配合力的计算

Griffing提出的双列杂交共有4种方法，其中以方法4最常用。

有5个亲本，即p=5,不包括自交和反交，共有组合数10个[a=p(p-1)/2]，完全随机区组设计，3次重复（b=3）。

第一步，离差平方和的计算。

校正值：

C=X2../ab

=30=

总的

St=∑X2ijk-C

=重复

Sb=∑X2..k/a –C

=++/=

一般配合力

Sg=∑X2i../b(p-2)-4X2.../bp(p-2)

=+1672+++992)/45

=特殊配合力

Ss=∑∑X2ij./b-∑./b(p-2)+ 2X2…/b(p-1)(p-2)

=++++432++402+++/3-+1672++1222+992)/9+18=

机误

Se=St-Sb-Sg-Ss

=

父本母本 ⒈ ⒉ 3 4 5

Xi..

Ⅰ Ⅱ Ⅲ Ⅰ Ⅱ Ⅲ Ⅰ Ⅱ Ⅲ Ⅰ Ⅱ Ⅲ Ⅰ Ⅱ Ⅲ 1 10 11 9 11 10

2 13 14 16 19 17 15 13 12 167

3 43 6

4 53 5 7

5 40 99

和

第二步，方差分析

自由度 平方和 均方

重复 b-1=2 Mb=

一般配合力 p-1 Mg=

特殊配合力 p(p-3)/2=5 Ms=

试验误差 (a-1)(b-1)=18 Me=

第三步，遗传参数估算

σ2g =(Mg-Ms)/b(p-2)=

σ2s =(Ms-Me)/b=

两种配合力的相对重要性比较如下：

一般配合力

σ2g /σ2g+σ2s

=+=%

特殊配合力

σ2s /σ2g+σ2s

=+=

一般配合力效应值计算如下： gˆ =(pXi. – 2X..)/p(p-2)

g1 =(5*/15=

g2 =(5*/15=

g3 =(5*/15=

g4 =(5*/15=

g5 =(5*33-196)/15=

特殊配合力效应值计算如下：

Sˆ=Xij –(Xi.+/(p-2)+2X../(p-1)(p-2)

S1*2 = +/3+98/6=

S1*3 = +/3+98/6=

S1*4 = +/3+98/6=

S1*5 = 8-+33)/3+98/6=

S2*3 = +/3+98/6=

S2*4 = +/3+98/6=

S2*5 = +33)/3+98/6=

S3*4 = +/3+98/6=

S3*5 = +33)/3+98/6=

S4*5 = +33)/3+98/6=