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基因组生物信息学 - 复旦大学研究生院

基因组生物信息学
Introduction to Genomics and Bioinformatics
基因组生物信息学是在人类基因组计划完成之后出现的热点研究领域。

本课程是一门创新的课程,通过理论学习与实际操作演示介绍基因组和生物信息学中前沿与常用的知识和工具,使得学生在理论与技能两方面得到培养。

课程内容新颖,紧跟国际最新研究进展与热点,结合应用实例介绍实用的技能。

课程开设目的是让选课学生了解基因组生物信息学的基本概念、掌握基本工具;认识基因组学与日常生活的密切关系,和基因组技术个体化对社会和人们生活方式的深远影响;同时培养兴趣,为该领域吸引跨学科人才。

课程内容包括:基因组学与生物信息学简介,基因组基本理论,人类基因组计划的历史与未来,基因组测序方法与进展,基因组序列注释方法,转录组学简介,比较基因组与进化基因组学简介等。

教学团队的几位教师都是这一领域的专家,其中赵国屏院士是微生物基因组学方面的专家,曾经在抗击SARS的研究中作出突出贡献;周雁教授主持与参与了多个大型基因组研究计划,包括人、水稻、血吸虫等,在基因组与生物信息学方面有着丰富的理论与实践经验。

赵国屏,教授,中科院院士复旦大学
gpzhao@
现任国家人类基因组南方研究中心执行主任,生物芯片上
海国家工程中心主任,复旦大学微生物学与微生物工程系
主任,中国微生物学会理事长。

主要研究方向为微生物基
因组学和生物信息学,进化,代谢调节,合成生物学。

周雁,副教授复旦大学
zhouy@
复旦大学生命科学学院副教授,上海市生物信息学会理事。

主要研究方向为病源与宿主在基因组和表达组水平的相互
作用,及在此过程中相关基因家族及其功能的进化规律。

教师风采
窦同海,博士复旦大学
tonghaidou@
主要研究方向为采用基因组生物信息学,比较基因组学方
法研究基因组进化、基因可变剪接调控。

学分:3学分学时:54学时
基础知识要求:选课学生具有一定的生物学与生物信息学基础,如我校本科《生物信息学》的知识。

上课时间:10月21日– 11月14日
选课网址:
/p/publish/show.html?queryType=set&searchName=paidIn fo.search&projectId=13708
日期星期节次上课内容授课教师
10.21 二5-8 绪论—关于生物学数据分析的思考赵国屏
10.23 五5-8 绪论--基因组学与生物信息学简介周雁
10.24 六1-4 基因组学基本理论窦同海
10.24 六5-8 人类基因组计划的历史与未来周雁
10.28 二5-8 生物信息学主要数据库资源介绍窦同海
10.31 五5-8 基因组注释方法介绍周雁
11.1 六1-4 基因组测序方法与进展窦同海
11.1 六5-8 转录组学简介及数据分析周雁
11.4 二5-8 比较基因组与进化基因组学简介周雁
11.7 五5-8 进化树分析实例介绍窦同海
11.8 六1-4 我们身边的微生物基因组任双喜
11.8 六5-8 答疑(主要数据库、基因组测序方法、转录组分析、
进化树分析部分)
窦同海
11.11 二5-8 答疑(绪论、基因组基本理论、人类基因组计划、基
因组注释、比较基因组与进化基因组部分)
周雁
11.14 五5-8 考试
课程设置。

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