶液状 态,不成晶体,没有适宜的光、磁信号,也不 可以用X射线技术研究成键状况和结构变 化。而过渡金属离子Cu(Ⅱ)、Fe(Ⅱ)等都 有不成对d电子,有光或磁信号可供研究。 如果将生物大分子中非过渡金属离子用具 有光、磁信息的过渡金属离子置换,用它 们与生物大分子的相互作用与行为来探察 非过渡金属离子的功能,这种技术称为 “离子探针技术”。所用的过渡金属离 子就叫“离子探针”。
6.1.2 分子探针
对于脱氧核糖核酸(DNA)片段检出、医学上的基 因诊断疾病、DNA片段碱基对序列分析和蛋白质的 分离检出等,由于碱基和蛋白质信号很弱,又无上述生 命金属,则须用信号较强的分子以共价键或氢键与生 物大分子连接并赋予生物大分子较强信号,以利于高 灵敏度检测。这种技术称为“分子探针技术”。所用 的有较强信号的分子称为“分子探针”。 例如:四甲基罗丹明、德克萨斯红、1-硝基-4-二 甲氨基苯并恶二唑、4-甲基-7-二乙氨基香豆素、4,5二氨基荧光素等有机物都是较好的分子荧光探针(即 检测信号是分子荧光)。 有机分子探针按结合方式可分为嵌入、衍生、交 联和络合等。
离子探针 K(Ⅰ) Tl(Ⅰ) Zn(Ⅱ) Co(Ⅱ) Mg(Ⅱ) 离子半径(nm) 0.133 0.140 0.069 0.072 0.055 静电位(Z2/r) 0.75 0.67 4.80 4.88 5.12 离子探针 Mn(Ⅱ) Ca(Ⅱ) Gd(Ⅲ) Eu(Ⅲ) Tb(Ⅲ) 离子半径(nm) 0.088 0.099 0.0938 0.095 0.0923 静电位(Z2/r) 4.40 3.78
6.2.4穆兹堡尔谱探针
穆兹堡尔谱探针须采用穆兹堡尔谱仪测定。 它有三个重要参数:化学位移、四极超精细分 裂和兹曼(Zeeman)效应。 (1) 化学位移 它反映最邻近原子的电负性和成键的离子 特征。这和NMR、光电子能谱等的化学位移 的特征有类似之处。 (2) 四极超精细分裂 它主要反映了原子中电荷的分布,判断极性 的大小和方向。
第六章 生物分析中的探针
6.1 离子探针与分子探针概述 6.1.1 离子探针 生命过程是一个非常复杂的过程,研究生物大分子 结构与功能以及生物分子的转化是研究生命过程的一 个重要步骤。生物体中的许多酶和蛋白质就是含金属 离子的生物功能大分子。例如:羧肽酶含Zn、磷酸脂 酶含Mg、Cu和Zn、氨肽酶含Mg和Zn、钙蛋白酶含Ca、 铜蓝蛋白酶含Cu。研究表明,大多数酶都要靠金属离子 表现其活性,而且所有生物功能也都与金属离子有关。 这种金属离子称为“生命金属”。人们可以通过研究 这些生物体中的金属离子来研究生物分子的结构、性 能和功能。
6.2 离子探针基本类型 离子探针按其表达信息的特征可分为紫外可见光吸 收光谱探针、磁共振探针、荧光光谱探针、穆兹堡尔谱 探针。 6.2.1 紫外可见光吸收光谱探针 利用探针离子的d-d或f-f电子跃迁以及荷移跃迁吸)取代碳酸酐酶中的Zn(Ⅱ)后,由吸收光谱的变 化推断出该酶中的Zn(Ⅱ)结合部位是一个变形的四面体。 X射线分析也证实了这一点。 三价稀土离子是优良的Ca(Ⅱ)的吸收光谱探针,尤其 是Nd(Ⅲ),摩尔吸光系数最大,很灵敏。可以用其光谱研 究牛血清蛋白、谷氨酸合成酶、胰蛋白酶、铜蛋白超氧 化酶。之所以有较大的吸收系数是因为配位体较大的不 对称性造成的。
6.2.3荧光光谱探针
荧光光谱探针又可分为有机荧光探 针(即分子荧光探针)和离子荧光探针。探 针离子具有荧光特征,与生物大分子结合 后,其荧光特征,如:激发波长、发射波长、 荧光强度、荧光寿命、荧光量子产率、 各向异性等都会发生变化,从而获得生物 大分子的信息。目前用得最多的是稀土 离子深针。如[Ru(Phen)3(邻菲罗啉)]2+、 [Tb(EDTA)]-。
(2) 生物依据
探针离子置换原金属离子后,生物分子的基 本性质必须不产生变化,也就是说,置换后的生物 大分子的基本活性能被保留,还必须具有特征信 号以供检测,这就是生物依据。例如: a) Mn(Ⅱ)取代苹果酸酶中的Mg(Ⅱ)后,该酶同 样具有催化L-苹果酸脱羧的反应活性。 b) Co(Ⅱ)取代碳酸酐酶、羧肽酶、乳酸脱氢酶 中的Zn(Ⅱ),这些酶的活性分别为原来酶活性的 50%、160%和有活性。 c) Gd(Ⅲ)、Eu(Ⅲ)或Tb(Ⅲ)取代伴刀豆球蛋白 A中的Ca(Ⅱ),该蛋白仍然保持结合糖的的活性。
6.2.2磁共振探针
磁共振探针又可分为核磁共振探针和顺磁共振探 针两种。探针离子置换后,可进行NMR测定,根据化学位 移、偶合常数及与傅里叶变换、二维谱、NMR成象技 术的结合,着重研究1H、15N、31P的NMR谱,它是生物化 学的重要工具之一。用Tl(Ⅰ)取代生命金属K(Ⅰ),研究 205Tl的NMR,是了解K(Ⅰ)的生命功能的重要方法。兔 肌肉丙酮酸激活酶的生命作用就是用此方法进行研究 的。 顺磁共振可测定金属离子中未成对电子形成的磁 性质和磁参数。从而可获得原金属离子的共价键、配 体的性能、金属离子的氧化还原状态、立体化学结构 的信息。
6.1.3 离子探针的生物与化学依据
(1) 化学依据 从配位化学的概念出发,具有惰性气体的电子结构 的离子如Ca(Ⅱ)、Mg(Ⅱ)、Zn(Ⅱ)等,与大分子配体易 形成配合物。因此探针离子应与它们有相同或相似的 物理化学参数。如:离子电荷数、离子半径、化学配 位性质、立体化学行为。Mg(Ⅱ)和Mn(Ⅱ)、Zn(Ⅱ)和 Co(Ⅱ)、Ca(Ⅱ)和Gd(Ⅲ)、Eu(Ⅲ)、Tb(Ⅲ)各自的理化 参数相似,后者可分别做前者的离子探针。参数如下:
生命金属离子 易配位基团 K(Ⅰ) -O-、中性氧配位体 Mg(Ⅱ) 羧酸盐、磷酸盐、氧与氮配位体 Ca(Ⅱ) 羧酸盐、磷酸盐、多齿状氧与氮配位体 Mn(Ⅱ) 羧酸盐、磷酸盐、氧与氮配位体 Fe(Ⅱ) 氮配位体 Fe(Ⅲ) 羧酸基、酪氨酸、卟啉 Cu(Ⅱ) 胺类、硫配体 Cu(Ⅰ) 氮配位体 Zn(Ⅱ) 咪唑、半胱氨酸 Cd(Ⅱ) 半胱氨酸、巯基