基因组学和生物信息学
Jonathan Pevsner著, 孙之荣主译,化学 工业出版社,2006; ¥95.00 2.T. A. Brown 基因组3, 科学出版社, 2009 3.探索基因组学、蛋白质组学和生物信息 学(第二版),科学出版社,2007
基因组学作业
选择《基因组学和生物信息学》课程并需要
成绩的学生必需完成2个作业。每个作业50 分。 作业必须在12月底前用email发到 yuanh@.
作业1:基因组学作业
(1)每人指定一篇论文或一个专题; (2)在NCBI、google、scopus、 )制作10分钟左右的ppt(15-20页) 在课堂上汇报。
作业2:生物信息学综合练习
每人选择一个基因,进行以下生物信息学分析: 搜索数据库(GenBank, Homologen;) 下载同源序列; 编辑成为fasta格式; 进行序列比对(CLUSTALX); 计算序列之间的遗传距离(MEGA5); 采用距离法、简约法和最大似然法构建系统树 (MEGA5) ; 分析蛋白质家族特征; 分析蛋白质结构特征。
基因组学和生物信息学 Genomics and Bioinformatics
课程简介
本课程将介绍基因组学和生物信息学的 主要内容。教学内容以理论讲述和计算 机练习并重,旨在让学生了解基因组学 和生物信息学基本理论的基础上,初步 掌握2门学科的常用计算机技能和方法。
本课程主要以学生主动学习为主,教师课堂讲述为辅。主动学习包 括自学课件、查阅研究文献,进行专题综述,练习计算机实际操作 等。
自学内容
教材: (1)杨金水:《基因组学》(第二版) (2)李霞主编:生物信息学 课件: (1)复旦大学杨金水课件(提供) (2)李霞生物信息学课件(提供)
课堂学习主要内容
生物学数据库 基因组浏览器
序列比对
进化分析
序列注释
蛋白质特征分析 蛋白质功能基因组学: